More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0882 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0628  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  62.65 
 
 
576 aa  758    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0882  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  100 
 
 
580 aa  1186    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000293416  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0748  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  59.18 
 
 
586 aa  713    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0615291  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0757  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  58.56 
 
 
571 aa  677    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000017258  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.6 
 
 
400 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  37.7 
 
 
787 aa  395  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  37.74 
 
 
791 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  36.82 
 
 
794 aa  388  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  38.77 
 
 
793 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  37.83 
 
 
792 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1442  NADH dehydrogenase subunit D  47.29 
 
 
408 aa  376  1e-103  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.331272  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.5 
 
 
411 aa  377  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1357  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  37.23 
 
 
587 aa  370  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  44.82 
 
 
417 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  44.82 
 
 
417 aa  370  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.74 
 
 
390 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  45.36 
 
 
397 aa  370  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1747  NADH dehydrogenase subunit D  45.24 
 
 
408 aa  367  1e-100  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  37.77 
 
 
794 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  44 
 
 
417 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1762  NADH dehydrogenase subunit D  45.39 
 
 
417 aa  368  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1927  NADH dehydrogenase subunit D  45.24 
 
 
408 aa  365  1e-99  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.371072  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2833  NADH dehydrogenase subunit D  46.02 
 
 
417 aa  364  2e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1561  NADH dehydrogenase subunit D  44.99 
 
 
408 aa  364  2e-99  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0422295  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  37.41 
 
 
794 aa  362  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1504  NADH dehydrogenase subunit D  43.45 
 
 
417 aa  362  1e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00434712 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2702  NADH dehydrogenase subunit D  45.3 
 
 
417 aa  361  2e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1967  NADH dehydrogenase subunit D  44.66 
 
 
417 aa  361  2e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0788296 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2155  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.51 
 
 
441 aa  360  3e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0548  NADH dehydrogenase subunit D  44.31 
 
 
424 aa  360  4e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.899987  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1526  NADH dehydrogenase subunit D  43.7 
 
 
409 aa  359  6e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.013165  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.99 
 
 
404 aa  359  8e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  43.69 
 
 
417 aa  359  8e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0483  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.73 
 
 
426 aa  359  9.999999999999999e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0243  NADH dehydrogenase subunit D  43.2 
 
 
435 aa  358  9.999999999999999e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.5 
 
 
417 aa  358  9.999999999999999e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.39 
 
 
401 aa  359  9.999999999999999e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  43.2 
 
 
417 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  42.58 
 
 
417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  42.58 
 
 
417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1125  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  35.89 
 
 
593 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.64928  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0272  NADH dehydrogenase subunit D  43.2 
 
 
435 aa  357  2.9999999999999997e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  43.07 
 
 
417 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1615  NADH dehydrogenase subunit D  45.01 
 
 
417 aa  357  5e-97  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0833647  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.67 
 
 
389 aa  356  5e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0989  NADH dehydrogenase subunit D  44.9 
 
 
417 aa  356  5.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1406  NADH dehydrogenase subunit D  43.2 
 
 
417 aa  356  6.999999999999999e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.08 
 
 
422 aa  356  6.999999999999999e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2059  NADH dehydrogenase subunit D  43.8 
 
 
417 aa  356  7.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102892  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1961  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.17 
 
 
417 aa  356  7.999999999999999e-97  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00447389  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.15 
 
 
389 aa  355  1e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3367  NADH dehydrogenase I, C/D subunit  35.37 
 
 
593 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.812668  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1826  NADH dehydrogenase subunit D  43.31 
 
 
417 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1302  NADH dehydrogenase subunit D  43.31 
 
 
417 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1438  NADH dehydrogenase subunit D  43.31 
 
 
417 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  43.31 
 
 
417 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0734  NADH dehydrogenase subunit D  43.31 
 
 
417 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.301756  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  43.45 
 
 
417 aa  355  1e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1133  NADH dehydrogenase subunit D  43.31 
 
 
417 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154075  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  42.82 
 
 
417 aa  355  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0416  NADH dehydrogenase subunit D  43.31 
 
 
417 aa  355  1e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3199  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  35.02 
 
 
593 aa  354  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.415002  normal  0.0311953 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  43.07 
 
 
417 aa  355  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3823  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  36.87 
 
 
580 aa  355  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.203539  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  43.07 
 
 
417 aa  355  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  43.07 
 
 
417 aa  355  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3605  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  35.98 
 
 
594 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  42.58 
 
 
417 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  43.99 
 
 
393 aa  354  2.9999999999999997e-96  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  42.82 
 
 
417 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  42.82 
 
 
417 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1064  NADH dehydrogenase subunit D  43.07 
 
 
417 aa  353  4e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240648  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2006  NADH dehydrogenase subunit D  43.07 
 
 
417 aa  353  4e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000196393  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  44.04 
 
 
417 aa  353  5e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0141  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.44 
 
 
408 aa  353  5e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2828  NADH dehydrogenase subunit D  42.48 
 
 
435 aa  353  5.9999999999999994e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  42.82 
 
 
417 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2562  NADH dehydrogenase subunit D  42.24 
 
 
417 aa  352  8e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2027  NADH dehydrogenase subunit D  41.57 
 
 
436 aa  352  8e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127355  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01290  NADH dehydrogenase subunit D  42.48 
 
 
435 aa  352  1e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191542  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0952  NADH dehydrogenase subunit D  42.51 
 
 
417 aa  352  1e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.597503 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2414  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  35.19 
 
 
593 aa  352  1e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0246987  normal  0.2214 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  42.82 
 
 
417 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0184  NADH dehydrogenase subunit D  42.12 
 
 
408 aa  352  1e-95  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0930  NADH dehydrogenase subunit D  42.09 
 
 
417 aa  352  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156514  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1496  NADH dehydrogenase subunit D  42.96 
 
 
417 aa  350  3e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1662  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.42 
 
 
383 aa  350  4e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2862  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  35.23 
 
 
598 aa  350  5e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.260803  hitchhiker  0.00720367 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2211  NADH dehydrogenase subunit D  42.58 
 
 
417 aa  350  5e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.518232 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1346  NADH dehydrogenase subunit D  42.34 
 
 
417 aa  350  5e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00313693  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1888  NADH dehydrogenase subunit D  42.58 
 
 
417 aa  350  6e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3211  NADH dehydrogenase subunit D  42.58 
 
 
417 aa  350  6e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0159  NADH-quinone oxidoreductase chain c/d  33.8 
 
 
561 aa  349  7e-95  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2575  NADH dehydrogenase subunit D  43.78 
 
 
401 aa  349  9e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0392469  normal  0.134645 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.81 
 
 
390 aa  349  1e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2810  NADH dehydrogenase subunit D  41.5 
 
 
417 aa  348  1e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.299965 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.67 
 
 
390 aa  348  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1396  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  34.56 
 
 
599 aa  348  1e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.200775  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29990  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  34.43 
 
 
593 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4129  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.04 
 
 
396 aa  348  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>