More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0202 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0202  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  100 
 
 
373 aa  763    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1596  NADH dehydrogenase (quinone)  55.53 
 
 
406 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0746  NADH dehydrogenase (quinone)  53.04 
 
 
399 aa  405  1.0000000000000001e-112  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  50.96 
 
 
366 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  50.69 
 
 
367 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.63 
 
 
381 aa  369  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3298  NADH dehydrogenase subunit D  48.21 
 
 
366 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5147  NADH dehydrogenase subunit D  46.56 
 
 
366 aa  363  4e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5388  NADH dehydrogenase subunit D  46.56 
 
 
366 aa  363  4e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9747399999999995e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5539  NADH dehydrogenase subunit D  46.56 
 
 
366 aa  363  4e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.43 
 
 
400 aa  362  6e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5418  NADH dehydrogenase subunit D  46.56 
 
 
366 aa  362  8e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4979  NADH dehydrogenase subunit D  46.56 
 
 
366 aa  361  1e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5532  NADH dehydrogenase subunit D  46.56 
 
 
366 aa  361  1e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277354 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5422  NADH dehydrogenase subunit D  46.56 
 
 
366 aa  360  2e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5473  NADH dehydrogenase subunit D  46.56 
 
 
366 aa  360  2e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4997  NADH dehydrogenase subunit D  46.56 
 
 
366 aa  360  3e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5095  NADH dehydrogenase subunit D  46.28 
 
 
366 aa  360  3e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.5 
 
 
390 aa  359  5e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0980  NADH dehydrogenase subunit D  50 
 
 
371 aa  357  9.999999999999999e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3816  NADH dehydrogenase subunit D  45.18 
 
 
366 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3410  NADH dehydrogenase subunit D  48.35 
 
 
367 aa  356  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.59 
 
 
389 aa  350  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.33 
 
 
389 aa  349  5e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.7 
 
 
390 aa  345  6e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.85 
 
 
390 aa  345  8e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.44 
 
 
401 aa  345  8e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.03 
 
 
411 aa  344  1e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  44.27 
 
 
791 aa  344  1e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3823  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  45.17 
 
 
580 aa  344  1e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.203539  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  47.54 
 
 
367 aa  344  2e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4983  NADH dehydrogenase (quinone)  46.47 
 
 
370 aa  343  4e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173613  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  46.99 
 
 
367 aa  342  5.999999999999999e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.44 
 
 
390 aa  342  9e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  44.53 
 
 
417 aa  342  9e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1125  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  45.81 
 
 
593 aa  341  1e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.64928  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0483  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.53 
 
 
426 aa  340  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1015  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  44.65 
 
 
608 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.390634  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  44.28 
 
 
417 aa  339  4e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  44.28 
 
 
417 aa  339  4e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  44.28 
 
 
417 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  44.28 
 
 
417 aa  339  4e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.72 
 
 
367 aa  338  5.9999999999999996e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1628  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.3 
 
 
369 aa  339  5.9999999999999996e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.963572  normal  0.66391 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  44.02 
 
 
792 aa  338  7e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2155  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.81 
 
 
441 aa  338  7e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1826  NADH dehydrogenase subunit D  44.28 
 
 
417 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0734  NADH dehydrogenase subunit D  44.28 
 
 
417 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.301756  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1438  NADH dehydrogenase subunit D  44.28 
 
 
417 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  44.9 
 
 
794 aa  337  9.999999999999999e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  43.55 
 
 
417 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1302  NADH dehydrogenase subunit D  44.28 
 
 
417 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.27 
 
 
404 aa  338  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0416  NADH dehydrogenase subunit D  44.28 
 
 
417 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  44.28 
 
 
417 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1133  NADH dehydrogenase subunit D  44.28 
 
 
417 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154075  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  44.28 
 
 
417 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  44.04 
 
 
417 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  44.28 
 
 
417 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0748  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  46.25 
 
 
586 aa  337  2.9999999999999997e-91  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0615291  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1064  NADH dehydrogenase subunit D  44.04 
 
 
417 aa  335  7e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240648  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1357  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  45.95 
 
 
587 aa  333  3e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1442  NADH dehydrogenase subunit D  44.44 
 
 
408 aa  333  3e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.331272  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2006  NADH dehydrogenase subunit D  43.31 
 
 
417 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000196393  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2992  NADH dehydrogenase (quinone)  45.95 
 
 
374 aa  332  6e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0989  NADH dehydrogenase subunit D  44.53 
 
 
417 aa  332  7.000000000000001e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0141  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.49 
 
 
408 aa  331  1e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.61 
 
 
414 aa  331  1e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  43.32 
 
 
397 aa  331  1e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2059  NADH dehydrogenase subunit D  43.2 
 
 
417 aa  330  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102892  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  42.34 
 
 
417 aa  330  2e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1504  NADH dehydrogenase subunit D  43.8 
 
 
417 aa  331  2e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00434712 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1406  NADH dehydrogenase subunit D  43.8 
 
 
417 aa  330  3e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1346  NADH dehydrogenase subunit D  42.82 
 
 
417 aa  329  4e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00313693  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  42.75 
 
 
793 aa  329  4e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3211  NADH dehydrogenase subunit D  42.82 
 
 
417 aa  329  6e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0757  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  44.8 
 
 
571 aa  328  7e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000017258  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  43.07 
 
 
417 aa  328  7e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  43.07 
 
 
417 aa  328  7e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1662  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.3 
 
 
383 aa  328  9e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0716  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  44.24 
 
 
601 aa  328  9e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2414  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  44.39 
 
 
593 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0246987  normal  0.2214 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2091  NADH dehydrogenase (quinone)  45.41 
 
 
374 aa  327  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1631  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  46.18 
 
 
358 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1118  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  44.5 
 
 
592 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.374283  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1874  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.62 
 
 
415 aa  326  3e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598165  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0746  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  43.01 
 
 
395 aa  327  3e-88  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.946717 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.5 
 
 
417 aa  326  3e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1019  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  44.53 
 
 
601 aa  326  5e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1048  NADH dehydrogenase subunit D  43.8 
 
 
417 aa  326  5e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  43.55 
 
 
400 aa  324  1e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  42.49 
 
 
794 aa  324  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  42.49 
 
 
794 aa  324  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1614  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.26 
 
 
414 aa  323  2e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1826  NADH dehydrogenase subunit D  41.75 
 
 
412 aa  323  2e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.063533  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1094  NADH dehydrogenase subunit D  43.55 
 
 
417 aa  323  2e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.402289  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0711  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.55 
 
 
417 aa  323  3e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.577358  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0930  NADH dehydrogenase subunit D  43.07 
 
 
417 aa  323  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156514  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  44.65 
 
 
787 aa  323  3e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4497  NADH dehydrogenase (quinone)  45.58 
 
 
385 aa  323  4e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>