More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1596 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1596  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
406 aa  837    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0746  NADH dehydrogenase (quinone)  57.85 
 
 
399 aa  447  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0202  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  55.53 
 
 
373 aa  417  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3298  NADH dehydrogenase subunit D  50 
 
 
366 aa  379  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3410  NADH dehydrogenase subunit D  50.27 
 
 
367 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5147  NADH dehydrogenase subunit D  46.98 
 
 
366 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5539  NADH dehydrogenase subunit D  46.98 
 
 
366 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5388  NADH dehydrogenase subunit D  46.98 
 
 
366 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9747399999999995e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5422  NADH dehydrogenase subunit D  46.98 
 
 
366 aa  355  1e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5473  NADH dehydrogenase subunit D  46.98 
 
 
366 aa  354  1e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3816  NADH dehydrogenase subunit D  45.88 
 
 
366 aa  355  1e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4997  NADH dehydrogenase subunit D  46.98 
 
 
366 aa  353  2e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5532  NADH dehydrogenase subunit D  46.98 
 
 
366 aa  353  2e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277354 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5418  NADH dehydrogenase subunit D  46.98 
 
 
366 aa  354  2e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4979  NADH dehydrogenase subunit D  46.98 
 
 
366 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5095  NADH dehydrogenase subunit D  46.43 
 
 
366 aa  353  4e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  48.91 
 
 
367 aa  349  5e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1628  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.27 
 
 
369 aa  346  5e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.963572  normal  0.66391 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  45.6 
 
 
366 aa  341  1e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2992  NADH dehydrogenase (quinone)  45.41 
 
 
374 aa  335  5.999999999999999e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  47.27 
 
 
367 aa  334  2e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4983  NADH dehydrogenase (quinone)  44.84 
 
 
370 aa  334  2e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173613  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.18 
 
 
381 aa  332  7.000000000000001e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.72 
 
 
367 aa  332  9e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2091  NADH dehydrogenase (quinone)  44.86 
 
 
374 aa  332  1e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  46.17 
 
 
367 aa  329  6e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0980  NADH dehydrogenase subunit D  44.84 
 
 
371 aa  324  1e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.99 
 
 
401 aa  325  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0483  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.44 
 
 
426 aa  323  4e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.07 
 
 
400 aa  322  8e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0964  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  42.56 
 
 
400 aa  321  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0318919  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0746  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  44.03 
 
 
395 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.946717 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0847  NADH dehydrogenase (quinone)  43.34 
 
 
395 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3889  NADH dehydrogenase  41.9 
 
 
394 aa  320  3e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1604  NADH dehydrogenase (quinone)  44.41 
 
 
400 aa  318  7.999999999999999e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1442  NADH dehydrogenase subunit D  44.3 
 
 
408 aa  318  9e-86  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.331272  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.65 
 
 
390 aa  318  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.62 
 
 
390 aa  317  3e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.39 
 
 
390 aa  317  3e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  44.44 
 
 
400 aa  317  3e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.71 
 
 
389 aa  316  5e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  41.49 
 
 
417 aa  315  6e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  41.49 
 
 
417 aa  315  6e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  41.97 
 
 
397 aa  316  6e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.45 
 
 
389 aa  315  8e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  41.49 
 
 
417 aa  315  8e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  43.24 
 
 
400 aa  314  9.999999999999999e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.491402  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.87 
 
 
390 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  41.25 
 
 
417 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1826  NADH dehydrogenase subunit D  41.25 
 
 
417 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1302  NADH dehydrogenase subunit D  41.25 
 
 
417 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1438  NADH dehydrogenase subunit D  41.25 
 
 
417 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0734  NADH dehydrogenase subunit D  41.25 
 
 
417 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.301756  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  41.01 
 
 
417 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1064  NADH dehydrogenase subunit D  41.25 
 
 
417 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240648  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2062  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  40.87 
 
 
394 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1133  NADH dehydrogenase subunit D  41.25 
 
 
417 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154075  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  41.01 
 
 
417 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0416  NADH dehydrogenase subunit D  41.25 
 
 
417 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2036  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  40.87 
 
 
394 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  41.25 
 
 
417 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  41.25 
 
 
417 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1743  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  40.62 
 
 
394 aa  312  6.999999999999999e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.134879  normal  0.321495 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0637  NADH dehydrogenase I, 49 kDa subunit  42.59 
 
 
400 aa  311  1e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.447467  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4815  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  40.87 
 
 
394 aa  311  1e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.86 
 
 
404 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3748  NADH dehydrogenase (quinone)  44.08 
 
 
370 aa  310  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000362019  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1561  NADH dehydrogenase subunit D  41.77 
 
 
408 aa  310  2.9999999999999997e-83  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0422295  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3198  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  40.87 
 
 
394 aa  309  5.9999999999999995e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642861 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1747  NADH dehydrogenase subunit D  41.77 
 
 
408 aa  308  8e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3394  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  40.87 
 
 
394 aa  308  9e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.397939  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  40.59 
 
 
417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.77 
 
 
411 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  40.59 
 
 
417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0352  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  40.1 
 
 
394 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1927  NADH dehydrogenase subunit D  41.77 
 
 
408 aa  307  2.0000000000000002e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.371072  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2059  NADH dehydrogenase subunit D  42.03 
 
 
417 aa  306  3e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102892  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3253  NADH dehydrogenase subunit D  40.38 
 
 
417 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.626895  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0748  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  42.93 
 
 
586 aa  306  6e-82  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0615291  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  39.9 
 
 
417 aa  306  6e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  41.11 
 
 
417 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1496  NADH dehydrogenase subunit D  40.38 
 
 
417 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  41.35 
 
 
417 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27241  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  40.1 
 
 
394 aa  305  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1406  NADH dehydrogenase subunit D  40.77 
 
 
417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  44.02 
 
 
379 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.278436  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  39.85 
 
 
417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02011  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  39.49 
 
 
395 aa  304  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0852756  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  44.02 
 
 
379 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01901  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  40.36 
 
 
394 aa  304  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  39.85 
 
 
417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2574  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  44.02 
 
 
379 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.677679  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02471  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  40.1 
 
 
394 aa  303  5.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1540  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  40.1 
 
 
394 aa  303  5.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0964  NADH dehydrogenase subunit D  41.06 
 
 
417 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389115  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2112  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  40.1 
 
 
394 aa  302  6.000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.11577  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1346  NADH dehydrogenase subunit D  39.81 
 
 
417 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00313693  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  39.61 
 
 
417 aa  302  7.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2432  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  40.36 
 
 
394 aa  302  7.000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0877111  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0930  NADH dehydrogenase subunit D  40.82 
 
 
417 aa  302  7.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156514  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>