More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0352 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_01921  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  78.48 
 
 
395 aa  668    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.132694  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02471  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  79.95 
 
 
394 aa  677    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0352  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  100 
 
 
394 aa  814    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1540  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  79.7 
 
 
394 aa  676    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3198  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  85.28 
 
 
394 aa  723    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642861 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3889  NADH dehydrogenase  85.03 
 
 
394 aa  727    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2112  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  80.96 
 
 
394 aa  680    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.11577  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2432  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  80.96 
 
 
394 aa  677    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0877111  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2036  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  94.16 
 
 
394 aa  780    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0174  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  78.73 
 
 
395 aa  669    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1743  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  83.5 
 
 
394 aa  704    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.134879  normal  0.321495 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2062  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  94.16 
 
 
394 aa  780    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02011  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  78.48 
 
 
395 aa  667    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0852756  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01901  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  78.23 
 
 
395 aa  667    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.468613  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01901  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  80.2 
 
 
394 aa  679    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3394  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  83.25 
 
 
394 aa  705    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.397939  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4815  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  85.53 
 
 
394 aa  728    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27241  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  80.71 
 
 
394 aa  684    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3298  NADH dehydrogenase subunit D  47.8 
 
 
366 aa  358  9e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3410  NADH dehydrogenase subunit D  47.8 
 
 
367 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  48.33 
 
 
367 aa  351  1e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.03 
 
 
401 aa  351  1e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  48.33 
 
 
367 aa  350  2e-95  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  45.48 
 
 
366 aa  350  3e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.05 
 
 
381 aa  349  6e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  45.78 
 
 
793 aa  348  8e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  45.6 
 
 
794 aa  347  3e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  44.7 
 
 
787 aa  346  5e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  46.09 
 
 
397 aa  345  8e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  46.39 
 
 
794 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.3 
 
 
367 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  45.78 
 
 
792 aa  340  2e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  45.88 
 
 
794 aa  340  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.88 
 
 
390 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5095  NADH dehydrogenase subunit D  43.93 
 
 
366 aa  339  5e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0912  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.56 
 
 
403 aa  337  9.999999999999999e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0483  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.88 
 
 
426 aa  337  2.9999999999999997e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  45.76 
 
 
367 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5147  NADH dehydrogenase subunit D  43.93 
 
 
366 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5539  NADH dehydrogenase subunit D  43.93 
 
 
366 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5388  NADH dehydrogenase subunit D  43.93 
 
 
366 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9747399999999995e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4979  NADH dehydrogenase subunit D  43.93 
 
 
366 aa  335  5.999999999999999e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.72 
 
 
417 aa  335  5.999999999999999e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5422  NADH dehydrogenase subunit D  43.67 
 
 
366 aa  335  7e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3816  NADH dehydrogenase subunit D  43.41 
 
 
366 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  45 
 
 
422 aa  335  7.999999999999999e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  43.99 
 
 
791 aa  335  9e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4997  NADH dehydrogenase subunit D  43.67 
 
 
366 aa  334  1e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.48 
 
 
417 aa  335  1e-90  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5532  NADH dehydrogenase subunit D  43.67 
 
 
366 aa  334  1e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277354 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5473  NADH dehydrogenase subunit D  43.67 
 
 
366 aa  335  1e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5418  NADH dehydrogenase subunit D  43.67 
 
 
366 aa  335  1e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.55 
 
 
417 aa  334  1e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1526  NADH dehydrogenase subunit D  45.48 
 
 
409 aa  332  5e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.013165  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1614  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.3 
 
 
414 aa  332  9e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.92 
 
 
414 aa  330  3e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.8 
 
 
404 aa  330  3e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1125  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  42.32 
 
 
593 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.64928  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1628  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.22 
 
 
369 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.963572  normal  0.66391 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.06 
 
 
411 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0716  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  41.81 
 
 
601 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3223  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.8 
 
 
392 aa  327  2.0000000000000001e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0966966  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1118  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  42.07 
 
 
592 aa  326  3e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.374283  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1442  NADH dehydrogenase subunit D  44.96 
 
 
408 aa  326  3e-88  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.331272  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.54 
 
 
400 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1015  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  41.56 
 
 
608 aa  326  5e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.390634  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1357  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  41.81 
 
 
587 aa  325  7e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  43.6 
 
 
417 aa  325  7e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.1 
 
 
389 aa  325  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0184  NADH dehydrogenase subunit D  45.15 
 
 
408 aa  324  2e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  41.43 
 
 
393 aa  323  2e-87  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.07 
 
 
390 aa  323  3e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  41.33 
 
 
393 aa  323  3e-87  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1927  NADH dehydrogenase subunit D  43.26 
 
 
408 aa  323  3e-87  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.371072  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0270  NADH dehydrogenase subunit D  44.17 
 
 
440 aa  323  3e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.877752  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.85 
 
 
389 aa  323  4e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.67 
 
 
390 aa  322  5e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  44.01 
 
 
388 aa  322  6e-87  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.33 
 
 
390 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2992  NADH dehydrogenase (quinone)  42.67 
 
 
374 aa  322  9.999999999999999e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1747  NADH dehydrogenase subunit D  43 
 
 
408 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1874  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.61 
 
 
415 aa  321  1.9999999999999998e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598165  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1561  NADH dehydrogenase subunit D  43 
 
 
408 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0422295  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2091  NADH dehydrogenase (quinone)  42.67 
 
 
374 aa  321  1.9999999999999998e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0746  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  45.04 
 
 
395 aa  319  5e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.946717 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1697  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  42.12 
 
 
595 aa  318  7e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.395952  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1406  NADH dehydrogenase subunit D  41.88 
 
 
417 aa  318  1e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1094  NADH dehydrogenase subunit D  42.65 
 
 
417 aa  318  1e-85  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.402289  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2810  NADH dehydrogenase subunit D  42.34 
 
 
417 aa  318  1e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.299965 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  42.45 
 
 
417 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3823  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  41.09 
 
 
580 aa  318  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.203539  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  42.45 
 
 
417 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  42.89 
 
 
417 aa  317  2e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  42.45 
 
 
417 aa  317  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  43.45 
 
 
417 aa  317  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  42.45 
 
 
417 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  43.15 
 
 
406 aa  317  2e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  41.98 
 
 
417 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1133  NADH dehydrogenase subunit D  41.98 
 
 
417 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154075  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  42.22 
 
 
417 aa  317  3e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>