More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1631 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1631  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  100 
 
 		 358 aa  727    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3298  NADH dehydrogenase subunit D  48.04 
 
 		 366 aa  350  2e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3816  NADH dehydrogenase subunit D  48.17 
 
 		 366 aa  350  3e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5422  NADH dehydrogenase subunit D  46.76 
 
 		 366 aa  344  1e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5388  NADH dehydrogenase subunit D  46.76 
 
 		 366 aa  344  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9747399999999995e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5147  NADH dehydrogenase subunit D  46.76 
 
 		 366 aa  344  2e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5539  NADH dehydrogenase subunit D  46.76 
 
 		 366 aa  344  2e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4979  NADH dehydrogenase subunit D  46.76 
 
 		 366 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5473  NADH dehydrogenase subunit D  46.48 
 
 		 366 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5095  NADH dehydrogenase subunit D  47.04 
 
 		 366 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5418  NADH dehydrogenase subunit D  46.48 
 
 		 366 aa  342  4e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3410  NADH dehydrogenase subunit D  48.04 
 
 		 367 aa  342  5e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4997  NADH dehydrogenase subunit D  46.48 
 
 		 366 aa  342  5e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5532  NADH dehydrogenase subunit D  46.48 
 
 		 366 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277354 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.57 
 
 		 404 aa  338  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  47.06 
 
 		 366 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  46.85 
 
 		 367 aa  335  5.999999999999999e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2992  NADH dehydrogenase (quinone)  45.55 
 
 		 374 aa  335  7.999999999999999e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  46.3 
 
 		 367 aa  333  4e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0746  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  45.78 
 
 		 395 aa  332  9e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.946717 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2091  NADH dehydrogenase (quinone)  44.74 
 
 		 374 aa  331  1e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.65 
 
 		 401 aa  329  4e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1604  NADH dehydrogenase (quinone)  45.41 
 
 		 400 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0202  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  46.18 
 
 		 373 aa  328  9e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  43.23 
 
 		 390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.18 
 
 		 367 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0637  NADH dehydrogenase I, 49 kDa subunit  44.96 
 
 		 400 aa  326  3e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.447467  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  44.96 
 
 		 400 aa  327  3e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.491402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  45.5 
 
 		 400 aa  325  5e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  42.71 
 
 		 388 aa  324  2e-87  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0847  NADH dehydrogenase (quinone)  45.5 
 
 		 395 aa  323  3e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1628  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.81 
 
 		 369 aa  322  9.000000000000001e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.963572  normal  0.66391 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  45.18 
 
 		 367 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.41 
 
 		 381 aa  320  3e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.04 
 
 		 417 aa  318  1e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.52 
 
 		 417 aa  317  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.67 
 
 		 390 aa  317  2e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.26 
 
 		 411 aa  316  4e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0964  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  44.69 
 
 		 400 aa  316  4e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0318919  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2574  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  44.13 
 
 		 379 aa  314  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.677679  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  43.85 
 
 		 379 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.93 
 
 		 390 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  43.85 
 
 		 379 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.278436  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2155  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.97 
 
 		 441 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.86 
 
 		 417 aa  312  4.999999999999999e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0980  NADH dehydrogenase subunit D  43.85 
 
 		 371 aa  310  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.38 
 
 		 389 aa  310  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.12 
 
 		 389 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  42.45 
 
 		 392 aa  308  8e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  41.41 
 
 		 393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1286  NADH dehydrogenase (quinone)  43.77 
 
 		 381 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.511189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4518  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.82 
 
 		 415 aa  306  3e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4983  NADH dehydrogenase (quinone)  43.8 
 
 		 370 aa  306  4.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173613  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.86 
 
 		 390 aa  305  8.000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  41.15 
 
 		 393 aa  305  9.000000000000001e-82  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  41.51 
 
 		 406 aa  304  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3748  NADH dehydrogenase (quinone)  42.74 
 
 		 370 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000362019  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1662  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.71 
 
 		 383 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  41.56 
 
 		 417 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  41.56 
 
 		 417 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  41.46 
 
 		 417 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  41.56 
 
 		 417 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  41.56 
 
 		 417 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0746  NADH dehydrogenase (quinone)  45.61 
 
 		 399 aa  303  3.0000000000000004e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  40.73 
 
 		 417 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  41.32 
 
 		 417 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  40.73 
 
 		 417 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.86 
 
 		 390 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1406  NADH dehydrogenase subunit D  40.59 
 
 		 417 aa  302  6.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  40.88 
 
 		 417 aa  301  9e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  41.56 
 
 		 417 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  41.56 
 
 		 417 aa  300  2e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3223  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.51 
 
 		 392 aa  300  2e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0966966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1496  NADH dehydrogenase subunit D  41.71 
 
 		 417 aa  300  3e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2059  NADH dehydrogenase subunit D  40.24 
 
 		 417 aa  300  4e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102892  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1826  NADH dehydrogenase subunit D  41.08 
 
 		 417 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1302  NADH dehydrogenase subunit D  41.08 
 
 		 417 aa  300  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.56 
 
 		 400 aa  299  4e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1438  NADH dehydrogenase subunit D  41.08 
 
 		 417 aa  300  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0734  NADH dehydrogenase subunit D  41.08 
 
 		 417 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.301756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  41.08 
 
 		 417 aa  300  4e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0416  NADH dehydrogenase subunit D  41.08 
 
 		 417 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1133  NADH dehydrogenase subunit D  41.08 
 
 		 417 aa  300  4e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154075  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3440  NADH dehydrogenase  42.66 
 
 		 392 aa  299  4e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.592652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1064  NADH dehydrogenase subunit D  40.83 
 
 		 417 aa  299  6e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240648  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2575  NADH dehydrogenase subunit D  41.34 
 
 		 401 aa  298  7e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0392469  normal  0.134645 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0270  NADH dehydrogenase subunit D  42.39 
 
 		 440 aa  298  7e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.877752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0398  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.39 
 
 		 446 aa  298  8e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  40.73 
 
 		 417 aa  298  1e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2884  NADH dehydrogenase subunit D  41.09 
 
 		 416 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736243  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6679  NADH dehydrogenase subunit D  39.75 
 
 		 483 aa  297  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  39.12 
 
 		 417 aa  297  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1308  NADH dehydrogenase subunit D  40.1 
 
 		 418 aa  297  2e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4497  NADH dehydrogenase (quinone)  42.38 
 
 		 385 aa  296  3e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1172  NADH dehydrogenase subunit D  40.62 
 
 		 396 aa  295  6e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  39.51 
 
 		 417 aa  295  7e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0964  NADH dehydrogenase subunit D  39.51 
 
 		 417 aa  295  8e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389115  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0512  NADH dehydrogenase I, subunit D  43.43 
 
 		 392 aa  295  8e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  42.04 
 
 		 794 aa  294  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0989  NADH dehydrogenase subunit D  41.08 
 
 		 417 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>