More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0398 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_1547  NADH dehydrogenase subunit D  82.67 
 
 
446 aa  732    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.795023  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4415  NADH dehydrogenase I, D subunit  72.03 
 
 
449 aa  640    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3171  NADH dehydrogenase I, D subunit  75.93 
 
 
426 aa  679    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13169  NADH dehydrogenase subunit D  79.46 
 
 
440 aa  735    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2692  NADH dehydrogenase subunit D  70.57 
 
 
434 aa  642    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0284  NADH dehydrogenase I subunit D  71.95 
 
 
438 aa  656    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1601  NADH dehydrogenase subunit D  82.67 
 
 
446 aa  732    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  70.5 
 
 
441 aa  646    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4484  NADH dehydrogenase subunit D  80.18 
 
 
451 aa  732    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00259323 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1577  NADH dehydrogenase subunit D  82.67 
 
 
446 aa  732    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1882  NADH dehydrogenase subunit D  82.49 
 
 
442 aa  747    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.303191  normal  0.424323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7688  NADH dehydrogenase subunit D  71.17 
 
 
445 aa  651    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450459  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0398  NADH dehydrogenase I, D subunit  100 
 
 
446 aa  915    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0270  NADH dehydrogenase subunit D  73.89 
 
 
440 aa  654    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.877752  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4460  NADH dehydrogenase subunit D  69.61 
 
 
441 aa  631  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0523  NADH dehydrogenase subunit D  69.59 
 
 
446 aa  629  1e-179  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5056  NADH dehydrogenase I, D subunit  69.95 
 
 
431 aa  624  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4555  NADH dehydrogenase I, D subunit  68.68 
 
 
443 aa  624  1e-177  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4062  NADH dehydrogenase subunit D  68.21 
 
 
441 aa  623  1e-177  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.855736  normal  0.069193 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0541  NADH dehydrogenase subunit D  70.3 
 
 
482 aa  619  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.482391  normal  0.20204 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6091  NADH dehydrogenase subunit D  69.12 
 
 
457 aa  620  1e-176  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.489458  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3226  NADH dehydrogenase subunit D  69.03 
 
 
445 aa  610  1e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00372602 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2713  NADH dehydrogenase I, D subunit  66 
 
 
448 aa  607  9.999999999999999e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1277  NADH dehydrogenase I, D subunit  64.57 
 
 
444 aa  604  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.494921  normal  0.687145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6679  NADH dehydrogenase subunit D  63.99 
 
 
483 aa  599  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0977  NADH dehydrogenase subunit D  66.82 
 
 
459 aa  598  1e-170  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07410  NADH dehydrogenase subunit D  64.75 
 
 
450 aa  588  1e-167  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5629  NADH dehydrogenase subunit D  69.58 
 
 
426 aa  587  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0649561 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03190  NADH dehydrogenase subunit D  63.06 
 
 
460 aa  578  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0472  NADH dehydrogenase I, D subunit  65.3 
 
 
447 aa  573  1.0000000000000001e-162  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0542  NADH dehydrogenase subunit D  63.31 
 
 
446 aa  556  1e-157  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502265  normal  0.442373 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  52.71 
 
 
417 aa  433  1e-120  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  52.83 
 
 
417 aa  431  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  52.64 
 
 
417 aa  431  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  51.35 
 
 
411 aa  424  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0912  NADH dehydrogenase I, D subunit  51.24 
 
 
403 aa  402  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.1 
 
 
422 aa  398  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.78 
 
 
390 aa  391  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.31 
 
 
390 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.07 
 
 
389 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1874  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.79 
 
 
415 aa  385  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598165  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.81 
 
 
414 aa  379  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.58 
 
 
389 aa  379  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1152  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.73 
 
 
413 aa  375  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.4 
 
 
401 aa  378  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3331  NADH dehydrogenase subunit D  46.13 
 
 
416 aa  376  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150101  normal  0.101451 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.93 
 
 
390 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.94 
 
 
390 aa  370  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  46.88 
 
 
388 aa  372  1e-101  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  43.73 
 
 
390 aa  366  1e-100  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  44.69 
 
 
406 aa  362  6e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  43.09 
 
 
417 aa  360  3e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  43.33 
 
 
417 aa  360  3e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  43.56 
 
 
417 aa  360  3e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  43.56 
 
 
417 aa  360  3e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  43.09 
 
 
417 aa  360  3e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  44.28 
 
 
393 aa  359  4e-98  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  44.03 
 
 
393 aa  359  7e-98  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02414  hypothetical protein similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  44.75 
 
 
475 aa  358  8e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151267 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  43.79 
 
 
417 aa  358  9.999999999999999e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  43.56 
 
 
417 aa  358  9.999999999999999e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  43.56 
 
 
397 aa  358  9.999999999999999e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  44.25 
 
 
392 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  43.56 
 
 
417 aa  356  5e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.3 
 
 
404 aa  355  7.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3253  NADH dehydrogenase subunit D  42.39 
 
 
417 aa  354  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.626895  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1025  NADH dehydrogenase subunit D  44.8 
 
 
396 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01290  NADH dehydrogenase subunit D  42.92 
 
 
435 aa  353  4e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191542  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4129  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.81 
 
 
396 aa  353  4e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1496  NADH dehydrogenase subunit D  42.15 
 
 
417 aa  352  7e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  42.15 
 
 
417 aa  352  8.999999999999999e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2059  NADH dehydrogenase subunit D  42.15 
 
 
417 aa  351  1e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102892  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0711  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.78 
 
 
417 aa  351  1e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.577358  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2810  NADH dehydrogenase subunit D  42.62 
 
 
417 aa  350  2e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.299965 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  41.92 
 
 
417 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.42 
 
 
400 aa  351  2e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1961  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.33 
 
 
417 aa  350  3e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00447389  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  41.92 
 
 
417 aa  350  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  42.86 
 
 
417 aa  350  3e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1504  NADH dehydrogenase subunit D  42.39 
 
 
417 aa  350  3e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00434712 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  41.92 
 
 
417 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  41.92 
 
 
417 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  41.92 
 
 
417 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0272  NADH dehydrogenase subunit D  43.79 
 
 
435 aa  350  4e-95  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0243  NADH dehydrogenase subunit D  43.79 
 
 
435 aa  349  5e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0548  NADH dehydrogenase subunit D  43.43 
 
 
424 aa  349  6e-95  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.899987  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  41.69 
 
 
417 aa  349  6e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  42.39 
 
 
417 aa  349  6e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3507  NADH dehydrogenase subunit D  42.15 
 
 
417 aa  348  8e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4393  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.06 
 
 
396 aa  348  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0182447  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2027  NADH dehydrogenase subunit D  42.52 
 
 
436 aa  348  1e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127355  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  41.92 
 
 
417 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1406  NADH dehydrogenase subunit D  41.69 
 
 
417 aa  348  2e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1967  NADH dehydrogenase subunit D  42.86 
 
 
417 aa  347  2e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0788296 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1615  NADH dehydrogenase subunit D  43.43 
 
 
417 aa  347  3e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0833647  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2420  NADH dehydrogenase subunit D  45.3 
 
 
396 aa  345  6e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0952  NADH dehydrogenase subunit D  43.59 
 
 
417 aa  345  7e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.597503 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0964  NADH dehydrogenase subunit D  41.22 
 
 
417 aa  345  7e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389115  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1016  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.81 
 
 
396 aa  345  7e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3297  NADH dehydrogenase subunit D  44.83 
 
 
402 aa  345  7e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>