More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0366 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  100 
 
 		 417 aa  850    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03190  NADH dehydrogenase subunit D  51.87 
 
 		 460 aa  459  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  52.17 
 
 		 417 aa  449  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0541  NADH dehydrogenase subunit D  52.81 
 
 		 482 aa  449  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.482391  normal  0.20204 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  52.42 
 
 		 417 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4460  NADH dehydrogenase subunit D  52.84 
 
 		 441 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0977  NADH dehydrogenase subunit D  53.07 
 
 		 459 aa  444  1e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6091  NADH dehydrogenase subunit D  52.32 
 
 		 457 aa  444  1e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.489458  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0270  NADH dehydrogenase subunit D  51.98 
 
 		 440 aa  441  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.877752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4062  NADH dehydrogenase subunit D  52.35 
 
 		 441 aa  438  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.855736  normal  0.069193 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1277  NADH dehydrogenase I, D subunit  52.23 
 
 		 444 aa  440  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.494921  normal  0.687145 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  53.75 
 
 		 401 aa  437  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  52.44 
 
 		 411 aa  432  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0398  NADH dehydrogenase I, D subunit  52.71 
 
 		 446 aa  433  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4555  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.72 
 
 		 443 aa  431  1e-119  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  50 
 
 		 406 aa  426  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2692  NADH dehydrogenase subunit D  51.97 
 
 		 434 aa  426  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0284  NADH dehydrogenase I subunit D  50.48 
 
 		 438 aa  427  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6679  NADH dehydrogenase subunit D  51.36 
 
 		 483 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1882  NADH dehydrogenase subunit D  50.73 
 
 		 442 aa  420  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.303191  normal  0.424323 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5056  NADH dehydrogenase I, D subunit  51.24 
 
 		 431 aa  420  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13169  NADH dehydrogenase subunit D  51.09 
 
 		 440 aa  420  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.23 
 
 		 422 aa  416  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0523  NADH dehydrogenase subunit D  48.93 
 
 		 446 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1547  NADH dehydrogenase subunit D  50.74 
 
 		 446 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.795023  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1601  NADH dehydrogenase subunit D  50.74 
 
 		 446 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1577  NADH dehydrogenase subunit D  50.74 
 
 		 446 aa  414  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02414  hypothetical protein similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  50 
 
 		 475 aa  411  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151267 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02730  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  48.46 
 
 		 452 aa  409  1e-113  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3226  NADH dehydrogenase subunit D  50.49 
 
 		 445 aa  408  1e-113  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00372602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7688  NADH dehydrogenase subunit D  50.74 
 
 		 445 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  47.12 
 
 		 388 aa  408  1e-113  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4484  NADH dehydrogenase subunit D  50.24 
 
 		 451 aa  409  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00259323 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.18 
 
 		 390 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  47.4 
 
 		 390 aa  407  1.0000000000000001e-112  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.58 
 
 		 390 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3171  NADH dehydrogenase I, D subunit  50.99 
 
 		 426 aa  407  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4415  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.53 
 
 		 449 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  47.82 
 
 		 441 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.3 
 
 		 400 aa  402  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.66 
 
 		 390 aa  403  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.44 
 
 		 390 aa  403  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4393  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.22 
 
 		 396 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0182447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0243  NADH dehydrogenase subunit D  45.48 
 
 		 435 aa  399  9.999999999999999e-111  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  46.21 
 
 		 417 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3331  NADH dehydrogenase subunit D  47.93 
 
 		 416 aa  399  9.999999999999999e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150101  normal  0.101451 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  46.94 
 
 		 417 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4129  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.19 
 
 		 396 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  47.43 
 
 		 417 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  47.19 
 
 		 417 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.16 
 
 		 389 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  47.43 
 
 		 417 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0272  NADH dehydrogenase subunit D  45.23 
 
 		 435 aa  397  1e-109  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68160  NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor  48.43 
 
 		 474 aa  397  1e-109  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  46.94 
 
 		 417 aa  397  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4560  NADH dehydrogenase subunit D  48.45 
 
 		 398 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17714 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1504  NADH dehydrogenase subunit D  46.7 
 
 		 417 aa  395  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00434712 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  46.45 
 
 		 417 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01290  NADH dehydrogenase subunit D  46.7 
 
 		 435 aa  396  1e-109  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191542  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2713  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.39 
 
 		 448 aa  398  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  48.17 
 
 		 392 aa  396  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  46.35 
 
 		 393 aa  397  1e-109  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3223  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.17 
 
 		 392 aa  396  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0966966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.91 
 
 		 389 aa  398  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1262  NADH dehydrogenase subunit D  49.22 
 
 		 396 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  46.45 
 
 		 417 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  46.45 
 
 		 417 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  46.45 
 
 		 417 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2057  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.67 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.320233  normal  0.342596 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4630  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.92 
 
 		 402 aa  393  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.193494 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  46.21 
 
 		 417 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2833  NADH dehydrogenase subunit D  46.45 
 
 		 417 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0542  NADH dehydrogenase subunit D  48.16 
 
 		 446 aa  394  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502265  normal  0.442373 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0952  NADH dehydrogenase subunit D  46.45 
 
 		 417 aa  393  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.597503 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  45.57 
 
 		 393 aa  392  1e-108  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2828  NADH dehydrogenase subunit D  45.72 
 
 		 435 aa  392  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1406  NADH dehydrogenase subunit D  45.97 
 
 		 417 aa  394  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  47.94 
 
 		 417 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1094  NADH dehydrogenase subunit D  47.19 
 
 		 417 aa  393  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.402289  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1152  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.48 
 
 		 413 aa  394  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  46.21 
 
 		 417 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1354  NADH dehydrogenase subunit D  48.7 
 
 		 396 aa  395  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.937388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  47.94 
 
 		 417 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1025  NADH dehydrogenase subunit D  48.45 
 
 		 396 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  46.21 
 
 		 417 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1016  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.19 
 
 		 396 aa  394  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  46.6 
 
 		 397 aa  392  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1302  NADH dehydrogenase subunit D  45.48 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1826  NADH dehydrogenase subunit D  45.48 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1715  NADH dehydrogenase subunit D  48.19 
 
 		 396 aa  388  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  45.72 
 
 		 417 aa  391  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  45.48 
 
 		 417 aa  391  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0416  NADH dehydrogenase subunit D  45.48 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  45.48 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1133  NADH dehydrogenase subunit D  45.48 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154075  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0734  NADH dehydrogenase subunit D  45.48 
 
 		 417 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.301756  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.84 
 
 		 381 aa  388  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0912  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.96 
 
 		 403 aa  390  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1211  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.41 
 
 		 396 aa  390  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0472  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.71 
 
 		 447 aa  389  1e-107  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>