More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3440 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9168  NADH dehydrogenase (quinone)  87.72 
 
 
398 aa  693    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4497  NADH dehydrogenase (quinone)  83.55 
 
 
385 aa  658    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3440  NADH dehydrogenase  100 
 
 
392 aa  788    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.592652  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8417  NADH dehydrogenase (quinone)  79.38 
 
 
390 aa  629  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4721  NADH dehydrogenase (quinone)  74.74 
 
 
385 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000278675 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4286  NADH dehydrogenase (quinone)  75.26 
 
 
388 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.145773  normal  0.872647 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0095  NADH dehydrogenase (quinone)  72.66 
 
 
378 aa  573  1.0000000000000001e-162  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0320  NADH dehydrogenase (quinone)  53.52 
 
 
358 aa  385  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00131388  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3410  NADH dehydrogenase subunit D  45.65 
 
 
367 aa  333  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3298  NADH dehydrogenase subunit D  43.99 
 
 
366 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.73 
 
 
404 aa  318  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5422  NADH dehydrogenase subunit D  41.21 
 
 
366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5147  NADH dehydrogenase subunit D  41.21 
 
 
366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4979  NADH dehydrogenase subunit D  41.21 
 
 
366 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4997  NADH dehydrogenase subunit D  41.21 
 
 
366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5388  NADH dehydrogenase subunit D  41.21 
 
 
366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9747399999999995e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5539  NADH dehydrogenase subunit D  41.21 
 
 
366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5473  NADH dehydrogenase subunit D  41.21 
 
 
366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  42.35 
 
 
367 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5418  NADH dehydrogenase subunit D  41.21 
 
 
366 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5532  NADH dehydrogenase subunit D  41.21 
 
 
366 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277354 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3816  NADH dehydrogenase subunit D  40.93 
 
 
366 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5095  NADH dehydrogenase subunit D  41.76 
 
 
366 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.62 
 
 
401 aa  308  8e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0202  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  42.82 
 
 
373 aa  306  5.0000000000000004e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0637  NADH dehydrogenase I, 49 kDa subunit  40.8 
 
 
400 aa  302  5.000000000000001e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.447467  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0912  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.6 
 
 
403 aa  302  7.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.33 
 
 
389 aa  301  1e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  40.71 
 
 
366 aa  301  2e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.07 
 
 
389 aa  300  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0184  NADH dehydrogenase subunit D  38.24 
 
 
408 aa  300  4e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1631  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  42.66 
 
 
358 aa  299  5e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0746  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  40.8 
 
 
395 aa  298  1e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.946717 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  39.21 
 
 
792 aa  297  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.33 
 
 
381 aa  297  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0964  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  41.69 
 
 
400 aa  295  7e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0318919  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  39.8 
 
 
400 aa  295  7e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.491402  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0847  NADH dehydrogenase (quinone)  40.63 
 
 
395 aa  295  1e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  40.53 
 
 
400 aa  294  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1604  NADH dehydrogenase (quinone)  39.2 
 
 
400 aa  293  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  40.05 
 
 
793 aa  291  9e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.9 
 
 
390 aa  291  1e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  37.97 
 
 
791 aa  291  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.26 
 
 
390 aa  291  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0980  NADH dehydrogenase subunit D  40.54 
 
 
371 aa  291  2e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.49 
 
 
411 aa  290  3e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  41.3 
 
 
367 aa  290  4e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  38.16 
 
 
794 aa  290  4e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  40.05 
 
 
794 aa  290  4e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.41 
 
 
390 aa  289  6e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3859  NADH dehydrogenase (quinone)  37.75 
 
 
420 aa  288  8e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.49 
 
 
367 aa  287  2e-76  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  38.87 
 
 
417 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  40.76 
 
 
367 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.14 
 
 
417 aa  286  4e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0757  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  39.63 
 
 
571 aa  286  5e-76  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000017258  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0483  NADH dehydrogenase I, D subunit  37.85 
 
 
426 aa  286  5.999999999999999e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3394  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  37.78 
 
 
394 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.397939  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  38.87 
 
 
390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3198  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  38.93 
 
 
394 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642861 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  38.82 
 
 
417 aa  283  5.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1442  NADH dehydrogenase subunit D  37.82 
 
 
408 aa  282  6.000000000000001e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.331272  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01901  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  38.07 
 
 
394 aa  282  9e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0352  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  38.68 
 
 
394 aa  280  2e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  38.44 
 
 
414 aa  280  3e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02011  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  36.96 
 
 
395 aa  280  4e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0852756  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2062  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  38.42 
 
 
394 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1874  NADH dehydrogenase I, D subunit  38.23 
 
 
415 aa  280  4e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598165  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2036  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  38.42 
 
 
394 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02414  hypothetical protein similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  36.67 
 
 
475 aa  279  6e-74  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151267 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  40.47 
 
 
794 aa  279  6e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1743  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  37.31 
 
 
394 aa  279  6e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.134879  normal  0.321495 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0628  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  37.11 
 
 
576 aa  279  8e-74  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0174  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  36.71 
 
 
395 aa  278  8e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01901  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  36.71 
 
 
395 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.468613  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3889  NADH dehydrogenase  38.21 
 
 
394 aa  278  1e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01921  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  36.71 
 
 
395 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.132694  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1614  NADH dehydrogenase I, D subunit  38.3 
 
 
414 aa  278  2e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1015  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  37.19 
 
 
608 aa  277  2e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.390634  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27241  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  38.21 
 
 
394 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0882  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  37.47 
 
 
580 aa  276  4e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000293416  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  37.22 
 
 
400 aa  276  4e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4815  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  36.67 
 
 
394 aa  276  4e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0102  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  37.94 
 
 
580 aa  276  6e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  37.53 
 
 
417 aa  276  6e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0977  NADH dehydrogenase subunit D  37.78 
 
 
459 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1927  NADH dehydrogenase subunit D  35.46 
 
 
408 aa  275  1.0000000000000001e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.371072  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1561  NADH dehydrogenase subunit D  35.46 
 
 
408 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0422295  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2992  NADH dehydrogenase (quinone)  39.14 
 
 
374 aa  274  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1747  NADH dehydrogenase subunit D  35.46 
 
 
408 aa  273  5.000000000000001e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0711  NADH dehydrogenase I, D subunit  38.01 
 
 
417 aa  273  5.000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.577358  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2112  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  37.31 
 
 
394 aa  273  5.000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.11577  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1738  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  37.44 
 
 
580 aa  272  6e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.124678  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1118  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  37.08 
 
 
592 aa  272  6e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.374283  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4069  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  37.41 
 
 
581 aa  272  6e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1596  NADH dehydrogenase (quinone)  39.89 
 
 
406 aa  272  6e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  37.44 
 
 
417 aa  272  7e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2091  NADH dehydrogenase (quinone)  38.34 
 
 
374 aa  272  7e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0716  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  37.69 
 
 
601 aa  272  8.000000000000001e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68160  NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor  36.69 
 
 
474 aa  272  9e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>