More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4286 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0095  NADH dehydrogenase (quinone)  83.11 
 
 		 378 aa  653    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4286  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 388 aa  784    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.145773  normal  0.872647 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4721  NADH dehydrogenase (quinone)  96.36 
 
 		 385 aa  734    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000278675 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4497  NADH dehydrogenase (quinone)  77.52 
 
 		 385 aa  617  1e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9168  NADH dehydrogenase (quinone)  76.8 
 
 		 398 aa  609  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3440  NADH dehydrogenase  75.26 
 
 		 392 aa  596  1e-169  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.592652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8417  NADH dehydrogenase (quinone)  74.05 
 
 		 390 aa  593  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0320  NADH dehydrogenase (quinone)  54.76 
 
 		 358 aa  395  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00131388  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3298  NADH dehydrogenase subunit D  43.21 
 
 		 366 aa  318  1e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3410  NADH dehydrogenase subunit D  43.49 
 
 		 367 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.52 
 
 		 404 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  43.02 
 
 		 367 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5147  NADH dehydrogenase subunit D  41.83 
 
 		 366 aa  310  4e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5539  NADH dehydrogenase subunit D  41.83 
 
 		 366 aa  310  4e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5388  NADH dehydrogenase subunit D  41.83 
 
 		 366 aa  310  4e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9747399999999995e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4979  NADH dehydrogenase subunit D  41.83 
 
 		 366 aa  308  8e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5418  NADH dehydrogenase subunit D  41.83 
 
 		 366 aa  308  9e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5532  NADH dehydrogenase subunit D  41.83 
 
 		 366 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277354 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5095  NADH dehydrogenase subunit D  42.38 
 
 		 366 aa  306  3e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5422  NADH dehydrogenase subunit D  41.55 
 
 		 366 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5473  NADH dehydrogenase subunit D  41.55 
 
 		 366 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4997  NADH dehydrogenase subunit D  41.55 
 
 		 366 aa  306  6e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3816  NADH dehydrogenase subunit D  41 
 
 		 366 aa  305  9.000000000000001e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.19 
 
 		 390 aa  301  1e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0202  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  43.21 
 
 		 373 aa  301  1e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  41.27 
 
 		 366 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0637  NADH dehydrogenase I, 49 kDa subunit  42.55 
 
 		 400 aa  297  3e-79  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.447467  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.32 
 
 		 381 aa  296  4e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.9 
 
 		 401 aa  296  4e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.19 
 
 		 389 aa  294  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.03 
 
 		 389 aa  293  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.16 
 
 		 390 aa  293  5e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.67 
 
 		 390 aa  291  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0964  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  42.55 
 
 		 400 aa  291  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0318919  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0746  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  41.89 
 
 		 395 aa  290  3e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.946717 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  42.01 
 
 		 400 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0847  NADH dehydrogenase (quinone)  41.35 
 
 		 395 aa  289  6e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.64 
 
 		 390 aa  288  1e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  38.6 
 
 		 417 aa  288  1e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0184  NADH dehydrogenase subunit D  37.53 
 
 		 408 aa  288  1e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0483  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.44 
 
 		 426 aa  288  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0912  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.41 
 
 		 403 aa  286  5e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  38.02 
 
 		 792 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0980  NADH dehydrogenase subunit D  40.43 
 
 		 371 aa  285  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  40.65 
 
 		 400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.491402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  37.24 
 
 		 791 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1604  NADH dehydrogenase (quinone)  40.11 
 
 		 400 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1631  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  40.83 
 
 		 358 aa  281  9e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  41.71 
 
 		 367 aa  281  2e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1118  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  38.8 
 
 		 592 aa  280  4e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.374283  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  36.17 
 
 		 793 aa  280  4e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  41.6 
 
 		 367 aa  279  7e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0416  NADH dehydrogenase subunit D  37.62 
 
 		 417 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1826  NADH dehydrogenase subunit D  37.62 
 
 		 417 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0734  NADH dehydrogenase subunit D  37.62 
 
 		 417 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.301756  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1438  NADH dehydrogenase subunit D  37.62 
 
 		 417 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1133  NADH dehydrogenase subunit D  37.62 
 
 		 417 aa  278  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154075  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0716  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  38.54 
 
 		 601 aa  277  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1302  NADH dehydrogenase subunit D  37.62 
 
 		 417 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  37.62 
 
 		 417 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3859  NADH dehydrogenase (quinone)  37.84 
 
 		 420 aa  276  4e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  38.02 
 
 		 390 aa  276  5e-73  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.77 
 
 		 367 aa  276  6e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0989  NADH dehydrogenase subunit D  38.11 
 
 		 417 aa  276  7e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1064  NADH dehydrogenase subunit D  37.05 
 
 		 417 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240648  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4069  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  37.17 
 
 		 581 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  37.53 
 
 		 400 aa  273  3e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  36.56 
 
 		 417 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  36.65 
 
 		 417 aa  273  3e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  36.56 
 
 		 417 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  36.56 
 
 		 417 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1442  NADH dehydrogenase subunit D  38.08 
 
 		 408 aa  273  4.0000000000000004e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.331272  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1961  NADH dehydrogenase I, D subunit  37.62 
 
 		 417 aa  273  5.000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00447389  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  36.56 
 
 		 417 aa  272  7e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0141  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.48 
 
 		 408 aa  272  7e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  36.56 
 
 		 417 aa  272  7e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  37.7 
 
 		 388 aa  272  7e-72  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  36.56 
 
 		 417 aa  272  7e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1052  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  40.27 
 
 		 390 aa  272  7e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.718525  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1125  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  37.5 
 
 		 593 aa  271  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.64928  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1015  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  37.63 
 
 		 608 aa  271  1e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.390634  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2562  NADH dehydrogenase subunit D  37.38 
 
 		 417 aa  270  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2155  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.17 
 
 		 441 aa  271  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1614  NADH dehydrogenase I, D subunit  38.01 
 
 		 414 aa  271  2e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1628  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.22 
 
 		 369 aa  271  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.963572  normal  0.66391 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  36.32 
 
 		 417 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  36.79 
 
 		 393 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3409  F420H2 dehydrogenase subunit D  36.86 
 
 		 374 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.170957  normal  0.90197 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1561  NADH dehydrogenase subunit D  36.73 
 
 		 408 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0422295  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  36.89 
 
 		 417 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  36.89 
 
 		 417 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  38.76 
 
 		 411 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3331  NADH dehydrogenase subunit D  37.82 
 
 		 416 aa  270  4e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150101  normal  0.101451 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1747  NADH dehydrogenase subunit D  36.73 
 
 		 408 aa  269  5.9999999999999995e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0548  NADH dehydrogenase subunit D  36.65 
 
 		 424 aa  269  7e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.899987  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2992  NADH dehydrogenase (quinone)  38.48 
 
 		 374 aa  269  7e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0102  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  38.67 
 
 		 580 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  36.17 
 
 		 417 aa  268  1e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1826  NADH dehydrogenase subunit D  35.97 
 
 		 412 aa  268  1e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.063533  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0711  NADH dehydrogenase I, D subunit  37.68 
 
 		 417 aa  268  1e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.577358  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>