More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1052 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1052  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  100 
 
 
390 aa  786    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.718525  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1294  F420H2 dehydrogenase subunit D  59.73 
 
 
374 aa  442  1e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.196635  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3409  F420H2 dehydrogenase subunit D  57.72 
 
 
374 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.170957  normal  0.90197 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3410  NADH dehydrogenase subunit D  45.03 
 
 
367 aa  317  3e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3298  NADH dehydrogenase subunit D  45.03 
 
 
366 aa  316  4e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.96 
 
 
404 aa  311  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  45.78 
 
 
367 aa  311  2e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  45.9 
 
 
366 aa  310  2e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5095  NADH dehydrogenase subunit D  43.37 
 
 
366 aa  306  3e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.96 
 
 
367 aa  305  6e-82  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  44.69 
 
 
367 aa  305  7e-82  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4997  NADH dehydrogenase subunit D  42.82 
 
 
366 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5418  NADH dehydrogenase subunit D  42.82 
 
 
366 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.24 
 
 
381 aa  305  9.000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5422  NADH dehydrogenase subunit D  42.82 
 
 
366 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5147  NADH dehydrogenase subunit D  42.54 
 
 
366 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5473  NADH dehydrogenase subunit D  42.82 
 
 
366 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5388  NADH dehydrogenase subunit D  42.54 
 
 
366 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9747399999999995e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5539  NADH dehydrogenase subunit D  42.54 
 
 
366 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4979  NADH dehydrogenase subunit D  42.54 
 
 
366 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5532  NADH dehydrogenase subunit D  42.54 
 
 
366 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277354 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3816  NADH dehydrogenase subunit D  42.27 
 
 
366 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.62 
 
 
400 aa  297  2e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.2 
 
 
417 aa  296  3e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0202  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  41.67 
 
 
373 aa  293  4e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1631  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  42.78 
 
 
358 aa  288  8e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.95 
 
 
401 aa  288  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3748  NADH dehydrogenase (quinone)  42.54 
 
 
370 aa  288  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000362019  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2155  NADH dehydrogenase I, D subunit  38.72 
 
 
441 aa  287  2e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4497  NADH dehydrogenase (quinone)  39.95 
 
 
385 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1628  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.9 
 
 
369 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.963572  normal  0.66391 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  40.16 
 
 
792 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  39.85 
 
 
791 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.82 
 
 
390 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  41.18 
 
 
400 aa  281  1e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.491402  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  39.9 
 
 
793 aa  280  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1604  NADH dehydrogenase (quinone)  42.13 
 
 
400 aa  280  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  41.78 
 
 
400 aa  279  5e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.82 
 
 
390 aa  278  9e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0637  NADH dehydrogenase I, 49 kDa subunit  41.78 
 
 
400 aa  278  2e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.447467  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  42.5 
 
 
367 aa  276  5e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0847  NADH dehydrogenase (quinone)  41.24 
 
 
395 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  38.7 
 
 
388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0980  NADH dehydrogenase subunit D  40.16 
 
 
371 aa  273  4.0000000000000004e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0964  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  40.7 
 
 
400 aa  272  6e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0318919  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2692  NADH dehydrogenase subunit D  37.92 
 
 
434 aa  272  8.000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0746  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  40.7 
 
 
395 aa  271  1e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.946717 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.54 
 
 
390 aa  271  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.41 
 
 
389 aa  271  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2091  NADH dehydrogenase (quinone)  40.16 
 
 
374 aa  271  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.41 
 
 
389 aa  271  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0882  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  36.78 
 
 
580 aa  271  2e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000293416  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1442  NADH dehydrogenase subunit D  39.44 
 
 
408 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.331272  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6679  NADH dehydrogenase subunit D  37.96 
 
 
483 aa  270  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0631  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  37.69 
 
 
403 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1626  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  37.69 
 
 
403 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3190  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  37.69 
 
 
403 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1526  NADH dehydrogenase subunit D  39.3 
 
 
409 aa  270  4e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.013165  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0270  NADH dehydrogenase subunit D  39.12 
 
 
440 aa  270  4e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.877752  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.55 
 
 
414 aa  269  5e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  38.89 
 
 
441 aa  269  7e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2992  NADH dehydrogenase (quinone)  39.89 
 
 
374 aa  269  7e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.03 
 
 
390 aa  269  8e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8417  NADH dehydrogenase (quinone)  39.73 
 
 
390 aa  268  8.999999999999999e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2574  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  41.02 
 
 
379 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.677679  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4415  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.13 
 
 
449 aa  268  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  40.75 
 
 
379 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1662  NADH dehydrogenase I, D subunit  38.96 
 
 
383 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5056  NADH dehydrogenase I, D subunit  38.16 
 
 
431 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  40.75 
 
 
379 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.278436  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.41 
 
 
411 aa  266  5e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0541  NADH dehydrogenase subunit D  38.39 
 
 
482 aa  266  5.999999999999999e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.482391  normal  0.20204 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1561  NADH dehydrogenase subunit D  38.42 
 
 
408 aa  266  7e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0422295  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4555  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.83 
 
 
443 aa  265  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1927  NADH dehydrogenase subunit D  38.17 
 
 
408 aa  265  1e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.371072  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2344  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  41.02 
 
 
549 aa  264  2e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0095  NADH dehydrogenase (quinone)  38.08 
 
 
378 aa  264  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0977  NADH dehydrogenase subunit D  38.35 
 
 
459 aa  264  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4518  NADH dehydrogenase I, D subunit  38.14 
 
 
415 aa  263  3e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6091  NADH dehydrogenase subunit D  39.27 
 
 
457 aa  263  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.489458  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1277  NADH dehydrogenase I, D subunit  38.18 
 
 
444 aa  263  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.494921  normal  0.687145 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0746  NADH dehydrogenase (quinone)  40.56 
 
 
399 aa  263  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9168  NADH dehydrogenase (quinone)  38.59 
 
 
398 aa  263  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1747  NADH dehydrogenase subunit D  38.17 
 
 
408 aa  263  4.999999999999999e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0284  NADH dehydrogenase I subunit D  38.89 
 
 
438 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0375  NADH dehydrogenase (quinone)  39.1 
 
 
375 aa  262  8e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3253  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  38.85 
 
 
560 aa  262  8.999999999999999e-69  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0184  NADH dehydrogenase subunit D  37.91 
 
 
408 aa  261  1e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  37.53 
 
 
794 aa  261  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3440  NADH dehydrogenase  38.86 
 
 
392 aa  261  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.592652  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4815  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  38.23 
 
 
394 aa  261  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  37.5 
 
 
422 aa  261  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02414  hypothetical protein similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  35.38 
 
 
475 aa  261  2e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151267 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3394  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  39.38 
 
 
394 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.397939  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4983  NADH dehydrogenase (quinone)  40.44 
 
 
370 aa  261  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173613  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  37.79 
 
 
794 aa  260  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0706  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  37.6 
 
 
554 aa  260  3e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0217574  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0704  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  39.1 
 
 
559 aa  259  4e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4286  NADH dehydrogenase (quinone)  40.27 
 
 
388 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.145773  normal  0.872647 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0757  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  38.85 
 
 
571 aa  259  5.0000000000000005e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000017258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>