More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1626 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0631  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  100 
 
 		 403 aa  838    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1626  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  100 
 
 		 403 aa  838    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3190  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  100 
 
 		 403 aa  838    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4518  NADH dehydrogenase I, D subunit  50.86 
 
 		 415 aa  422  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0159  NADH-quinone oxidoreductase chain c/d  46.75 
 
 		 561 aa  399  9.999999999999999e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1382  NADH dehydrogenase (quinone)  46.63 
 
 		 431 aa  388  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.928946  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2567  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  46.89 
 
 		 389 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.786761  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  46.63 
 
 		 431 aa  388  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1293  NADH dehydrogenase (quinone)  45.52 
 
 		 431 aa  387  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.703373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.29 
 
 		 390 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.24 
 
 		 390 aa  368  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.5 
 
 		 390 aa  365  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3859  NADH dehydrogenase (quinone)  44.64 
 
 		 420 aa  365  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  44.42 
 
 		 392 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.46 
 
 		 389 aa  360  2e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.46 
 
 		 389 aa  360  3e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.53 
 
 		 400 aa  359  4e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.8 
 
 		 404 aa  353  2.9999999999999997e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1614  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.97 
 
 		 414 aa  352  4e-96  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0483  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.1 
 
 		 426 aa  353  4e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  42.01 
 
 		 390 aa  351  1e-95  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1442  NADH dehydrogenase subunit D  43.92 
 
 		 408 aa  350  2e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.331272  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.19 
 
 		 390 aa  347  1e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1379  NADH dehydrogenase I chain D  42.97 
 
 		 393 aa  348  1e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0236876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4085  NADH dehydrogenase (quinone)  43.83 
 
 		 408 aa  345  8.999999999999999e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.267024 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  42.34 
 
 		 388 aa  343  2.9999999999999997e-93  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02414  hypothetical protein similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  42.78 
 
 		 475 aa  342  5.999999999999999e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151267 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2300  NADH dehydrogenase subunit D  41.39 
 
 		 403 aa  342  5.999999999999999e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  40.84 
 
 		 393 aa  342  5.999999999999999e-93  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1927  NADH dehydrogenase subunit D  42.08 
 
 		 408 aa  342  7e-93  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.371072  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5101  NADH dehydrogenase (quinone)  42.52 
 
 		 410 aa  342  7e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1308  NADH dehydrogenase subunit D  40.47 
 
 		 418 aa  342  9e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  41.1 
 
 		 393 aa  340  2e-92  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4079  NADH dehydrogenase (quinone)  42.51 
 
 		 404 aa  340  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.294858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7016  NADH dehydrogenase (quinone)  43.23 
 
 		 404 aa  340  2e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2985  NADH dehydrogenase subunit D  41.71 
 
 		 406 aa  341  2e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0128464  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1747  NADH dehydrogenase subunit D  41.83 
 
 		 408 aa  339  5e-92  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.97 
 
 		 417 aa  339  5.9999999999999996e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1526  NADH dehydrogenase subunit D  40.59 
 
 		 409 aa  338  9.999999999999999e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.013165  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.69 
 
 		 401 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1561  NADH dehydrogenase subunit D  41.58 
 
 		 408 aa  337  2.9999999999999997e-91  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0422295  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  41.06 
 
 		 417 aa  335  7e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  41.06 
 
 		 417 aa  335  7e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1243  NADH dehydrogenase (quinone)  42.6 
 
 		 412 aa  335  1e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3297  NADH dehydrogenase subunit D  42.49 
 
 		 402 aa  335  1e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  40.83 
 
 		 417 aa  335  1e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0882  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  42.2 
 
 		 580 aa  333  3e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000293416  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68160  NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor  41.01 
 
 		 474 aa  333  4e-90  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02730  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  39.65 
 
 		 452 aa  330  3e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2155  NADH dehydrogenase I, D subunit  38.58 
 
 		 441 aa  330  3e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3223  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.58 
 
 		 392 aa  329  4e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0966966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0141  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.15 
 
 		 408 aa  329  5.0000000000000004e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  39.79 
 
 		 406 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  38.94 
 
 		 417 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1172  NADH dehydrogenase subunit D  40.97 
 
 		 396 aa  328  1.0000000000000001e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0184  NADH dehydrogenase subunit D  40.2 
 
 		 408 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01290  NADH dehydrogenase subunit D  39.38 
 
 		 435 aa  327  3e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191542  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2884  NADH dehydrogenase subunit D  41.48 
 
 		 416 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736243  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  39.51 
 
 		 417 aa  326  5e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  40 
 
 		 417 aa  325  7e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2833  NADH dehydrogenase subunit D  40.59 
 
 		 417 aa  325  9e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4560  NADH dehydrogenase subunit D  40.15 
 
 		 398 aa  325  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17714 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2562  NADH dehydrogenase subunit D  39.33 
 
 		 417 aa  325  1e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2702  NADH dehydrogenase subunit D  40.34 
 
 		 417 aa  323  2e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1885  NADH dehydrogenase subunit D  40.67 
 
 		 402 aa  324  2e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.634993 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  40.58 
 
 		 397 aa  323  2e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0952  NADH dehydrogenase subunit D  39.33 
 
 		 417 aa  323  3e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.597503 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2575  NADH dehydrogenase subunit D  39.49 
 
 		 401 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0392469  normal  0.134645 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1762  NADH dehydrogenase subunit D  39.61 
 
 		 417 aa  322  7e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1961  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.27 
 
 		 417 aa  322  8e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00447389  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1715  NADH dehydrogenase subunit D  39.9 
 
 		 396 aa  321  9.999999999999999e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1496  NADH dehydrogenase subunit D  37.98 
 
 		 417 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2059  NADH dehydrogenase subunit D  38.22 
 
 		 417 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102892  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0989  NADH dehydrogenase subunit D  39.51 
 
 		 417 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1094  NADH dehydrogenase subunit D  39.02 
 
 		 417 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.402289  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.83 
 
 		 417 aa  320  3e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1262  NADH dehydrogenase subunit D  39.9 
 
 		 396 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  38.7 
 
 		 417 aa  318  7e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4630  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.89 
 
 		 402 aa  319  7e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.193494 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  38.3 
 
 		 366 aa  318  7.999999999999999e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1354  NADH dehydrogenase subunit D  39.9 
 
 		 396 aa  318  9e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.937388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4129  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.64 
 
 		 396 aa  318  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  39.12 
 
 		 417 aa  318  1e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1888  NADH dehydrogenase subunit D  37.74 
 
 		 417 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2211  NADH dehydrogenase subunit D  37.74 
 
 		 417 aa  318  1e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.518232 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1406  NADH dehydrogenase subunit D  38.7 
 
 		 417 aa  318  1e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2404  NADH dehydrogenase subunit D  40.41 
 
 		 396 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00163945 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4555  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.5 
 
 		 443 aa  318  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2027  NADH dehydrogenase subunit D  38.5 
 
 		 436 aa  318  1e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  38.7 
 
 		 417 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  39.12 
 
 		 417 aa  318  1e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  38.7 
 
 		 417 aa  318  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  38.7 
 
 		 417 aa  317  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0964  NADH dehydrogenase subunit D  37.98 
 
 		 417 aa  318  2e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389115  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2218  NADH dehydrogenase subunit D  38.48 
 
 		 402 aa  317  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.714071  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0270  NADH dehydrogenase subunit D  39.75 
 
 		 440 aa  318  2e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.877752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  37.02 
 
 		 417 aa  317  3e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1967  NADH dehydrogenase subunit D  39.36 
 
 		 417 aa  317  3e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0788296 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  38.46 
 
 		 417 aa  316  4e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1025  NADH dehydrogenase subunit D  39.38 
 
 		 396 aa  316  5e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>