More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7016 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7016  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 404 aa  838    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1379  NADH dehydrogenase I chain D  74.09 
 
 		 393 aa  634  1e-180  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0236876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4079  NADH dehydrogenase (quinone)  72.28 
 
 		 404 aa  612  9.999999999999999e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.294858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1243  NADH dehydrogenase (quinone)  70.95 
 
 		 412 aa  605  9.999999999999999e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5101  NADH dehydrogenase (quinone)  68.23 
 
 		 410 aa  603  1.0000000000000001e-171  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4085  NADH dehydrogenase (quinone)  70.53 
 
 		 408 aa  590  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.267024 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4518  NADH dehydrogenase I, D subunit  50.26 
 
 		 415 aa  387  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0159  NADH-quinone oxidoreductase chain c/d  44.01 
 
 		 561 aa  362  9e-99  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.89 
 
 		 400 aa  353  4e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.33 
 
 		 390 aa  350  2e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.96 
 
 		 390 aa  346  5e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.19 
 
 		 389 aa  345  7e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.78 
 
 		 390 aa  344  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.93 
 
 		 389 aa  344  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.53 
 
 		 390 aa  343  4e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0631  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  43.23 
 
 		 403 aa  340  2e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1626  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  43.23 
 
 		 403 aa  340  2e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3190  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  43.23 
 
 		 403 aa  340  2e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3859  NADH dehydrogenase (quinone)  44.7 
 
 		 420 aa  337  1.9999999999999998e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0483  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.13 
 
 		 426 aa  337  2.9999999999999997e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1293  NADH dehydrogenase (quinone)  43.65 
 
 		 431 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.703373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.56 
 
 		 404 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  40 
 
 		 401 aa  335  7.999999999999999e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2155  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.12 
 
 		 441 aa  333  3e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.94 
 
 		 417 aa  331  2e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  43.12 
 
 		 431 aa  329  6e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1382  NADH dehydrogenase (quinone)  43.12 
 
 		 431 aa  329  7e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.928946  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1614  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.04 
 
 		 414 aa  328  1.0000000000000001e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2567  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  42.86 
 
 		 389 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.786761  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1762  NADH dehydrogenase subunit D  40.72 
 
 		 417 aa  326  4.0000000000000003e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  40.31 
 
 		 367 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.45 
 
 		 417 aa  323  3e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0980  NADH dehydrogenase subunit D  41.56 
 
 		 371 aa  323  3e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  40.24 
 
 		 417 aa  322  6e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  40.24 
 
 		 417 aa  322  6e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.69 
 
 		 411 aa  319  5e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1496  NADH dehydrogenase subunit D  39.52 
 
 		 417 aa  318  9e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1874  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.64 
 
 		 415 aa  318  2e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  39.19 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1967  NADH dehydrogenase subunit D  39.71 
 
 		 417 aa  314  9.999999999999999e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0788296 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2702  NADH dehydrogenase subunit D  39.81 
 
 		 417 aa  314  1.9999999999999998e-84  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  40.24 
 
 		 417 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.64 
 
 		 414 aa  314  1.9999999999999998e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  39.28 
 
 		 417 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2833  NADH dehydrogenase subunit D  39.57 
 
 		 417 aa  313  3.9999999999999997e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2562  NADH dehydrogenase subunit D  40.29 
 
 		 417 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  40 
 
 		 397 aa  311  9e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2211  NADH dehydrogenase subunit D  39.27 
 
 		 417 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.518232 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1888  NADH dehydrogenase subunit D  39.27 
 
 		 417 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3253  NADH dehydrogenase subunit D  39.04 
 
 		 417 aa  311  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.626895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  39.04 
 
 		 417 aa  311  2e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  39 
 
 		 417 aa  311  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0882  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  39.95 
 
 		 580 aa  308  8e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000293416  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2059  NADH dehydrogenase subunit D  39.02 
 
 		 417 aa  308  9e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102892  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  37.83 
 
 		 417 aa  308  9e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0989  NADH dehydrogenase subunit D  40.33 
 
 		 417 aa  308  9e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  37.83 
 
 		 417 aa  308  9e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  37.83 
 
 		 417 aa  308  9e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  37.83 
 
 		 417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3507  NADH dehydrogenase subunit D  38.31 
 
 		 417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  39.64 
 
 		 392 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  37.83 
 
 		 417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  39.28 
 
 		 417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0711  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.86 
 
 		 417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.577358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1064  NADH dehydrogenase subunit D  37.83 
 
 		 417 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240648  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1615  NADH dehydrogenase subunit D  39.86 
 
 		 417 aa  307  2.0000000000000002e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0833647  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1346  NADH dehydrogenase subunit D  38.52 
 
 		 417 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00313693  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1133  NADH dehydrogenase subunit D  37.83 
 
 		 417 aa  307  3e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154075  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1302  NADH dehydrogenase subunit D  37.83 
 
 		 417 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1152  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.64 
 
 		 413 aa  306  3e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1826  NADH dehydrogenase subunit D  37.83 
 
 		 417 aa  307  3e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1438  NADH dehydrogenase subunit D  37.83 
 
 		 417 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0734  NADH dehydrogenase subunit D  37.83 
 
 		 417 aa  307  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.301756  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  37.59 
 
 		 417 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3211  NADH dehydrogenase subunit D  38.52 
 
 		 417 aa  306  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  37.83 
 
 		 417 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0416  NADH dehydrogenase subunit D  37.83 
 
 		 417 aa  307  3e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0548  NADH dehydrogenase subunit D  39.86 
 
 		 424 aa  307  3e-82  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.899987  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  37.59 
 
 		 417 aa  306  3e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  37.83 
 
 		 417 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  37.83 
 
 		 417 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1094  NADH dehydrogenase subunit D  39.76 
 
 		 417 aa  305  6e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.402289  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0930  NADH dehydrogenase subunit D  38.01 
 
 		 417 aa  305  7e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  38.07 
 
 		 417 aa  305  7e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1406  NADH dehydrogenase subunit D  38.55 
 
 		 417 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3331  NADH dehydrogenase subunit D  38.42 
 
 		 416 aa  304  1.0000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150101  normal  0.101451 
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  38.92 
 
 		 390 aa  303  2.0000000000000002e-81  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2006  NADH dehydrogenase subunit D  38.31 
 
 		 417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000196393  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1662  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.48 
 
 		 383 aa  302  7.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02414  hypothetical protein similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  39.48 
 
 		 475 aa  301  1e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151267 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1961  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.42 
 
 		 417 aa  301  1e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00447389  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  37.89 
 
 		 422 aa  301  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  38.87 
 
 		 381 aa  301  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01290  NADH dehydrogenase subunit D  37.71 
 
 		 435 aa  300  2e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191542  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1927  NADH dehydrogenase subunit D  38.72 
 
 		 408 aa  300  3e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.371072  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2810  NADH dehydrogenase subunit D  37.59 
 
 		 417 aa  299  7e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.299965 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  38.25 
 
 		 793 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  38.5 
 
 		 406 aa  298  1e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2027  NADH dehydrogenase subunit D  37.98 
 
 		 436 aa  298  1e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0964  NADH dehydrogenase subunit D  38.05 
 
 		 417 aa  297  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>