More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1243 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5101  NADH dehydrogenase (quinone)  76.03 
 
 
410 aa  641    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1379  NADH dehydrogenase I chain D  73.98 
 
 
393 aa  640    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0236876  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1243  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
412 aa  852    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4085  NADH dehydrogenase (quinone)  75.19 
 
 
408 aa  610  1e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.267024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7016  NADH dehydrogenase (quinone)  70.95 
 
 
404 aa  605  9.999999999999999e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650553  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4079  NADH dehydrogenase (quinone)  72.91 
 
 
404 aa  605  9.999999999999999e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.294858  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.39 
 
 
390 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0159  NADH-quinone oxidoreductase chain c/d  44.33 
 
 
561 aa  372  1e-102  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4518  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.04 
 
 
415 aa  375  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.33 
 
 
389 aa  365  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.99 
 
 
390 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.07 
 
 
389 aa  364  1e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.93 
 
 
390 aa  361  1e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.67 
 
 
390 aa  360  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.79 
 
 
400 aa  353  4e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0483  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.65 
 
 
426 aa  350  2e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.56 
 
 
401 aa  342  7e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2155  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.48 
 
 
441 aa  342  8e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2567  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  45.1 
 
 
389 aa  341  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.786761  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1382  NADH dehydrogenase (quinone)  45.1 
 
 
431 aa  338  7e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.928946  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  45.1 
 
 
431 aa  338  8e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1293  NADH dehydrogenase (quinone)  44.96 
 
 
431 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.703373  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0631  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  42.6 
 
 
403 aa  335  1e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1626  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  42.6 
 
 
403 aa  335  1e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3190  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  42.6 
 
 
403 aa  335  1e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3859  NADH dehydrogenase (quinone)  44.96 
 
 
420 aa  333  2e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  42.97 
 
 
367 aa  334  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1614  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.78 
 
 
414 aa  333  2e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.67 
 
 
411 aa  332  6e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.23 
 
 
404 aa  329  4e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.97 
 
 
381 aa  327  3e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0980  NADH dehydrogenase subunit D  41.1 
 
 
371 aa  325  7e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1762  NADH dehydrogenase subunit D  40.59 
 
 
417 aa  321  9.999999999999999e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  40.47 
 
 
397 aa  318  7.999999999999999e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  40.98 
 
 
366 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  41.41 
 
 
406 aa  318  1e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  41.51 
 
 
390 aa  318  2e-85  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  40.93 
 
 
392 aa  316  6e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  38.67 
 
 
422 aa  315  9.999999999999999e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.31 
 
 
417 aa  315  9.999999999999999e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.62 
 
 
414 aa  315  9.999999999999999e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1662  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.99 
 
 
383 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  40.05 
 
 
417 aa  313  4.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.69 
 
 
417 aa  313  4.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  39.95 
 
 
417 aa  312  7.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  39.02 
 
 
417 aa  311  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  39.02 
 
 
417 aa  311  1e-83  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0748  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  40.24 
 
 
586 aa  310  4e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0615291  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1874  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.85 
 
 
415 aa  310  4e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598165  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  40.05 
 
 
794 aa  309  6.999999999999999e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0744  NADH dehydrogenase subunit D  40.31 
 
 
403 aa  309  6.999999999999999e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2562  NADH dehydrogenase subunit D  40 
 
 
417 aa  307  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1442  NADH dehydrogenase subunit D  41.15 
 
 
408 aa  307  2.0000000000000002e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.331272  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2057  NADH dehydrogenase I, D subunit  40 
 
 
396 aa  306  3e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.320233  normal  0.342596 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  39.37 
 
 
417 aa  306  3e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1496  NADH dehydrogenase subunit D  38.26 
 
 
417 aa  306  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  39.23 
 
 
417 aa  306  3e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2833  NADH dehydrogenase subunit D  39.23 
 
 
417 aa  306  4.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1016  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.48 
 
 
396 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1967  NADH dehydrogenase subunit D  38.5 
 
 
417 aa  306  5.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0788296 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3816  NADH dehydrogenase subunit D  40.21 
 
 
366 aa  306  6e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1048  NADH dehydrogenase subunit D  39.23 
 
 
417 aa  305  8.000000000000001e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2702  NADH dehydrogenase subunit D  39.04 
 
 
417 aa  305  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1561  NADH dehydrogenase subunit D  39.84 
 
 
408 aa  305  1.0000000000000001e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0422295  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1211  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.22 
 
 
396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1747  NADH dehydrogenase subunit D  39.84 
 
 
408 aa  304  2.0000000000000002e-81  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1826  NADH dehydrogenase subunit D  38.41 
 
 
417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0416  NADH dehydrogenase subunit D  38.41 
 
 
417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0882  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  38.94 
 
 
580 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000293416  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1438  NADH dehydrogenase subunit D  38.41 
 
 
417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0734  NADH dehydrogenase subunit D  38.41 
 
 
417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.301756  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1302  NADH dehydrogenase subunit D  38.41 
 
 
417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1015  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  39.19 
 
 
608 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.390634  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  40.1 
 
 
388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1082  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.22 
 
 
396 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.129082 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1133  NADH dehydrogenase subunit D  38.41 
 
 
417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154075  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  38.41 
 
 
417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  38.41 
 
 
417 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3331  NADH dehydrogenase subunit D  40.26 
 
 
416 aa  303  3.0000000000000004e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150101  normal  0.101451 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  39.95 
 
 
393 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  38.41 
 
 
417 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  38.41 
 
 
417 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  38.41 
 
 
417 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5418  NADH dehydrogenase subunit D  39.95 
 
 
366 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  38.16 
 
 
417 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5532  NADH dehydrogenase subunit D  39.95 
 
 
366 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277354 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1152  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.28 
 
 
413 aa  302  5.000000000000001e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  38.41 
 
 
417 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0711  NADH dehydrogenase I, D subunit  38.98 
 
 
417 aa  303  5.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.577358  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0202  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  40.67 
 
 
373 aa  303  5.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  37.77 
 
 
417 aa  303  5.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5095  NADH dehydrogenase subunit D  40.21 
 
 
366 aa  302  6.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4979  NADH dehydrogenase subunit D  39.95 
 
 
366 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  38.16 
 
 
417 aa  302  7.000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0824  NADH dehydrogenase subunit D  39.12 
 
 
417 aa  302  8.000000000000001e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5147  NADH dehydrogenase subunit D  39.95 
 
 
366 aa  302  9e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5539  NADH dehydrogenase subunit D  39.95 
 
 
366 aa  302  9e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5388  NADH dehydrogenase subunit D  39.95 
 
 
366 aa  302  9e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9747399999999995e-20 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1064  NADH dehydrogenase subunit D  38.16 
 
 
417 aa  301  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240648  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2575  NADH dehydrogenase subunit D  39.12 
 
 
401 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0392469  normal  0.134645 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>