More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4085 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4085  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 		 408 aa  845    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.267024 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5101  NADH dehydrogenase (quinone)  82.51 
 
 		 410 aa  726    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1379  NADH dehydrogenase I chain D  74.1 
 
 		 393 aa  640    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0236876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1243  NADH dehydrogenase (quinone)  75.19 
 
 		 412 aa  630  1e-179  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4079  NADH dehydrogenase (quinone)  74.29 
 
 		 404 aa  620  1e-176  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.294858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7016  NADH dehydrogenase (quinone)  70.53 
 
 		 404 aa  609  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4518  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.87 
 
 		 415 aa  392  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.27 
 
 		 390 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.91 
 
 		 389 aa  385  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.91 
 
 		 389 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.69 
 
 		 400 aa  383  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.97 
 
 		 390 aa  378  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.27 
 
 		 390 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.71 
 
 		 390 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0159  NADH-quinone oxidoreductase chain c/d  44.3 
 
 		 561 aa  366  1e-100  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2155  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.5 
 
 		 441 aa  362  7.0000000000000005e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0483  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.85 
 
 		 426 aa  359  6e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1382  NADH dehydrogenase (quinone)  46.07 
 
 		 431 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.928946  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  46.07 
 
 		 431 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3859  NADH dehydrogenase (quinone)  45.76 
 
 		 420 aa  357  1.9999999999999998e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2567  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  45.81 
 
 		 389 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.786761  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.29 
 
 		 404 aa  356  5e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0631  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  43.83 
 
 		 403 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1626  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  43.83 
 
 		 403 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3190  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  43.83 
 
 		 403 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1293  NADH dehydrogenase (quinone)  44.59 
 
 		 431 aa  352  7e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.703373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1614  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.7 
 
 		 414 aa  349  6e-95  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.49 
 
 		 401 aa  349  6e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.01 
 
 		 411 aa  343  4e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1762  NADH dehydrogenase subunit D  43.03 
 
 		 417 aa  342  9e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  41.62 
 
 		 397 aa  341  1e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  42.08 
 
 		 367 aa  340  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0980  NADH dehydrogenase subunit D  40.46 
 
 		 371 aa  337  2.9999999999999997e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1662  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.86 
 
 		 383 aa  336  5e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  40.83 
 
 		 406 aa  335  5.999999999999999e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  41.81 
 
 		 417 aa  334  2e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.22 
 
 		 414 aa  333  3e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  42.67 
 
 		 393 aa  333  3e-90  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  41.1 
 
 		 366 aa  331  1e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  41.81 
 
 		 417 aa  331  1e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  40.34 
 
 		 417 aa  330  4e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  40.34 
 
 		 417 aa  330  4e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1874  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.67 
 
 		 415 aa  329  5.0000000000000004e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0548  NADH dehydrogenase subunit D  41.95 
 
 		 424 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.899987  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1615  NADH dehydrogenase subunit D  41.56 
 
 		 417 aa  327  2.0000000000000001e-88  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0833647  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.15 
 
 		 417 aa  327  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  41.99 
 
 		 390 aa  327  3e-88  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2562  NADH dehydrogenase subunit D  41.56 
 
 		 417 aa  327  3e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  41.1 
 
 		 392 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.9 
 
 		 417 aa  326  4.0000000000000003e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.41 
 
 		 381 aa  325  7e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  41.1 
 
 		 393 aa  325  1e-87  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  41.08 
 
 		 417 aa  325  1e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.5 
 
 		 422 aa  324  2e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1961  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.71 
 
 		 417 aa  323  2e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00447389  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  41.08 
 
 		 417 aa  324  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  41.08 
 
 		 417 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1967  NADH dehydrogenase subunit D  40.59 
 
 		 417 aa  323  2e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0788296 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  41.08 
 
 		 417 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3223  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.94 
 
 		 392 aa  323  3e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0966966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1496  NADH dehydrogenase subunit D  39.61 
 
 		 417 aa  323  3e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1152  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.21 
 
 		 413 aa  323  4e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  39.85 
 
 		 417 aa  323  4e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  40.67 
 
 		 794 aa  323  5e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1064  NADH dehydrogenase subunit D  40.83 
 
 		 417 aa  323  5e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240648  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1048  NADH dehydrogenase subunit D  40.34 
 
 		 417 aa  322  6e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0930  NADH dehydrogenase subunit D  39.85 
 
 		 417 aa  322  6e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  41.08 
 
 		 417 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0912  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.25 
 
 		 403 aa  322  8e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  40.83 
 
 		 417 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1826  NADH dehydrogenase subunit D  40.59 
 
 		 417 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2702  NADH dehydrogenase subunit D  40.34 
 
 		 417 aa  322  9.999999999999999e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1438  NADH dehydrogenase subunit D  40.59 
 
 		 417 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0416  NADH dehydrogenase subunit D  40.59 
 
 		 417 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0734  NADH dehydrogenase subunit D  40.59 
 
 		 417 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.301756  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  40.59 
 
 		 417 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1133  NADH dehydrogenase subunit D  40.59 
 
 		 417 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154075  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  40.59 
 
 		 417 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1302  NADH dehydrogenase subunit D  40.59 
 
 		 417 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  40.1 
 
 		 417 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2211  NADH dehydrogenase subunit D  40.34 
 
 		 417 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.518232 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1346  NADH dehydrogenase subunit D  41.08 
 
 		 417 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00313693  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3331  NADH dehydrogenase subunit D  40.05 
 
 		 416 aa  321  1.9999999999999998e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150101  normal  0.101451 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3507  NADH dehydrogenase subunit D  39.85 
 
 		 417 aa  321  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1888  NADH dehydrogenase subunit D  40.34 
 
 		 417 aa  320  3e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2833  NADH dehydrogenase subunit D  40.1 
 
 		 417 aa  319  5e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3211  NADH dehydrogenase subunit D  40.59 
 
 		 417 aa  319  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1738  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  40.46 
 
 		 580 aa  319  5e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.124678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1504  NADH dehydrogenase subunit D  39.85 
 
 		 417 aa  318  1e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00434712 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4129  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.64 
 
 		 396 aa  318  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3297  NADH dehydrogenase subunit D  40.16 
 
 		 402 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  39.06 
 
 		 388 aa  318  1e-85  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2059  NADH dehydrogenase subunit D  40.83 
 
 		 417 aa  317  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102892  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2006  NADH dehydrogenase subunit D  40.1 
 
 		 417 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000196393  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2057  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.16 
 
 		 396 aa  318  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.320233  normal  0.342596 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3253  NADH dehydrogenase subunit D  39.85 
 
 		 417 aa  317  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.626895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  39.36 
 
 		 417 aa  317  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0102  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  40.2 
 
 		 580 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1406  NADH dehydrogenase subunit D  39.12 
 
 		 417 aa  317  3e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  38.39 
 
 		 417 aa  316  4e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>