More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1379 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5101  NADH dehydrogenase (quinone)  75.38 
 
 
410 aa  644    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1243  NADH dehydrogenase (quinone)  73.98 
 
 
412 aa  640    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1379  NADH dehydrogenase I chain D  100 
 
 
393 aa  817    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0236876  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7016  NADH dehydrogenase (quinone)  74.09 
 
 
404 aa  634  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650553  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4085  NADH dehydrogenase (quinone)  74.1 
 
 
408 aa  620  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.267024 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4079  NADH dehydrogenase (quinone)  70.63 
 
 
404 aa  615  1e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.294858  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.39 
 
 
390 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0159  NADH-quinone oxidoreductase chain c/d  45.6 
 
 
561 aa  370  1e-101  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.93 
 
 
389 aa  365  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.86 
 
 
390 aa  363  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.67 
 
 
389 aa  364  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.09 
 
 
390 aa  360  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.86 
 
 
390 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.82 
 
 
400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4518  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.9 
 
 
415 aa  357  1.9999999999999998e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0631  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  42.97 
 
 
403 aa  348  1e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1626  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  42.97 
 
 
403 aa  348  1e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3190  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  42.97 
 
 
403 aa  348  1e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2567  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  44.67 
 
 
389 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.786761  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1382  NADH dehydrogenase (quinone)  44.92 
 
 
431 aa  347  3e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.928946  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  44.92 
 
 
431 aa  346  3e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1293  NADH dehydrogenase (quinone)  44.96 
 
 
431 aa  345  5e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.703373  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.38 
 
 
411 aa  345  8e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3859  NADH dehydrogenase (quinone)  43.4 
 
 
420 aa  344  2e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2155  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.82 
 
 
441 aa  343  4e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.03 
 
 
401 aa  340  2e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0483  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.75 
 
 
426 aa  337  2.9999999999999997e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  43.26 
 
 
367 aa  335  7e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0980  NADH dehydrogenase subunit D  43.75 
 
 
371 aa  334  2e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.89 
 
 
417 aa  333  3e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.62 
 
 
417 aa  332  7.000000000000001e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.86 
 
 
414 aa  329  6e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.69 
 
 
404 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1874  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.79 
 
 
415 aa  328  1.0000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598165  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  41.82 
 
 
366 aa  324  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1614  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.82 
 
 
414 aa  323  3e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  40.82 
 
 
794 aa  321  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1762  NADH dehydrogenase subunit D  39.51 
 
 
417 aa  322  9.999999999999999e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1662  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.23 
 
 
383 aa  318  7.999999999999999e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1496  NADH dehydrogenase subunit D  39.95 
 
 
417 aa  318  7.999999999999999e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  39.47 
 
 
417 aa  318  1e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  39.48 
 
 
397 aa  317  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2562  NADH dehydrogenase subunit D  39.81 
 
 
417 aa  317  3e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.5 
 
 
381 aa  316  5e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1357  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  41.69 
 
 
587 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.32 
 
 
422 aa  315  9.999999999999999e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  38.74 
 
 
417 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1504  NADH dehydrogenase subunit D  38.5 
 
 
417 aa  312  6.999999999999999e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00434712 
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  39.84 
 
 
390 aa  312  7.999999999999999e-84  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  38.5 
 
 
417 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  38.5 
 
 
417 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1015  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  40.89 
 
 
608 aa  311  9e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.390634  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  38.5 
 
 
417 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1346  NADH dehydrogenase subunit D  38.74 
 
 
417 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00313693  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2211  NADH dehydrogenase subunit D  38.74 
 
 
417 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.518232 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  40.31 
 
 
392 aa  311  1e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1888  NADH dehydrogenase subunit D  38.5 
 
 
417 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1826  NADH dehydrogenase subunit D  38.5 
 
 
417 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1133  NADH dehydrogenase subunit D  38.5 
 
 
417 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154075  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1438  NADH dehydrogenase subunit D  38.5 
 
 
417 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1064  NADH dehydrogenase subunit D  38.5 
 
 
417 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240648  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  38.5 
 
 
417 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1302  NADH dehydrogenase subunit D  38.5 
 
 
417 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0734  NADH dehydrogenase subunit D  38.5 
 
 
417 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.301756  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3211  NADH dehydrogenase subunit D  38.5 
 
 
417 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0416  NADH dehydrogenase subunit D  38.5 
 
 
417 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1615  NADH dehydrogenase subunit D  39.81 
 
 
417 aa  310  2.9999999999999997e-83  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0833647  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  38.01 
 
 
417 aa  309  4e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  38.26 
 
 
417 aa  310  4e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0548  NADH dehydrogenase subunit D  39.81 
 
 
424 aa  309  5e-83  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.899987  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  39.23 
 
 
417 aa  309  5.9999999999999995e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  38.54 
 
 
417 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2059  NADH dehydrogenase subunit D  38.74 
 
 
417 aa  308  6.999999999999999e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102892  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  39.23 
 
 
417 aa  309  6.999999999999999e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3507  NADH dehydrogenase subunit D  38.29 
 
 
417 aa  309  6.999999999999999e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  37.77 
 
 
417 aa  308  8e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  38.59 
 
 
417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1406  NADH dehydrogenase subunit D  39.02 
 
 
417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  38.59 
 
 
417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1152  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.31 
 
 
413 aa  307  2.0000000000000002e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2702  NADH dehydrogenase subunit D  38.83 
 
 
417 aa  307  3e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  37.77 
 
 
417 aa  306  3e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3253  NADH dehydrogenase subunit D  37.8 
 
 
417 aa  307  3e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.626895  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  37.77 
 
 
417 aa  306  3e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2833  NADH dehydrogenase subunit D  38.83 
 
 
417 aa  306  4.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5418  NADH dehydrogenase subunit D  41.45 
 
 
366 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1048  NADH dehydrogenase subunit D  38.29 
 
 
417 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4979  NADH dehydrogenase subunit D  41.45 
 
 
366 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3816  NADH dehydrogenase subunit D  40.93 
 
 
366 aa  305  6e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5532  NADH dehydrogenase subunit D  41.45 
 
 
366 aa  306  6e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277354 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5388  NADH dehydrogenase subunit D  41.45 
 
 
366 aa  305  6e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9747399999999995e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5147  NADH dehydrogenase subunit D  41.45 
 
 
366 aa  305  6e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5539  NADH dehydrogenase subunit D  41.45 
 
 
366 aa  305  6e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5095  NADH dehydrogenase subunit D  41.45 
 
 
366 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1125  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  40.1 
 
 
593 aa  305  9.000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.64928  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2006  NADH dehydrogenase subunit D  38.26 
 
 
417 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000196393  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  41.28 
 
 
794 aa  305  9.000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  38.01 
 
 
417 aa  305  9.000000000000001e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5422  NADH dehydrogenase subunit D  41.45 
 
 
366 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  38.26 
 
 
417 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>