More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4079 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_4079  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
404 aa  842    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.294858  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1379  NADH dehydrogenase I chain D  70.63 
 
 
393 aa  615  1e-175  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0236876  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7016  NADH dehydrogenase (quinone)  72.28 
 
 
404 aa  612  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650553  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5101  NADH dehydrogenase (quinone)  73.33 
 
 
410 aa  614  9.999999999999999e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1243  NADH dehydrogenase (quinone)  72.91 
 
 
412 aa  605  9.999999999999999e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4085  NADH dehydrogenase (quinone)  74.29 
 
 
408 aa  600  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.267024 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4518  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.48 
 
 
415 aa  376  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.13 
 
 
390 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.96 
 
 
389 aa  365  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.22 
 
 
389 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.85 
 
 
390 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2155  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.77 
 
 
441 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.47 
 
 
390 aa  355  5e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.33 
 
 
390 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.62 
 
 
400 aa  355  1e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0159  NADH-quinone oxidoreductase chain c/d  43.59 
 
 
561 aa  353  4e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.19 
 
 
401 aa  350  3e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0631  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  42.51 
 
 
403 aa  340  2e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1626  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  42.51 
 
 
403 aa  340  2e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3190  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  42.51 
 
 
403 aa  340  2e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.93 
 
 
404 aa  339  4e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1293  NADH dehydrogenase (quinone)  45.5 
 
 
431 aa  339  5.9999999999999996e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.703373  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3859  NADH dehydrogenase (quinone)  44.1 
 
 
420 aa  333  3e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  44.73 
 
 
431 aa  332  6e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1382  NADH dehydrogenase (quinone)  44.73 
 
 
431 aa  332  6e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.928946  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  42.2 
 
 
367 aa  331  1e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2567  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  44.47 
 
 
389 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.786761  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.28 
 
 
411 aa  328  7e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0483  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.64 
 
 
426 aa  328  9e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  41.69 
 
 
366 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1614  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.49 
 
 
414 aa  325  7e-88  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  41.97 
 
 
392 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.74 
 
 
417 aa  318  7.999999999999999e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  40.24 
 
 
417 aa  317  3e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0980  NADH dehydrogenase subunit D  40.26 
 
 
371 aa  317  3e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  40 
 
 
417 aa  316  5e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  40.24 
 
 
417 aa  316  5e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  40 
 
 
417 aa  316  6e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  40 
 
 
417 aa  316  6e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1874  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.49 
 
 
415 aa  315  7e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598165  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.21 
 
 
417 aa  315  9e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  38.7 
 
 
417 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  40.41 
 
 
390 aa  315  9.999999999999999e-85  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  38.7 
 
 
417 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1346  NADH dehydrogenase subunit D  39.76 
 
 
417 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00313693  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  39.76 
 
 
417 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  38.54 
 
 
417 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1496  NADH dehydrogenase subunit D  39.27 
 
 
417 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3211  NADH dehydrogenase subunit D  39.76 
 
 
417 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  38.54 
 
 
417 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2059  NADH dehydrogenase subunit D  40.24 
 
 
417 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102892  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  39.02 
 
 
417 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3507  NADH dehydrogenase subunit D  39.76 
 
 
417 aa  313  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1406  NADH dehydrogenase subunit D  39.27 
 
 
417 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  39.76 
 
 
417 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  39.51 
 
 
417 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1826  NADH dehydrogenase subunit D  39.27 
 
 
417 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1438  NADH dehydrogenase subunit D  39.27 
 
 
417 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1133  NADH dehydrogenase subunit D  39.27 
 
 
417 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154075  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1302  NADH dehydrogenase subunit D  39.27 
 
 
417 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  39.27 
 
 
417 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0734  NADH dehydrogenase subunit D  39.27 
 
 
417 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.301756  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0416  NADH dehydrogenase subunit D  39.27 
 
 
417 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2562  NADH dehydrogenase subunit D  40.73 
 
 
417 aa  312  7.999999999999999e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1762  NADH dehydrogenase subunit D  40 
 
 
417 aa  311  1e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1504  NADH dehydrogenase subunit D  39.51 
 
 
417 aa  311  1e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00434712 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1064  NADH dehydrogenase subunit D  39.02 
 
 
417 aa  310  2e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240648  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1888  NADH dehydrogenase subunit D  39.27 
 
 
417 aa  310  4e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  41.71 
 
 
393 aa  310  4e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  39.02 
 
 
417 aa  310  4e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2211  NADH dehydrogenase subunit D  39.27 
 
 
417 aa  310  4e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.518232 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2006  NADH dehydrogenase subunit D  39.02 
 
 
417 aa  309  5e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000196393  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3253  NADH dehydrogenase subunit D  39.27 
 
 
417 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.626895  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  38.94 
 
 
381 aa  308  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2810  NADH dehydrogenase subunit D  38.05 
 
 
417 aa  307  2.0000000000000002e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.299965 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  39.02 
 
 
417 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0930  NADH dehydrogenase subunit D  38.74 
 
 
417 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156514  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  39.22 
 
 
397 aa  307  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1357  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  40.62 
 
 
587 aa  305  6e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0989  NADH dehydrogenase subunit D  39.18 
 
 
417 aa  306  6e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02414  hypothetical protein similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  40 
 
 
475 aa  305  8.000000000000001e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151267 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2833  NADH dehydrogenase subunit D  39.51 
 
 
417 aa  305  8.000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1662  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.04 
 
 
383 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3331  NADH dehydrogenase subunit D  39.64 
 
 
416 aa  304  1.0000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150101  normal  0.101451 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  37.47 
 
 
414 aa  305  1.0000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0711  NADH dehydrogenase I, D subunit  38.7 
 
 
417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.577358  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  40.93 
 
 
393 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1125  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  40.1 
 
 
593 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.64928  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1048  NADH dehydrogenase subunit D  39.76 
 
 
417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1615  NADH dehydrogenase subunit D  39.51 
 
 
417 aa  304  2.0000000000000002e-81  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0833647  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0748  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  40.31 
 
 
586 aa  304  2.0000000000000002e-81  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0615291  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0882  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  39.12 
 
 
580 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000293416  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0548  NADH dehydrogenase subunit D  39.51 
 
 
424 aa  303  3.0000000000000004e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.899987  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  38.29 
 
 
417 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1961  NADH dehydrogenase I, D subunit  37.98 
 
 
417 aa  303  5.000000000000001e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00447389  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  40.05 
 
 
794 aa  303  5.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1967  NADH dehydrogenase subunit D  38.54 
 
 
417 aa  303  5.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0788296 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5095  NADH dehydrogenase subunit D  39.9 
 
 
366 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2702  NADH dehydrogenase subunit D  39.02 
 
 
417 aa  302  8.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  38.29 
 
 
417 aa  302  8.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>