More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1277 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6679  NADH dehydrogenase subunit D  70.05 
 
 		 483 aa  639    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6091  NADH dehydrogenase subunit D  70.14 
 
 		 457 aa  635    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.489458  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1277  NADH dehydrogenase I, D subunit  100 
 
 		 444 aa  910    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.494921  normal  0.687145 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4062  NADH dehydrogenase subunit D  77.95 
 
 		 441 aa  728    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.855736  normal  0.069193 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4555  NADH dehydrogenase I, D subunit  72.75 
 
 		 443 aa  680    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4460  NADH dehydrogenase subunit D  77.95 
 
 		 441 aa  730    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0270  NADH dehydrogenase subunit D  69.77 
 
 		 440 aa  640    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.877752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03190  NADH dehydrogenase subunit D  68.66 
 
 		 460 aa  634  1e-180  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0541  NADH dehydrogenase subunit D  69.14 
 
 		 482 aa  624  1e-178  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.482391  normal  0.20204 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0284  NADH dehydrogenase I subunit D  69.44 
 
 		 438 aa  625  1e-178  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4415  NADH dehydrogenase I, D subunit  67.41 
 
 		 449 aa  627  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0977  NADH dehydrogenase subunit D  65.61 
 
 		 459 aa  613  9.999999999999999e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7688  NADH dehydrogenase subunit D  66.37 
 
 		 445 aa  608  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0398  NADH dehydrogenase I, D subunit  64.57 
 
 		 446 aa  604  9.999999999999999e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2692  NADH dehydrogenase subunit D  65.62 
 
 		 434 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  65.83 
 
 		 441 aa  606  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1547  NADH dehydrogenase subunit D  65.1 
 
 		 446 aa  601  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.795023  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1601  NADH dehydrogenase subunit D  65.1 
 
 		 446 aa  601  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1577  NADH dehydrogenase subunit D  65.1 
 
 		 446 aa  601  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3171  NADH dehydrogenase I, D subunit  66.27 
 
 		 426 aa  598  1e-170  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0523  NADH dehydrogenase subunit D  64.25 
 
 		 446 aa  599  1e-170  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1882  NADH dehydrogenase subunit D  64.9 
 
 		 442 aa  587  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.303191  normal  0.424323 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5056  NADH dehydrogenase I, D subunit  65.8 
 
 		 431 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4484  NADH dehydrogenase subunit D  63.35 
 
 		 451 aa  578  1e-164  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00259323 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13169  NADH dehydrogenase subunit D  62.27 
 
 		 440 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2713  NADH dehydrogenase I, D subunit  61.83 
 
 		 448 aa  560  1e-158  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5629  NADH dehydrogenase subunit D  67.61 
 
 		 426 aa  557  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0649561 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3226  NADH dehydrogenase subunit D  62.62 
 
 		 445 aa  549  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00372602 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0542  NADH dehydrogenase subunit D  61.4 
 
 		 446 aa  533  1e-150  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502265  normal  0.442373 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07410  NADH dehydrogenase subunit D  58.42 
 
 		 450 aa  527  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0472  NADH dehydrogenase I, D subunit  60.66 
 
 		 447 aa  522  1e-147  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  55.56 
 
 		 417 aa  451  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  54.81 
 
 		 417 aa  449  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  52.23 
 
 		 417 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  50.74 
 
 		 390 aa  426  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  51.85 
 
 		 411 aa  426  1e-118  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.51 
 
 		 390 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.32 
 
 		 422 aa  405  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.91 
 
 		 389 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.76 
 
 		 401 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.16 
 
 		 389 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0912  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.5 
 
 		 403 aa  397  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.28 
 
 		 390 aa  395  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1152  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.14 
 
 		 413 aa  395  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.78 
 
 		 390 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1874  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.04 
 
 		 415 aa  391  1e-107  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.04 
 
 		 414 aa  385  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  45.7 
 
 		 393 aa  381  1e-104  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1967  NADH dehydrogenase subunit D  45.07 
 
 		 417 aa  375  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0788296 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1504  NADH dehydrogenase subunit D  44.47 
 
 		 417 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00434712 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  44.96 
 
 		 393 aa  374  1e-102  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  45.18 
 
 		 417 aa  375  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  44.28 
 
 		 397 aa  372  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1406  NADH dehydrogenase subunit D  43.76 
 
 		 417 aa  371  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1762  NADH dehydrogenase subunit D  43.53 
 
 		 417 aa  369  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  44.5 
 
 		 390 aa  370  1e-101  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3331  NADH dehydrogenase subunit D  44.72 
 
 		 416 aa  370  1e-101  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150101  normal  0.101451 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  43.76 
 
 		 417 aa  371  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  44.97 
 
 		 388 aa  370  1e-101  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  43.76 
 
 		 417 aa  371  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  44 
 
 		 417 aa  369  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  43.53 
 
 		 417 aa  371  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  43.76 
 
 		 417 aa  367  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3297  NADH dehydrogenase subunit D  46.32 
 
 		 402 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  43.06 
 
 		 417 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.43 
 
 		 404 aa  368  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  43.56 
 
 		 417 aa  366  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  43.06 
 
 		 417 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  43.56 
 
 		 417 aa  366  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  43.06 
 
 		 417 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4129  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.36 
 
 		 396 aa  365  1e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2810  NADH dehydrogenase subunit D  43.43 
 
 		 417 aa  364  1e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.299965 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  43.06 
 
 		 417 aa  363  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3507  NADH dehydrogenase subunit D  43.76 
 
 		 417 aa  363  3e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  42.59 
 
 		 417 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  42.59 
 
 		 417 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  44.97 
 
 		 392 aa  363  4e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  42.82 
 
 		 417 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2702  NADH dehydrogenase subunit D  43.53 
 
 		 417 aa  362  7.0000000000000005e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1496  NADH dehydrogenase subunit D  43.29 
 
 		 417 aa  362  1e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3253  NADH dehydrogenase subunit D  42.82 
 
 		 417 aa  361  1e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.626895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  44.42 
 
 		 406 aa  360  2e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2833  NADH dehydrogenase subunit D  44.47 
 
 		 417 aa  360  2e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1961  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.06 
 
 		 417 aa  361  2e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00447389  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.47 
 
 		 400 aa  361  2e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2006  NADH dehydrogenase subunit D  42.35 
 
 		 417 aa  360  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000196393  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1094  NADH dehydrogenase subunit D  42.59 
 
 		 417 aa  360  3e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.402289  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0711  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.79 
 
 		 417 aa  360  4e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.577358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4393  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.36 
 
 		 396 aa  360  4e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0182447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0930  NADH dehydrogenase subunit D  42.35 
 
 		 417 aa  360  4e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01290  NADH dehydrogenase subunit D  43.06 
 
 		 435 aa  360  4e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191542  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0989  NADH dehydrogenase subunit D  43.29 
 
 		 417 aa  360  4e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  42.59 
 
 		 417 aa  359  6e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1133  NADH dehydrogenase subunit D  42.12 
 
 		 417 aa  358  8e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154075  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1826  NADH dehydrogenase subunit D  42.12 
 
 		 417 aa  358  8e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0416  NADH dehydrogenase subunit D  42.12 
 
 		 417 aa  358  8e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1438  NADH dehydrogenase subunit D  42.12 
 
 		 417 aa  358  8e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0734  NADH dehydrogenase subunit D  42.12 
 
 		 417 aa  358  8e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.301756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  42.12 
 
 		 417 aa  358  8e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1302  NADH dehydrogenase subunit D  42.12 
 
 		 417 aa  358  8e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>