More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0375 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0375  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
375 aa  773    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1737  NADH dehydrogenase subunit D  48.28 
 
 
367 aa  380  1e-104  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.960022  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0886  NADH dehydrogenase subunit D  48.55 
 
 
369 aa  368  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.802693  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1221  NADH dehydrogenase subunit D  48.56 
 
 
367 aa  366  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.240217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1602  NADH dehydrogenase subunit D  47.62 
 
 
368 aa  365  1e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2206  NADH dehydrogenase subunit D  47.47 
 
 
391 aa  353  2e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.258074 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  42.36 
 
 
366 aa  296  3e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  39.47 
 
 
367 aa  266  4e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0980  NADH dehydrogenase subunit D  38.24 
 
 
371 aa  264  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1052  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  39.1 
 
 
390 aa  262  8e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.718525  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1897  NADH dehydrogenase subunit D  39.09 
 
 
405 aa  261  2e-68  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.412503  normal  0.283556 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  36.55 
 
 
393 aa  259  4e-68  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  36.04 
 
 
393 aa  258  9e-68  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3409  F420H2 dehydrogenase subunit D  37.04 
 
 
374 aa  256  4e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.170957  normal  0.90197 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.59 
 
 
400 aa  256  6e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1081  NADH dehydrogenase subunit D  38.83 
 
 
404 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.152309  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1294  F420H2 dehydrogenase subunit D  35.96 
 
 
374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.196635  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.95 
 
 
390 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1300  NADH dehydrogenase (quinone)  39.09 
 
 
410 aa  249  7e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.823444  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4983  NADH dehydrogenase (quinone)  36.87 
 
 
370 aa  248  9e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173613  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  34.09 
 
 
390 aa  248  1e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2692  NADH dehydrogenase subunit D  35.19 
 
 
434 aa  248  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.92 
 
 
404 aa  248  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.35 
 
 
414 aa  248  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2574  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  37.7 
 
 
379 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.677679  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  37.7 
 
 
379 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  37.7 
 
 
379 aa  247  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.278436  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2091  NADH dehydrogenase (quinone)  36.55 
 
 
374 aa  247  3e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  35.68 
 
 
392 aa  247  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.03 
 
 
389 aa  246  4e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.77 
 
 
389 aa  245  8e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1662  NADH dehydrogenase I, D subunit  38.73 
 
 
383 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2992  NADH dehydrogenase (quinone)  36.55 
 
 
374 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1015  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  34.61 
 
 
608 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.390634  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.18 
 
 
390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1357  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  34.61 
 
 
587 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0746  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  35.64 
 
 
395 aa  243  3.9999999999999997e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.946717 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01290  NADH dehydrogenase subunit D  33.65 
 
 
435 aa  243  3.9999999999999997e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191542  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  35.62 
 
 
787 aa  243  5e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1596  NADH dehydrogenase (quinone)  38.98 
 
 
406 aa  242  6e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1628  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.91 
 
 
369 aa  242  6e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.963572  normal  0.66391 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  35.62 
 
 
793 aa  242  7e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  33.92 
 
 
397 aa  242  7e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5095  NADH dehydrogenase subunit D  34.76 
 
 
366 aa  242  7.999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.93 
 
 
390 aa  241  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4518  NADH dehydrogenase I, D subunit  38.2 
 
 
415 aa  241  1e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5351  NADH dehydrogenase (quinone)  37.01 
 
 
406 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3748  NADH dehydrogenase (quinone)  36.1 
 
 
370 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000362019  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03190  NADH dehydrogenase subunit D  34.15 
 
 
460 aa  241  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1874  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.85 
 
 
415 aa  241  2e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598165  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  36.2 
 
 
792 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.63 
 
 
381 aa  240  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5056  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.23 
 
 
431 aa  240  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  36.57 
 
 
791 aa  240  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5629  NADH dehydrogenase subunit D  36.08 
 
 
426 aa  239  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0649561 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0284  NADH dehydrogenase I subunit D  34.78 
 
 
438 aa  239  5e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0930  NADH dehydrogenase subunit D  34.12 
 
 
417 aa  239  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156514  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  36.8 
 
 
367 aa  238  1e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4129  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.25 
 
 
396 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5532  NADH dehydrogenase subunit D  34.49 
 
 
366 aa  238  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277354 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5418  NADH dehydrogenase subunit D  34.49 
 
 
366 aa  238  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0631  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  34.78 
 
 
403 aa  238  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1626  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  34.78 
 
 
403 aa  238  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3190  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  34.78 
 
 
403 aa  238  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.53 
 
 
367 aa  238  2e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6679  NADH dehydrogenase subunit D  34.08 
 
 
483 aa  237  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2059  NADH dehydrogenase subunit D  35.06 
 
 
417 aa  237  3e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102892  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4555  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.25 
 
 
443 aa  237  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5473  NADH dehydrogenase subunit D  34.22 
 
 
366 aa  236  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3816  NADH dehydrogenase subunit D  33.69 
 
 
366 aa  237  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  36.8 
 
 
367 aa  236  4e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5422  NADH dehydrogenase subunit D  34.22 
 
 
366 aa  236  4e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4979  NADH dehydrogenase subunit D  34.22 
 
 
366 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4997  NADH dehydrogenase subunit D  34.22 
 
 
366 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0847  NADH dehydrogenase (quinone)  36.07 
 
 
395 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  34.86 
 
 
794 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1961  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.88 
 
 
417 aa  236  5.0000000000000005e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00447389  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  35.62 
 
 
400 aa  236  6e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  33.16 
 
 
388 aa  236  6e-61  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5147  NADH dehydrogenase subunit D  33.96 
 
 
366 aa  235  7e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5539  NADH dehydrogenase subunit D  33.96 
 
 
366 aa  235  7e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5388  NADH dehydrogenase subunit D  33.96 
 
 
366 aa  235  7e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9747399999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  33.88 
 
 
417 aa  235  8e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2985  NADH dehydrogenase subunit D  33.5 
 
 
406 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0128464  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.35 
 
 
411 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.02 
 
 
417 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0512  NADH dehydrogenase I, subunit D  35.94 
 
 
392 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3298  NADH dehydrogenase subunit D  34.76 
 
 
366 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3223  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.33 
 
 
392 aa  235  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0966966  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1396  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  34.52 
 
 
599 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.200775  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.59 
 
 
422 aa  234  2.0000000000000002e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1604  NADH dehydrogenase (quinone)  36.15 
 
 
400 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1125  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  35.62 
 
 
593 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.64928  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1286  NADH dehydrogenase (quinone)  35.56 
 
 
381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.511189  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  34.86 
 
 
794 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2770  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  35.28 
 
 
599 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.393942  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4415  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.22 
 
 
449 aa  233  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0964  NADH dehydrogenase subunit D  33.41 
 
 
417 aa  234  3e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389115  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3410  NADH dehydrogenase subunit D  33.96 
 
 
367 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  34.27 
 
 
417 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>