More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1602 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1602  NADH dehydrogenase subunit D  100 
 
 		 368 aa  753    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1221  NADH dehydrogenase subunit D  79.62 
 
 		 367 aa  620  1e-177  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.240217  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1737  NADH dehydrogenase subunit D  76.36 
 
 		 367 aa  587  1e-166  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.960022  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0886  NADH dehydrogenase subunit D  65.58 
 
 		 369 aa  510  1e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.802693  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0375  NADH dehydrogenase (quinone)  47.62 
 
 		 375 aa  365  1e-100  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2206  NADH dehydrogenase subunit D  39.56 
 
 		 391 aa  286  5.999999999999999e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258074 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  39.95 
 
 		 366 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1897  NADH dehydrogenase subunit D  37.5 
 
 		 405 aa  258  1e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.412503  normal  0.283556 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  35.26 
 
 		 406 aa  249  4e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1300  NADH dehydrogenase (quinone)  37.31 
 
 		 410 aa  247  2e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.823444  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1294  F420H2 dehydrogenase subunit D  35.75 
 
 		 374 aa  247  2e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.196635  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3409  F420H2 dehydrogenase subunit D  36.04 
 
 		 374 aa  247  3e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.170957  normal  0.90197 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0202  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  38.02 
 
 		 373 aa  247  3e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4983  NADH dehydrogenase (quinone)  38.32 
 
 		 370 aa  246  4.9999999999999997e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173613  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6679  NADH dehydrogenase subunit D  35 
 
 		 483 aa  243  6e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  36.91 
 
 		 367 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1631  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  38.59 
 
 		 358 aa  239  5.999999999999999e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  36.26 
 
 		 367 aa  238  1e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03190  NADH dehydrogenase subunit D  35.01 
 
 		 460 aa  238  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1628  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.96 
 
 		 369 aa  238  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.963572  normal  0.66391 
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  33.42 
 
 		 390 aa  237  2e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4555  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.3 
 
 		 443 aa  237  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2155  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.44 
 
 		 441 aa  237  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02414  hypothetical protein similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  33.6 
 
 		 475 aa  236  5.0000000000000005e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151267 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  35.99 
 
 		 367 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2985  NADH dehydrogenase subunit D  35.32 
 
 		 406 aa  235  8e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0128464  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1015  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  35.25 
 
 		 608 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.390634  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  33.6 
 
 		 397 aa  234  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3331  NADH dehydrogenase subunit D  33.94 
 
 		 416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150101  normal  0.101451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2992  NADH dehydrogenase (quinone)  34.41 
 
 		 374 aa  233  6e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.51 
 
 		 417 aa  233  6e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.68 
 
 		 404 aa  232  7.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2059  NADH dehydrogenase subunit D  33.17 
 
 		 417 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102892  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4518  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.32 
 
 		 415 aa  232  8.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2091  NADH dehydrogenase (quinone)  34.68 
 
 		 374 aa  231  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  35.05 
 
 		 417 aa  230  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.54 
 
 		 400 aa  230  3e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1615  NADH dehydrogenase subunit D  35.78 
 
 		 417 aa  230  3e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0833647  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0952  NADH dehydrogenase subunit D  33.17 
 
 		 417 aa  229  4e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.597503 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0716  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  35.25 
 
 		 601 aa  229  5e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  33.25 
 
 		 417 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  33.25 
 
 		 417 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.86 
 
 		 390 aa  229  6e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  33.25 
 
 		 417 aa  229  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0548  NADH dehydrogenase subunit D  35.54 
 
 		 424 aa  229  6e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.899987  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1118  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  34.73 
 
 		 592 aa  229  7e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.374283  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1888  NADH dehydrogenase subunit D  32.68 
 
 		 417 aa  229  7e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  34.46 
 
 		 392 aa  229  8e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  32.55 
 
 		 388 aa  229  8e-59  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3223  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.9 
 
 		 392 aa  228  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0966966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1048  NADH dehydrogenase subunit D  32.68 
 
 		 417 aa  228  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  32.64 
 
 		 393 aa  227  2e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  33.25 
 
 		 417 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2211  NADH dehydrogenase subunit D  32.93 
 
 		 417 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.518232 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3226  NADH dehydrogenase subunit D  34.75 
 
 		 445 aa  227  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00372602 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.89 
 
 		 367 aa  228  2e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  32.78 
 
 		 417 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1747  NADH dehydrogenase subunit D  34.99 
 
 		 408 aa  227  3e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1561  NADH dehydrogenase subunit D  34.99 
 
 		 408 aa  227  3e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0422295  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  32.78 
 
 		 417 aa  227  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2300  NADH dehydrogenase subunit D  33.51 
 
 		 403 aa  227  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  32.54 
 
 		 417 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0428  NADH dehydrogenase subunit D  34.97 
 
 		 424 aa  226  4e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.366275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0964  NADH dehydrogenase subunit D  32.68 
 
 		 417 aa  226  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389115  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  33.58 
 
 		 417 aa  226  4e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1286  NADH dehydrogenase (quinone)  37.6 
 
 		 381 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.511189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1064  NADH dehydrogenase subunit D  32.06 
 
 		 417 aa  226  4e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240648  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  33.16 
 
 		 393 aa  226  4e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0824  NADH dehydrogenase subunit D  32.93 
 
 		 417 aa  226  4e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1357  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  33.42 
 
 		 587 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1927  NADH dehydrogenase subunit D  34.99 
 
 		 408 aa  226  5.0000000000000005e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.371072  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0977  NADH dehydrogenase subunit D  34.42 
 
 		 459 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1125  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  33.33 
 
 		 593 aa  226  7e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.64928  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.6 
 
 		 390 aa  226  7e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1346  NADH dehydrogenase subunit D  32.06 
 
 		 417 aa  226  7e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00313693  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1967  NADH dehydrogenase subunit D  34.07 
 
 		 417 aa  226  7e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0788296 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02730  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  33.33 
 
 		 452 aa  225  8e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0930  NADH dehydrogenase subunit D  32.68 
 
 		 417 aa  225  8e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2006  NADH dehydrogenase subunit D  32.06 
 
 		 417 aa  225  9e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000196393  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1293  NADH dehydrogenase (quinone)  36.02 
 
 		 431 aa  225  9e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.703373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3748  NADH dehydrogenase (quinone)  35.23 
 
 		 370 aa  225  9e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000362019  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  35.92 
 
 		 379 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.278436  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0800  NADH dehydrogenase subunit D  32.49 
 
 		 396 aa  224  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1826  NADH dehydrogenase subunit D  31.82 
 
 		 417 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  35.92 
 
 		 379 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1133  NADH dehydrogenase subunit D  31.82 
 
 		 417 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154075  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1438  NADH dehydrogenase subunit D  31.82 
 
 		 417 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  31.82 
 
 		 417 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2567  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  34.38 
 
 		 389 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.786761  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0416  NADH dehydrogenase subunit D  31.82 
 
 		 417 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1302  NADH dehydrogenase subunit D  31.82 
 
 		 417 aa  224  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1308  NADH dehydrogenase subunit D  34.03 
 
 		 418 aa  225  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1762  NADH dehydrogenase subunit D  33.9 
 
 		 417 aa  224  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0734  NADH dehydrogenase subunit D  31.82 
 
 		 417 aa  224  1e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.301756  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0270  NADH dehydrogenase subunit D  36 
 
 		 440 aa  225  1e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.877752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2574  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  35.92 
 
 		 379 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.677679  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  33.58 
 
 		 417 aa  224  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3211  NADH dehydrogenase subunit D  31.82 
 
 		 417 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2420  NADH dehydrogenase subunit D  32.49 
 
 		 396 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2833  NADH dehydrogenase subunit D  33.51 
 
 		 416 aa  224  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.371933  normal  0.138606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>