More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3226 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0542  NADH dehydrogenase subunit D  72.61 
 
 		 446 aa  660    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502265  normal  0.442373 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0472  NADH dehydrogenase I, D subunit  74.42 
 
 		 447 aa  649    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2713  NADH dehydrogenase I, D subunit  74.39 
 
 		 448 aa  684    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07410  NADH dehydrogenase subunit D  74.39 
 
 		 450 aa  679    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3226  NADH dehydrogenase subunit D  100 
 
 		 445 aa  907    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00372602 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0398  NADH dehydrogenase I, D subunit  69.03 
 
 		 446 aa  627  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7688  NADH dehydrogenase subunit D  69.77 
 
 		 445 aa  620  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0523  NADH dehydrogenase subunit D  68.45 
 
 		 446 aa  610  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1882  NADH dehydrogenase subunit D  65.19 
 
 		 442 aa  598  1e-170  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.303191  normal  0.424323 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2692  NADH dehydrogenase subunit D  65.31 
 
 		 434 aa  597  1e-169  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13169  NADH dehydrogenase subunit D  66.44 
 
 		 440 aa  593  1e-168  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0270  NADH dehydrogenase subunit D  64.72 
 
 		 440 aa  594  1e-168  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.877752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4484  NADH dehydrogenase subunit D  66.06 
 
 		 451 aa  591  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00259323 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0284  NADH dehydrogenase I subunit D  65.34 
 
 		 438 aa  586  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1601  NADH dehydrogenase subunit D  64.97 
 
 		 446 aa  586  1e-166  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1577  NADH dehydrogenase subunit D  64.97 
 
 		 446 aa  586  1e-166  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1547  NADH dehydrogenase subunit D  64.97 
 
 		 446 aa  586  1e-166  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.795023  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5056  NADH dehydrogenase I, D subunit  65.65 
 
 		 431 aa  586  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6679  NADH dehydrogenase subunit D  65.65 
 
 		 483 aa  582  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6091  NADH dehydrogenase subunit D  67.21 
 
 		 457 aa  584  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.489458  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4415  NADH dehydrogenase I, D subunit  66.36 
 
 		 449 aa  580  1e-164  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4555  NADH dehydrogenase I, D subunit  62.83 
 
 		 443 aa  578  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  64.42 
 
 		 441 aa  578  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3171  NADH dehydrogenase I, D subunit  65.81 
 
 		 426 aa  578  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0541  NADH dehydrogenase subunit D  66.05 
 
 		 482 aa  577  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.482391  normal  0.20204 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0977  NADH dehydrogenase subunit D  64.49 
 
 		 459 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4460  NADH dehydrogenase subunit D  65.58 
 
 		 441 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4062  NADH dehydrogenase subunit D  64.88 
 
 		 441 aa  568  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.855736  normal  0.069193 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03190  NADH dehydrogenase subunit D  63.08 
 
 		 460 aa  566  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1277  NADH dehydrogenase I, D subunit  62.62 
 
 		 444 aa  560  1e-158  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.494921  normal  0.687145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5629  NADH dehydrogenase subunit D  64.65 
 
 		 426 aa  535  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0649561 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  50.49 
 
 		 417 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  50.71 
 
 		 417 aa  409  1e-113  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  50.95 
 
 		 417 aa  405  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  50.36 
 
 		 411 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0912  NADH dehydrogenase I, D subunit  51.33 
 
 		 403 aa  398  1e-109  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.38 
 
 		 414 aa  383  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1874  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.47 
 
 		 415 aa  383  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.17 
 
 		 401 aa  381  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.83 
 
 		 422 aa  379  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4393  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.52 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0182447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4129  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.29 
 
 		 396 aa  371  1e-101  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.1 
 
 		 390 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1211  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.04 
 
 		 396 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1082  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.04 
 
 		 396 aa  365  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.129082 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1016  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.04 
 
 		 396 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.88 
 
 		 390 aa  364  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2057  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.32 
 
 		 396 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.320233  normal  0.342596 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.31 
 
 		 389 aa  359  5e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.31 
 
 		 389 aa  358  9e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1025  NADH dehydrogenase subunit D  45.3 
 
 		 396 aa  358  9.999999999999999e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1262  NADH dehydrogenase subunit D  45.54 
 
 		 396 aa  356  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  44.55 
 
 		 388 aa  355  5.999999999999999e-97  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1354  NADH dehydrogenase subunit D  46.04 
 
 		 396 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.937388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1885  NADH dehydrogenase subunit D  45.12 
 
 		 402 aa  355  1e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.634993 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2575  NADH dehydrogenase subunit D  45 
 
 		 401 aa  354  1e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0392469  normal  0.134645 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2884  NADH dehydrogenase subunit D  45.37 
 
 		 416 aa  353  4e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736243  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4560  NADH dehydrogenase subunit D  44.83 
 
 		 398 aa  353  5e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17714 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  42.89 
 
 		 417 aa  352  5e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2218  NADH dehydrogenase subunit D  45.61 
 
 		 402 aa  352  5e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.714071  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5799  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.54 
 
 		 396 aa  352  8e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1715  NADH dehydrogenase subunit D  45.57 
 
 		 396 aa  352  8e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1152  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.26 
 
 		 413 aa  352  8e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2420  NADH dehydrogenase subunit D  45.54 
 
 		 396 aa  351  1e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  41.72 
 
 		 417 aa  352  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3297  NADH dehydrogenase subunit D  45.97 
 
 		 402 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2396  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.57 
 
 		 396 aa  350  2e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.213945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  43.14 
 
 		 397 aa  350  2e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_004310  BR0805  NADH dehydrogenase subunit D  45.54 
 
 		 396 aa  349  4e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0798929  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2833  NADH dehydrogenase subunit D  42.51 
 
 		 416 aa  350  4e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.371933  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  43.73 
 
 		 390 aa  349  5e-95  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2404  NADH dehydrogenase subunit D  45.07 
 
 		 396 aa  349  5e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00163945 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0800  NADH dehydrogenase subunit D  45.54 
 
 		 396 aa  349  6e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  41.26 
 
 		 417 aa  349  7e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  41.26 
 
 		 417 aa  349  7e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2247  NADH dehydrogenase subunit D  44.31 
 
 		 412 aa  348  9e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0299939  normal  0.120974 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.38 
 
 		 390 aa  348  1e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3331  NADH dehydrogenase subunit D  41.11 
 
 		 416 aa  347  2e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150101  normal  0.101451 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2921  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.07 
 
 		 394 aa  347  3e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.38 
 
 		 390 aa  347  3e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  43.56 
 
 		 392 aa  347  3e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4630  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.53 
 
 		 402 aa  346  4e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.193494 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0781  NADH dehydrogenase subunit D  44.55 
 
 		 396 aa  345  7e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.673005  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  42.65 
 
 		 406 aa  344  2e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0744  NADH dehydrogenase subunit D  43.51 
 
 		 403 aa  344  2e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  41.26 
 
 		 417 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  41.26 
 
 		 417 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  41.26 
 
 		 417 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3834  NADH dehydrogenase subunit D  43.9 
 
 		 396 aa  343  4e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  41.26 
 
 		 417 aa  343  5e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0891  NADH dehydrogenase subunit D  44.55 
 
 		 396 aa  342  5.999999999999999e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.984899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  42.61 
 
 		 393 aa  342  7e-93  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2004  NADH dehydrogenase subunit D  43.56 
 
 		 402 aa  342  7e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2515  NADH dehydrogenase subunit D  43.56 
 
 		 404 aa  342  9e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  41.26 
 
 		 417 aa  342  9e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  42.61 
 
 		 393 aa  342  9e-93  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02414  hypothetical protein similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  39.96 
 
 		 475 aa  342  1e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151267 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3223  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.07 
 
 		 392 aa  342  1e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0966966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1177  NADH dehydrogenase subunit D  43.56 
 
 		 402 aa  342  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  40.33 
 
 		 417 aa  341  1e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>