More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2206 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2206  NADH dehydrogenase subunit D  100 
 
 		 391 aa  806    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258074 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0375  NADH dehydrogenase (quinone)  47.47 
 
 		 375 aa  353  2.9999999999999997e-96  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0886  NADH dehydrogenase subunit D  44.02 
 
 		 369 aa  310  2e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.802693  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1737  NADH dehydrogenase subunit D  43.01 
 
 		 367 aa  305  1.0000000000000001e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.960022  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1221  NADH dehydrogenase subunit D  41.64 
 
 		 367 aa  298  2e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.240217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1602  NADH dehydrogenase subunit D  39.56 
 
 		 368 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1294  F420H2 dehydrogenase subunit D  37.36 
 
 		 374 aa  251  2e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.196635  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3409  F420H2 dehydrogenase subunit D  34.71 
 
 		 374 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.170957  normal  0.90197 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1052  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  35.22 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.718525  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.17 
 
 		 417 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.99 
 
 		 404 aa  219  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4497  NADH dehydrogenase (quinone)  35.04 
 
 		 385 aa  218  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0483  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.42 
 
 		 426 aa  217  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  32.47 
 
 		 390 aa  216  4e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.51 
 
 		 411 aa  216  7e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  32.47 
 
 		 388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.16 
 
 		 390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0744  NADH dehydrogenase subunit D  31.76 
 
 		 403 aa  213  5.999999999999999e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  31.89 
 
 		 390 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9168  NADH dehydrogenase (quinone)  36.18 
 
 		 398 aa  212  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.4 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0980  NADH dehydrogenase subunit D  34.24 
 
 		 371 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.16 
 
 		 381 aa  210  4e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1081  NADH dehydrogenase subunit D  33.33 
 
 		 404 aa  210  4e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.152309  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.14 
 
 		 390 aa  209  8e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4518  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.3 
 
 		 415 aa  209  8e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0279  NADH dehydrogenase  34.7 
 
 		 378 aa  209  9e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000160652 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2992  NADH dehydrogenase (quinone)  34.49 
 
 		 374 aa  208  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  31.35 
 
 		 393 aa  209  1e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  30.83 
 
 		 393 aa  208  1e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0202  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  36.21 
 
 		 373 aa  208  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0631  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  31.23 
 
 		 403 aa  208  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1626  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  31.23 
 
 		 403 aa  208  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3190  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  31.23 
 
 		 403 aa  208  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.33 
 
 		 400 aa  208  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.99 
 
 		 414 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1628  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.15 
 
 		 369 aa  208  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.963572  normal  0.66391 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2091  NADH dehydrogenase (quinone)  34.22 
 
 		 374 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  32.02 
 
 		 406 aa  207  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  33.79 
 
 		 367 aa  207  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1262  NADH dehydrogenase subunit D  32.29 
 
 		 396 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  35.2 
 
 		 366 aa  206  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0141  NADH dehydrogenase I, D subunit  30.89 
 
 		 408 aa  206  7e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  31.79 
 
 		 389 aa  205  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1747  NADH dehydrogenase subunit D  31.68 
 
 		 408 aa  204  2e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1826  NADH dehydrogenase subunit D  33 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1133  NADH dehydrogenase subunit D  33 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154075  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1438  NADH dehydrogenase subunit D  33 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1302  NADH dehydrogenase subunit D  33 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0734  NADH dehydrogenase subunit D  33 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.301756  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1442  NADH dehydrogenase subunit D  31.41 
 
 		 408 aa  204  2e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.331272  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  33 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0416  NADH dehydrogenase subunit D  33 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1354  NADH dehydrogenase subunit D  32.03 
 
 		 396 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.937388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  31.54 
 
 		 389 aa  204  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4129  NADH dehydrogenase I, D subunit  31.77 
 
 		 396 aa  203  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0095  NADH dehydrogenase (quinone)  34.26 
 
 		 378 aa  203  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1927  NADH dehydrogenase subunit D  31.68 
 
 		 408 aa  203  4e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.371072  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1082  NADH dehydrogenase I, D subunit  30.47 
 
 		 396 aa  203  5e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.129082 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3816  NADH dehydrogenase subunit D  31.5 
 
 		 366 aa  203  5e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2921  NADH dehydrogenase I, D subunit  30.81 
 
 		 394 aa  203  5e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  31.1 
 
 		 417 aa  202  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2575  NADH dehydrogenase subunit D  30.83 
 
 		 401 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0392469  normal  0.134645 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  31.1 
 
 		 417 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  31.1 
 
 		 417 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0805  NADH dehydrogenase subunit D  31.61 
 
 		 396 aa  202  9e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0798929  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3298  NADH dehydrogenase subunit D  31.93 
 
 		 366 aa  202  9e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1016  NADH dehydrogenase I, D subunit  30.47 
 
 		 396 aa  202  9e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1561  NADH dehydrogenase subunit D  31.41 
 
 		 408 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0422295  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3297  NADH dehydrogenase subunit D  31.09 
 
 		 402 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  31.1 
 
 		 417 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3440  NADH dehydrogenase  34.76 
 
 		 392 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.592652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0800  NADH dehydrogenase subunit D  31.61 
 
 		 396 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1734  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  33.33 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00563551  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1211  NADH dehydrogenase I, D subunit  30.21 
 
 		 396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  31.1 
 
 		 417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1064  NADH dehydrogenase subunit D  32.5 
 
 		 417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240648  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  30.86 
 
 		 417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.73 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  30.14 
 
 		 417 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  32.35 
 
 		 417 aa  201  3e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4393  NADH dehydrogenase I, D subunit  31.3 
 
 		 396 aa  200  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0182447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  31.7 
 
 		 417 aa  200  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2057  NADH dehydrogenase I, D subunit  30.21 
 
 		 396 aa  201  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.320233  normal  0.342596 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  30.62 
 
 		 417 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8417  NADH dehydrogenase (quinone)  33.24 
 
 		 390 aa  200  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2420  NADH dehydrogenase subunit D  30.83 
 
 		 396 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3410  NADH dehydrogenase subunit D  31.65 
 
 		 367 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1177  NADH dehydrogenase subunit D  29.78 
 
 		 402 aa  199  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2515  NADH dehydrogenase subunit D  29.78 
 
 		 404 aa  199  7e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5422  NADH dehydrogenase subunit D  31.5 
 
 		 366 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1025  NADH dehydrogenase subunit D  30.57 
 
 		 396 aa  199  7.999999999999999e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3331  NADH dehydrogenase subunit D  30.97 
 
 		 416 aa  199  7.999999999999999e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150101  normal  0.101451 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4983  NADH dehydrogenase (quinone)  33.24 
 
 		 370 aa  199  7.999999999999999e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173613  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1526  NADH dehydrogenase subunit D  32.45 
 
 		 409 aa  199  9e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.013165  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4979  NADH dehydrogenase subunit D  31.5 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  30.96 
 
 		 417 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5473  NADH dehydrogenase subunit D  31.5 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2985  NADH dehydrogenase subunit D  31.41 
 
 		 406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0128464  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3834  NADH dehydrogenase subunit D  31.67 
 
 		 396 aa  198  1.0000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74836  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>