More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3409 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3409  F420H2 dehydrogenase subunit D  100 
 
 		 374 aa  761    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.170957  normal  0.90197 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1294  F420H2 dehydrogenase subunit D  74.87 
 
 		 374 aa  599  1e-170  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.196635  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1052  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  57.72 
 
 		 390 aa  440  9.999999999999999e-123  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.718525  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  43.4 
 
 		 367 aa  321  9.999999999999999e-87  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.07 
 
 		 404 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  42.86 
 
 		 367 aa  319  6e-86  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.59 
 
 		 367 aa  317  3e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.62 
 
 		 417 aa  311  7.999999999999999e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  42.28 
 
 		 366 aa  309  4e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3298  NADH dehydrogenase subunit D  41.46 
 
 		 366 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3410  NADH dehydrogenase subunit D  41.46 
 
 		 367 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.73 
 
 		 381 aa  301  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  38.44 
 
 		 417 aa  298  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  38.44 
 
 		 417 aa  298  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  38.28 
 
 		 417 aa  297  2e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  38.54 
 
 		 390 aa  297  3e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  39.13 
 
 		 792 aa  295  8e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  38.8 
 
 		 389 aa  295  9e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  38.63 
 
 		 417 aa  295  1e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  38.8 
 
 		 389 aa  294  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  38.28 
 
 		 390 aa  294  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  39.74 
 
 		 388 aa  293  3e-78  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  37.66 
 
 		 393 aa  293  3e-78  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1662  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.47 
 
 		 383 aa  293  3e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  37.11 
 
 		 417 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0734  NADH dehydrogenase subunit D  37.11 
 
 		 417 aa  292  5e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.301756  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1826  NADH dehydrogenase subunit D  37.11 
 
 		 417 aa  292  5e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1133  NADH dehydrogenase subunit D  37.11 
 
 		 417 aa  292  5e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154075  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1438  NADH dehydrogenase subunit D  37.11 
 
 		 417 aa  292  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0416  NADH dehydrogenase subunit D  37.11 
 
 		 417 aa  292  5e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  37.11 
 
 		 417 aa  292  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  37.11 
 
 		 417 aa  292  5e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  37.11 
 
 		 417 aa  292  5e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1302  NADH dehydrogenase subunit D  37.11 
 
 		 417 aa  292  5e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  37.11 
 
 		 417 aa  292  5e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  36.87 
 
 		 417 aa  291  9e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  37.08 
 
 		 417 aa  291  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  36.63 
 
 		 417 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0930  NADH dehydrogenase subunit D  37.16 
 
 		 417 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  37.08 
 
 		 417 aa  291  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  37.66 
 
 		 393 aa  290  2e-77  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.06 
 
 		 390 aa  290  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.59 
 
 		 400 aa  290  3e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  36.63 
 
 		 417 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3816  NADH dehydrogenase subunit D  40 
 
 		 366 aa  290  3e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1064  NADH dehydrogenase subunit D  36.63 
 
 		 417 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240648  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  39.53 
 
 		 397 aa  289  5.0000000000000004e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2211  NADH dehydrogenase subunit D  36.84 
 
 		 417 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.518232 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1346  NADH dehydrogenase subunit D  36.56 
 
 		 417 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00313693  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1561  NADH dehydrogenase subunit D  39.74 
 
 		 408 aa  288  1e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0422295  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2059  NADH dehydrogenase subunit D  36.36 
 
 		 417 aa  287  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102892  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1888  NADH dehydrogenase subunit D  36.84 
 
 		 417 aa  287  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  37.85 
 
 		 791 aa  287  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1406  NADH dehydrogenase subunit D  36.08 
 
 		 417 aa  287  2e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  40.1 
 
 		 401 aa  287  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  36.36 
 
 		 417 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0964  NADH dehydrogenase subunit D  36.12 
 
 		 417 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389115  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  38.05 
 
 		 417 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0270  NADH dehydrogenase subunit D  40.64 
 
 		 440 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.877752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4983  NADH dehydrogenase (quinone)  39.84 
 
 		 370 aa  287  2.9999999999999996e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173613  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1747  NADH dehydrogenase subunit D  39.74 
 
 		 408 aa  286  4e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2091  NADH dehydrogenase (quinone)  38.77 
 
 		 374 aa  286  4e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3211  NADH dehydrogenase subunit D  36.32 
 
 		 417 aa  286  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  38.87 
 
 		 417 aa  286  4e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0352  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  39.69 
 
 		 394 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  38.28 
 
 		 390 aa  286  5e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0272  NADH dehydrogenase subunit D  36.68 
 
 		 435 aa  286  5e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5147  NADH dehydrogenase subunit D  39.18 
 
 		 366 aa  286  5e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0243  NADH dehydrogenase subunit D  36.68 
 
 		 435 aa  286  5e-76  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5539  NADH dehydrogenase subunit D  39.18 
 
 		 366 aa  286  5e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5388  NADH dehydrogenase subunit D  39.18 
 
 		 366 aa  286  5e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9747399999999995e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4979  NADH dehydrogenase subunit D  39.18 
 
 		 366 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  37.9 
 
 		 417 aa  286  5.999999999999999e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2036  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  39.44 
 
 		 394 aa  285  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2062  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  39.44 
 
 		 394 aa  285  5.999999999999999e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1628  NADH dehydrogenase I, D subunit  39.62 
 
 		 369 aa  285  5.999999999999999e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.963572  normal  0.66391 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1927  NADH dehydrogenase subunit D  40 
 
 		 408 aa  285  5.999999999999999e-76  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.371072  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01290  NADH dehydrogenase subunit D  35.98 
 
 		 435 aa  285  7e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191542  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  36.36 
 
 		 417 aa  285  9e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2810  NADH dehydrogenase subunit D  37.11 
 
 		 417 aa  285  9e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.299965 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02414  hypothetical protein similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  37.17 
 
 		 475 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151267 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2562  NADH dehydrogenase subunit D  36.79 
 
 		 417 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1577  NADH dehydrogenase subunit D  38.81 
 
 		 446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1547  NADH dehydrogenase subunit D  38.81 
 
 		 446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.795023  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1601  NADH dehydrogenase subunit D  38.81 
 
 		 446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5095  NADH dehydrogenase subunit D  38.9 
 
 		 366 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  39.22 
 
 		 794 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5532  NADH dehydrogenase subunit D  38.9 
 
 		 366 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277354 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5418  NADH dehydrogenase subunit D  38.9 
 
 		 366 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2992  NADH dehydrogenase (quinone)  38.5 
 
 		 374 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1967  NADH dehydrogenase subunit D  38.04 
 
 		 417 aa  284  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0788296 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  37.6 
 
 		 793 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  37.47 
 
 		 390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4997  NADH dehydrogenase subunit D  38.9 
 
 		 366 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5422  NADH dehydrogenase subunit D  38.9 
 
 		 366 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5473  NADH dehydrogenase subunit D  38.9 
 
 		 366 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3253  NADH dehydrogenase subunit D  36.32 
 
 		 417 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.626895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0184  NADH dehydrogenase subunit D  39.39 
 
 		 408 aa  283  4.0000000000000003e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2006  NADH dehydrogenase subunit D  36.14 
 
 		 417 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000196393  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0989  NADH dehydrogenase subunit D  37.41 
 
 		 417 aa  282  6.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>