More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1737 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1737  NADH dehydrogenase subunit D  100 
 
 
367 aa  748    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.960022  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1221  NADH dehydrogenase subunit D  77.93 
 
 
367 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.240217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1602  NADH dehydrogenase subunit D  76.36 
 
 
368 aa  587  1e-166  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0886  NADH dehydrogenase subunit D  65.85 
 
 
369 aa  501  1e-141  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.802693  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0375  NADH dehydrogenase (quinone)  48.28 
 
 
375 aa  380  1e-104  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2206  NADH dehydrogenase subunit D  43.01 
 
 
391 aa  305  9.000000000000001e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.258074 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1294  F420H2 dehydrogenase subunit D  37.67 
 
 
374 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.196635  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  38.74 
 
 
366 aa  266  4e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3409  F420H2 dehydrogenase subunit D  36.66 
 
 
374 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.170957  normal  0.90197 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  37.53 
 
 
397 aa  259  5.0000000000000005e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.638594 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02414  hypothetical protein similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  36.22 
 
 
475 aa  258  1e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151267 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4555  NADH dehydrogenase I, D subunit  38.92 
 
 
443 aa  256  5e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1628  NADH dehydrogenase I, D subunit  37.67 
 
 
369 aa  253  5.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.963572  normal  0.66391 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6091  NADH dehydrogenase subunit D  36.23 
 
 
457 aa  251  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.489458  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4983  NADH dehydrogenase (quinone)  36.59 
 
 
370 aa  250  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173613  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0202  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  37.57 
 
 
373 aa  249  4e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03190  NADH dehydrogenase subunit D  37.29 
 
 
460 aa  249  5e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1357  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  36.03 
 
 
587 aa  249  6e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  37.27 
 
 
417 aa  249  6e-65  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4518  NADH dehydrogenase I, D subunit  38.5 
 
 
415 aa  249  6e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2992  NADH dehydrogenase (quinone)  35.68 
 
 
374 aa  249  7e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6679  NADH dehydrogenase subunit D  36.01 
 
 
483 aa  249  8e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0980  NADH dehydrogenase subunit D  35.07 
 
 
371 aa  248  9e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.64 
 
 
404 aa  247  3e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2692  NADH dehydrogenase subunit D  37.4 
 
 
434 aa  246  3e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2091  NADH dehydrogenase (quinone)  35.41 
 
 
374 aa  246  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0541  NADH dehydrogenase subunit D  35.34 
 
 
482 aa  246  4.9999999999999997e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.482391  normal  0.20204 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0716  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  38.57 
 
 
601 aa  245  6.999999999999999e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3226  NADH dehydrogenase subunit D  37.14 
 
 
445 aa  244  9.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00372602 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1015  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  35.51 
 
 
608 aa  243  5e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.390634  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1897  NADH dehydrogenase subunit D  36.46 
 
 
405 aa  243  6e-63  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.412503  normal  0.283556 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3331  NADH dehydrogenase subunit D  33.85 
 
 
416 aa  242  7e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150101  normal  0.101451 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  35.44 
 
 
367 aa  242  7.999999999999999e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1052  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  36.96 
 
 
390 aa  242  9e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.718525  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4069  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  36.03 
 
 
581 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  33.94 
 
 
390 aa  241  2e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2713  NADH dehydrogenase I, D subunit  37.26 
 
 
448 aa  240  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1118  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  38 
 
 
592 aa  241  2e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.374283  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2155  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.4 
 
 
441 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.61 
 
 
381 aa  240  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1631  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  37.82 
 
 
358 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0398  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.55 
 
 
446 aa  240  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0977  NADH dehydrogenase subunit D  37.17 
 
 
459 aa  239  8e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1697  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  34.99 
 
 
595 aa  238  9e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.395952  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5056  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.03 
 
 
431 aa  238  9e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0428  NADH dehydrogenase subunit D  36.29 
 
 
424 aa  237  2e-61  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.366275  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.88 
 
 
414 aa  238  2e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02730  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  35.62 
 
 
452 aa  236  3e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0284  NADH dehydrogenase I subunit D  36.11 
 
 
438 aa  236  4e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2059  NADH dehydrogenase subunit D  33.89 
 
 
417 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102892  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0523  NADH dehydrogenase subunit D  35.57 
 
 
446 aa  236  5.0000000000000005e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.73 
 
 
401 aa  235  7e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0270  NADH dehydrogenase subunit D  36.54 
 
 
440 aa  235  7e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.877752  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  34.99 
 
 
367 aa  235  8e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  33.95 
 
 
406 aa  235  8e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07410  NADH dehydrogenase subunit D  36.78 
 
 
450 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1125  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  34.46 
 
 
593 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.64928  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  34.92 
 
 
417 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  32.81 
 
 
388 aa  235  1.0000000000000001e-60  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2568  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  34.2 
 
 
593 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29990  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  34.2 
 
 
593 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4415  NADH dehydrogenase I, D subunit  37.16 
 
 
449 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  35.25 
 
 
392 aa  233  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2300  NADH dehydrogenase subunit D  34.81 
 
 
403 aa  234  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1346  NADH dehydrogenase subunit D  33.25 
 
 
417 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00313693  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  34.71 
 
 
367 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7688  NADH dehydrogenase subunit D  34.58 
 
 
445 aa  233  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450459  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5101  NADH dehydrogenase (quinone)  34.53 
 
 
410 aa  233  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  33.25 
 
 
417 aa  233  6e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1547  NADH dehydrogenase subunit D  34.73 
 
 
446 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.795023  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0964  NADH dehydrogenase subunit D  33.65 
 
 
417 aa  232  7.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389115  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  34.37 
 
 
417 aa  232  7.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1601  NADH dehydrogenase subunit D  34.73 
 
 
446 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1577  NADH dehydrogenase subunit D  34.73 
 
 
446 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2414  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  33.94 
 
 
593 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0246987  normal  0.2214 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1349  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  33.94 
 
 
581 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.738906  normal  0.499923 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0379  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  33.85 
 
 
595 aa  232  8.000000000000001e-60  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.643045  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1300  NADH dehydrogenase (quinone)  35.68 
 
 
410 aa  231  1e-59  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.823444  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1277  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.91 
 
 
444 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.494921  normal  0.687145 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68160  NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor  35.17 
 
 
474 aa  231  1e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0102  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  33.68 
 
 
580 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1064  NADH dehydrogenase subunit D  33.89 
 
 
417 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240648  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2567  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  34.03 
 
 
389 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.786761  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3211  NADH dehydrogenase subunit D  33.01 
 
 
417 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1615  NADH dehydrogenase subunit D  35.17 
 
 
417 aa  231  1e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0833647  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1293  NADH dehydrogenase (quinone)  33.51 
 
 
431 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.703373  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2862  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  32.98 
 
 
598 aa  231  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.260803  hitchhiker  0.00720367 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1561  NADH dehydrogenase subunit D  34.73 
 
 
408 aa  231  2e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0422295  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  33.49 
 
 
417 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1888  NADH dehydrogenase subunit D  33.65 
 
 
417 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2211  NADH dehydrogenase subunit D  33.65 
 
 
417 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.518232 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  33.49 
 
 
417 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  33.49 
 
 
417 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1382  NADH dehydrogenase (quinone)  33.77 
 
 
431 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.928946  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2548  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  34.11 
 
 
599 aa  230  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.257879  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0472  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.97 
 
 
447 aa  230  3e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1826  NADH dehydrogenase subunit D  33.65 
 
 
417 aa  229  4e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  33.65 
 
 
417 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1871  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  33.42 
 
 
593 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.200942 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1302  NADH dehydrogenase subunit D  33.65 
 
 
417 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>