More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0472 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2713  NADH dehydrogenase I, D subunit  75 
 
 		 448 aa  689    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07410  NADH dehydrogenase subunit D  80.55 
 
 		 450 aa  725    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0542  NADH dehydrogenase subunit D  77.75 
 
 		 446 aa  688    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502265  normal  0.442373 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0472  NADH dehydrogenase I, D subunit  100 
 
 		 447 aa  923    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3226  NADH dehydrogenase subunit D  74.42 
 
 		 445 aa  651    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00372602 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7688  NADH dehydrogenase subunit D  67.45 
 
 		 445 aa  604  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0523  NADH dehydrogenase subunit D  65.39 
 
 		 446 aa  604  1.0000000000000001e-171  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0398  NADH dehydrogenase I, D subunit  65.3 
 
 		 446 aa  590  1e-167  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1882  NADH dehydrogenase subunit D  66.28 
 
 		 442 aa  586  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.303191  normal  0.424323 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2692  NADH dehydrogenase subunit D  65.35 
 
 		 434 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13169  NADH dehydrogenase subunit D  62.9 
 
 		 440 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3171  NADH dehydrogenase I, D subunit  64.87 
 
 		 426 aa  575  1.0000000000000001e-163  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4484  NADH dehydrogenase subunit D  64.22 
 
 		 451 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00259323 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0284  NADH dehydrogenase I subunit D  62.61 
 
 		 438 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5056  NADH dehydrogenase I, D subunit  64.25 
 
 		 431 aa  571  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4415  NADH dehydrogenase I, D subunit  64.47 
 
 		 449 aa  569  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6091  NADH dehydrogenase subunit D  60.39 
 
 		 457 aa  561  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.489458  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0541  NADH dehydrogenase subunit D  63.05 
 
 		 482 aa  562  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.482391  normal  0.20204 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1577  NADH dehydrogenase subunit D  66.09 
 
 		 446 aa  561  1e-158  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6679  NADH dehydrogenase subunit D  61.47 
 
 		 483 aa  560  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1601  NADH dehydrogenase subunit D  66.09 
 
 		 446 aa  561  1e-158  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1547  NADH dehydrogenase subunit D  66.09 
 
 		 446 aa  561  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.795023  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4555  NADH dehydrogenase I, D subunit  61.74 
 
 		 443 aa  554  1e-156  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0270  NADH dehydrogenase subunit D  61.16 
 
 		 440 aa  552  1e-156  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.877752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  61.45 
 
 		 441 aa  551  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4460  NADH dehydrogenase subunit D  59.46 
 
 		 441 aa  546  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4062  NADH dehydrogenase subunit D  58.78 
 
 		 441 aa  542  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.855736  normal  0.069193 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03190  NADH dehydrogenase subunit D  58.82 
 
 		 460 aa  541  1e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0977  NADH dehydrogenase subunit D  59.33 
 
 		 459 aa  540  9.999999999999999e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1277  NADH dehydrogenase I, D subunit  60.66 
 
 		 444 aa  535  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.494921  normal  0.687145 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5629  NADH dehydrogenase subunit D  63.23 
 
 		 426 aa  529  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0649561 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.71 
 
 		 417 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.39 
 
 		 411 aa  392  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.39 
 
 		 417 aa  376  1e-103  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.84 
 
 		 417 aa  375  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.73 
 
 		 422 aa  372  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.68 
 
 		 414 aa  367  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1874  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.95 
 
 		 415 aa  360  2e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.21 
 
 		 390 aa  360  3e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0912  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.17 
 
 		 403 aa  356  5e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.59 
 
 		 401 aa  356  5.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.66 
 
 		 389 aa  355  1e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.41 
 
 		 389 aa  354  2e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1152  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.61 
 
 		 413 aa  352  1e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.07 
 
 		 390 aa  351  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  41.94 
 
 		 388 aa  349  5e-95  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4393  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.06 
 
 		 396 aa  347  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0182447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4129  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.32 
 
 		 396 aa  347  3e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  43 
 
 		 390 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  41.48 
 
 		 390 aa  343  2.9999999999999997e-93  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  42.01 
 
 		 397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3331  NADH dehydrogenase subunit D  41.09 
 
 		 416 aa  342  7e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150101  normal  0.101451 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2057  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.56 
 
 		 396 aa  342  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.320233  normal  0.342596 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  43 
 
 		 390 aa  341  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  41.97 
 
 		 406 aa  339  7e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1016  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.07 
 
 		 396 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  40.89 
 
 		 417 aa  337  2.9999999999999997e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  40.99 
 
 		 393 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1211  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.07 
 
 		 396 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1082  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.07 
 
 		 396 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.129082 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2420  NADH dehydrogenase subunit D  43.07 
 
 		 396 aa  334  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1025  NADH dehydrogenase subunit D  43.07 
 
 		 396 aa  335  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1496  NADH dehydrogenase subunit D  40.42 
 
 		 417 aa  333  3e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  40.65 
 
 		 417 aa  333  3e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1885  NADH dehydrogenase subunit D  42.68 
 
 		 402 aa  333  5e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.634993 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2218  NADH dehydrogenase subunit D  42.37 
 
 		 402 aa  332  9e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.714071  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1311  NADH dehydrogenase subunit D  41.55 
 
 		 404 aa  331  2e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00990981  normal  0.0474356 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2004  NADH dehydrogenase subunit D  42.89 
 
 		 402 aa  330  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4630  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.67 
 
 		 402 aa  330  3e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.193494 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2575  NADH dehydrogenase subunit D  41.35 
 
 		 401 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0392469  normal  0.134645 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  40 
 
 		 393 aa  330  3e-89  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2396  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.1 
 
 		 396 aa  330  3e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.213945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2515  NADH dehydrogenase subunit D  42.41 
 
 		 404 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1177  NADH dehydrogenase subunit D  42.41 
 
 		 402 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0744  NADH dehydrogenase subunit D  41.5 
 
 		 403 aa  329  6e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2247  NADH dehydrogenase subunit D  41.79 
 
 		 412 aa  328  9e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0299939  normal  0.120974 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0800  NADH dehydrogenase subunit D  42.57 
 
 		 396 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0805  NADH dehydrogenase subunit D  42.57 
 
 		 396 aa  328  1.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0798929  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  39.95 
 
 		 417 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0781  NADH dehydrogenase subunit D  42.33 
 
 		 396 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.673005  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  41.12 
 
 		 417 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3253  NADH dehydrogenase subunit D  39.49 
 
 		 417 aa  328  2.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.626895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  39.95 
 
 		 417 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2404  NADH dehydrogenase subunit D  42.12 
 
 		 396 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00163945 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2921  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.98 
 
 		 394 aa  327  3e-88  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1262  NADH dehydrogenase subunit D  41.83 
 
 		 396 aa  326  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  40.94 
 
 		 392 aa  326  5e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5799  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.08 
 
 		 396 aa  326  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  39.63 
 
 		 417 aa  326  6e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2884  NADH dehydrogenase subunit D  42.2 
 
 		 416 aa  326  6e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736243  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  39.49 
 
 		 417 aa  326  6e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2059  NADH dehydrogenase subunit D  39.72 
 
 		 417 aa  325  7e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102892  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1406  NADH dehydrogenase subunit D  40.05 
 
 		 417 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0952  NADH dehydrogenase subunit D  40.23 
 
 		 417 aa  325  9e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.597503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4560  NADH dehydrogenase subunit D  41.87 
 
 		 398 aa  325  1e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17714 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  39.49 
 
 		 417 aa  325  1e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2833  NADH dehydrogenase subunit D  41.87 
 
 		 416 aa  325  1e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.371933  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  39.49 
 
 		 417 aa  325  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  39.49 
 
 		 417 aa  325  1e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3297  NADH dehydrogenase subunit D  42.36 
 
 		 402 aa  325  1e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>