More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0541 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4062  NADH dehydrogenase subunit D  70.07 
 
 		 441 aa  641    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.855736  normal  0.069193 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4555  NADH dehydrogenase I, D subunit  72.12 
 
 		 443 aa  652    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6091  NADH dehydrogenase subunit D  91.74 
 
 		 457 aa  828    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.489458  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4460  NADH dehydrogenase subunit D  69.84 
 
 		 441 aa  642    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0541  NADH dehydrogenase subunit D  100 
 
 		 482 aa  982    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.482391  normal  0.20204 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0977  NADH dehydrogenase subunit D  70.9 
 
 		 459 aa  639    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0270  NADH dehydrogenase subunit D  73.65 
 
 		 440 aa  667    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.877752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1277  NADH dehydrogenase I, D subunit  69.14 
 
 		 444 aa  624  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.494921  normal  0.687145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6679  NADH dehydrogenase subunit D  64.85 
 
 		 483 aa  624  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0398  NADH dehydrogenase I, D subunit  70.3 
 
 		 446 aa  619  1e-176  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03190  NADH dehydrogenase subunit D  62.45 
 
 		 460 aa  619  1e-176  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0284  NADH dehydrogenase I subunit D  69.04 
 
 		 438 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0523  NADH dehydrogenase subunit D  68.11 
 
 		 446 aa  612  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1601  NADH dehydrogenase subunit D  67.73 
 
 		 446 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1577  NADH dehydrogenase subunit D  67.73 
 
 		 446 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1547  NADH dehydrogenase subunit D  67.73 
 
 		 446 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.795023  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2692  NADH dehydrogenase subunit D  66.19 
 
 		 434 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4415  NADH dehydrogenase I, D subunit  65.54 
 
 		 449 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7688  NADH dehydrogenase subunit D  68.19 
 
 		 445 aa  603  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  65.6 
 
 		 441 aa  599  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5056  NADH dehydrogenase I, D subunit  66.98 
 
 		 431 aa  590  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1882  NADH dehydrogenase subunit D  66.05 
 
 		 442 aa  590  1e-167  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.303191  normal  0.424323 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13169  NADH dehydrogenase subunit D  65.68 
 
 		 440 aa  588  1e-167  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3171  NADH dehydrogenase I, D subunit  65.65 
 
 		 426 aa  580  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2713  NADH dehydrogenase I, D subunit  66.12 
 
 		 448 aa  574  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4484  NADH dehydrogenase subunit D  64.48 
 
 		 451 aa  571  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00259323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5629  NADH dehydrogenase subunit D  68.63 
 
 		 426 aa  568  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0649561 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3226  NADH dehydrogenase subunit D  66.05 
 
 		 445 aa  561  1e-158  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00372602 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07410  NADH dehydrogenase subunit D  63.47 
 
 		 450 aa  554  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0472  NADH dehydrogenase I, D subunit  63.05 
 
 		 447 aa  544  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0542  NADH dehydrogenase subunit D  61.83 
 
 		 446 aa  525  1e-147  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502265  normal  0.442373 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  55.26 
 
 		 417 aa  453  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  55.64 
 
 		 417 aa  451  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  52.81 
 
 		 417 aa  449  1e-125  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  52.45 
 
 		 411 aa  423  1e-117  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.9 
 
 		 390 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0912  NADH dehydrogenase I, D subunit  51.48 
 
 		 403 aa  403  1e-111  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.53 
 
 		 390 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.91 
 
 		 389 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1152  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.51 
 
 		 413 aa  398  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.67 
 
 		 389 aa  397  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1874  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.88 
 
 		 415 aa  397  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.45 
 
 		 422 aa  392  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.78 
 
 		 401 aa  394  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.79 
 
 		 390 aa  389  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.53 
 
 		 390 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.66 
 
 		 414 aa  383  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  47 
 
 		 388 aa  382  1e-105  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  44.5 
 
 		 417 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  44.23 
 
 		 397 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  43.09 
 
 		 417 aa  369  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  43.09 
 
 		 417 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.34 
 
 		 404 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  46.06 
 
 		 793 aa  368  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0952  NADH dehydrogenase subunit D  43.82 
 
 		 417 aa  368  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.597503 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1504  NADH dehydrogenase subunit D  42.26 
 
 		 417 aa  365  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00434712 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01290  NADH dehydrogenase subunit D  43.12 
 
 		 435 aa  366  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191542  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  44.94 
 
 		 406 aa  367  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  42.15 
 
 		 417 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3331  NADH dehydrogenase subunit D  44 
 
 		 416 aa  364  2e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150101  normal  0.101451 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3253  NADH dehydrogenase subunit D  42.26 
 
 		 417 aa  363  3e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.626895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1496  NADH dehydrogenase subunit D  42.96 
 
 		 417 aa  363  4e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1961  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.86 
 
 		 417 aa  362  7.0000000000000005e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00447389  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0930  NADH dehydrogenase subunit D  41.69 
 
 		 417 aa  362  9e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  42.39 
 
 		 417 aa  362  1e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  42.39 
 
 		 417 aa  361  2e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  43.53 
 
 		 393 aa  360  2e-98  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1967  NADH dehydrogenase subunit D  42.49 
 
 		 417 aa  360  2e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0788296 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0964  NADH dehydrogenase subunit D  41.92 
 
 		 417 aa  359  6e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389115  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  41.34 
 
 		 417 aa  359  7e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  43.33 
 
 		 417 aa  359  8e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  41.34 
 
 		 417 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.68 
 
 		 400 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  42.62 
 
 		 417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  41.11 
 
 		 417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  41.34 
 
 		 417 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  41.11 
 
 		 417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  41.34 
 
 		 417 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0272  NADH dehydrogenase subunit D  42.2 
 
 		 435 aa  356  3.9999999999999996e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0243  NADH dehydrogenase subunit D  41.97 
 
 		 435 aa  357  3.9999999999999996e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  42.73 
 
 		 417 aa  356  5.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  42.73 
 
 		 417 aa  356  5.999999999999999e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  43.53 
 
 		 393 aa  356  6.999999999999999e-97  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  41.11 
 
 		 417 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4129  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.06 
 
 		 396 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  41.34 
 
 		 417 aa  355  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2059  NADH dehydrogenase subunit D  41.69 
 
 		 417 aa  354  2e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102892  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2810  NADH dehydrogenase subunit D  41.11 
 
 		 417 aa  353  2.9999999999999997e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.299965 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1406  NADH dehydrogenase subunit D  40.42 
 
 		 417 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0548  NADH dehydrogenase subunit D  41.78 
 
 		 424 aa  353  2.9999999999999997e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.899987  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2828  NADH dehydrogenase subunit D  41.01 
 
 		 435 aa  353  2.9999999999999997e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1302  NADH dehydrogenase subunit D  40.65 
 
 		 417 aa  353  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0416  NADH dehydrogenase subunit D  40.65 
 
 		 417 aa  353  5e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  40.65 
 
 		 417 aa  353  5e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1826  NADH dehydrogenase subunit D  40.65 
 
 		 417 aa  353  5e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1438  NADH dehydrogenase subunit D  40.65 
 
 		 417 aa  353  5e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0734  NADH dehydrogenase subunit D  40.65 
 
 		 417 aa  353  5e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.301756  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1133  NADH dehydrogenase subunit D  40.65 
 
 		 417 aa  353  5e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154075  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1064  NADH dehydrogenase subunit D  40.65 
 
 		 417 aa  353  5e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240648  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1762  NADH dehydrogenase subunit D  41.8 
 
 		 417 aa  353  5e-96  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>