More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4415 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4415  NADH dehydrogenase I, D subunit  100 
 
 
449 aa  929    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2692  NADH dehydrogenase subunit D  77.46 
 
 
434 aa  691    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4555  NADH dehydrogenase I, D subunit  69.2 
 
 
443 aa  641    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  77.35 
 
 
441 aa  694    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0284  NADH dehydrogenase I subunit D  79.45 
 
 
438 aa  712    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5056  NADH dehydrogenase I, D subunit  75.47 
 
 
431 aa  663    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0398  NADH dehydrogenase I, D subunit  72.03 
 
 
446 aa  640    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0523  NADH dehydrogenase subunit D  69.14 
 
 
446 aa  638    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7688  NADH dehydrogenase subunit D  70.21 
 
 
445 aa  633  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450459  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1882  NADH dehydrogenase subunit D  69.52 
 
 
442 aa  628  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.303191  normal  0.424323 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1277  NADH dehydrogenase I, D subunit  67.41 
 
 
444 aa  627  1e-178  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.494921  normal  0.687145 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1547  NADH dehydrogenase subunit D  70.56 
 
 
446 aa  622  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.795023  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1601  NADH dehydrogenase subunit D  70.56 
 
 
446 aa  622  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13169  NADH dehydrogenase subunit D  67.5 
 
 
440 aa  621  1e-177  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1577  NADH dehydrogenase subunit D  70.56 
 
 
446 aa  622  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4484  NADH dehydrogenase subunit D  68.55 
 
 
451 aa  618  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00259323 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4460  NADH dehydrogenase subunit D  67.43 
 
 
441 aa  620  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4062  NADH dehydrogenase subunit D  67.43 
 
 
441 aa  620  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.855736  normal  0.069193 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3171  NADH dehydrogenase I, D subunit  69.03 
 
 
426 aa  613  9.999999999999999e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0270  NADH dehydrogenase subunit D  69.16 
 
 
440 aa  609  1e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.877752  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6091  NADH dehydrogenase subunit D  67.28 
 
 
457 aa  607  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.489458  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0541  NADH dehydrogenase subunit D  65.54 
 
 
482 aa  603  1.0000000000000001e-171  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.482391  normal  0.20204 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2713  NADH dehydrogenase I, D subunit  67.85 
 
 
448 aa  592  1e-168  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0977  NADH dehydrogenase subunit D  63.99 
 
 
459 aa  574  1.0000000000000001e-163  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3226  NADH dehydrogenase subunit D  66.36 
 
 
445 aa  563  1.0000000000000001e-159  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00372602 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6679  NADH dehydrogenase subunit D  62.16 
 
 
483 aa  563  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03190  NADH dehydrogenase subunit D  60.76 
 
 
460 aa  558  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07410  NADH dehydrogenase subunit D  64.35 
 
 
450 aa  556  1e-157  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0472  NADH dehydrogenase I, D subunit  64.47 
 
 
447 aa  552  1e-156  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5629  NADH dehydrogenase subunit D  66.43 
 
 
426 aa  553  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0649561 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0542  NADH dehydrogenase subunit D  64.15 
 
 
446 aa  539  9.999999999999999e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502265  normal  0.442373 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  52.28 
 
 
417 aa  429  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  52.52 
 
 
417 aa  426  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  50.49 
 
 
411 aa  409  1e-113  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.53 
 
 
417 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1152  NADH dehydrogenase I, D subunit  50.99 
 
 
413 aa  389  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.94 
 
 
390 aa  385  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.34 
 
 
422 aa  387  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.47 
 
 
401 aa  385  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.72 
 
 
390 aa  379  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.99 
 
 
390 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.99 
 
 
390 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.12 
 
 
389 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  46.02 
 
 
388 aa  367  1e-100  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.87 
 
 
389 aa  365  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.06 
 
 
414 aa  366  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0912  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.54 
 
 
403 aa  363  4e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1874  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.3 
 
 
415 aa  360  3e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598165  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.83 
 
 
404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  43.79 
 
 
417 aa  355  1e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  42.15 
 
 
417 aa  350  2e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  43.73 
 
 
406 aa  350  2e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  43.78 
 
 
392 aa  349  4e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4129  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.17 
 
 
396 aa  349  6e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  42.15 
 
 
417 aa  349  6e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  43.56 
 
 
417 aa  348  8e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  42.15 
 
 
417 aa  347  4e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3331  NADH dehydrogenase subunit D  44.28 
 
 
416 aa  346  4e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150101  normal  0.101451 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  41.69 
 
 
417 aa  346  5e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  43.56 
 
 
393 aa  346  5e-94  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  41.69 
 
 
417 aa  346  5e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  43.1 
 
 
397 aa  346  6e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4393  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.81 
 
 
396 aa  345  8e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0182447  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2004  NADH dehydrogenase subunit D  43.53 
 
 
402 aa  345  1e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4630  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.27 
 
 
402 aa  345  1e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.193494 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  42.39 
 
 
417 aa  344  1e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  41.83 
 
 
390 aa  343  2.9999999999999997e-93  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  41.96 
 
 
417 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2515  NADH dehydrogenase subunit D  43.03 
 
 
404 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  41.96 
 
 
417 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5799  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.8 
 
 
396 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143218  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1177  NADH dehydrogenase subunit D  43.03 
 
 
402 aa  343  4e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250747  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1496  NADH dehydrogenase subunit D  41.69 
 
 
417 aa  343  4e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1504  NADH dehydrogenase subunit D  41.45 
 
 
417 aa  343  5e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00434712 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  43.07 
 
 
393 aa  342  8e-93  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.89 
 
 
400 aa  341  1e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  40.75 
 
 
417 aa  341  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3297  NADH dehydrogenase subunit D  43.41 
 
 
402 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3253  NADH dehydrogenase subunit D  40.52 
 
 
417 aa  340  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.626895  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0781  NADH dehydrogenase subunit D  43.81 
 
 
396 aa  341  2e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.673005  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1961  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.92 
 
 
417 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00447389  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1406  NADH dehydrogenase subunit D  41.22 
 
 
417 aa  340  4e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0930  NADH dehydrogenase subunit D  40.75 
 
 
417 aa  339  5e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156514  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01290  NADH dehydrogenase subunit D  40.9 
 
 
435 aa  338  9.999999999999999e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191542  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2057  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.35 
 
 
396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.320233  normal  0.342596 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2810  NADH dehydrogenase subunit D  41.22 
 
 
417 aa  337  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.299965 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1025  NADH dehydrogenase subunit D  43.56 
 
 
396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0805  NADH dehydrogenase subunit D  44.55 
 
 
396 aa  337  2.9999999999999997e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0798929  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1262  NADH dehydrogenase subunit D  44.78 
 
 
396 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0952  NADH dehydrogenase subunit D  42.19 
 
 
417 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.597503 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1967  NADH dehydrogenase subunit D  41.69 
 
 
417 aa  337  2.9999999999999997e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0788296 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0800  NADH dehydrogenase subunit D  44.55 
 
 
396 aa  337  3.9999999999999995e-91  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02414  hypothetical protein similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  42.04 
 
 
475 aa  336  5e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151267 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2420  NADH dehydrogenase subunit D  44.55 
 
 
396 aa  336  5e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0989  NADH dehydrogenase subunit D  42.15 
 
 
417 aa  336  5e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1211  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.32 
 
 
396 aa  336  5e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1082  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.32 
 
 
396 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.129082 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1358  NADH dehydrogenase subunit D  42.57 
 
 
402 aa  336  5.999999999999999e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121379  normal  0.0313197 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0272  NADH dehydrogenase subunit D  41.29 
 
 
435 aa  335  7e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1354  NADH dehydrogenase subunit D  44.55 
 
 
396 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.937388  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>