More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5629 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5629  NADH dehydrogenase subunit D  100 
 
 		 426 aa  863    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0649561 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1547  NADH dehydrogenase subunit D  73.02 
 
 		 446 aa  615  1e-175  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.795023  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1601  NADH dehydrogenase subunit D  73.02 
 
 		 446 aa  615  1e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1577  NADH dehydrogenase subunit D  73.02 
 
 		 446 aa  615  1e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4555  NADH dehydrogenase I, D subunit  70.52 
 
 		 443 aa  613  9.999999999999999e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0398  NADH dehydrogenase I, D subunit  69.58 
 
 		 446 aa  610  1e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2692  NADH dehydrogenase subunit D  67.37 
 
 		 434 aa  604  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5056  NADH dehydrogenase I, D subunit  68.63 
 
 		 431 aa  605  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7688  NADH dehydrogenase subunit D  68.85 
 
 		 445 aa  603  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1882  NADH dehydrogenase subunit D  68.38 
 
 		 442 aa  602  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.303191  normal  0.424323 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3171  NADH dehydrogenase I, D subunit  67.22 
 
 		 426 aa  598  1e-170  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0284  NADH dehydrogenase I subunit D  68.69 
 
 		 438 aa  599  1e-170  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0270  NADH dehydrogenase subunit D  68.47 
 
 		 440 aa  596  1e-169  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.877752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13169  NADH dehydrogenase subunit D  67.22 
 
 		 440 aa  592  1e-168  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6091  NADH dehydrogenase subunit D  68.87 
 
 		 457 aa  593  1e-168  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.489458  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0541  NADH dehydrogenase subunit D  68.63 
 
 		 482 aa  590  1e-167  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.482391  normal  0.20204 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4484  NADH dehydrogenase subunit D  67.97 
 
 		 451 aa  588  1e-167  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00259323 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0523  NADH dehydrogenase subunit D  66.04 
 
 		 446 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4415  NADH dehydrogenase I, D subunit  66.43 
 
 		 449 aa  578  1e-164  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1277  NADH dehydrogenase I, D subunit  67.61 
 
 		 444 aa  579  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.494921  normal  0.687145 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4460  NADH dehydrogenase subunit D  65.09 
 
 		 441 aa  570  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0587  NADH dehydrogenase (quinone)  65.42 
 
 		 441 aa  569  1e-161  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4062  NADH dehydrogenase subunit D  64.15 
 
 		 441 aa  566  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.855736  normal  0.069193 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0977  NADH dehydrogenase subunit D  65.88 
 
 		 459 aa  566  1e-160  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03190  NADH dehydrogenase subunit D  64.39 
 
 		 460 aa  563  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6679  NADH dehydrogenase subunit D  64.94 
 
 		 483 aa  560  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2713  NADH dehydrogenase I, D subunit  64 
 
 		 448 aa  551  1e-156  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3226  NADH dehydrogenase subunit D  64.65 
 
 		 445 aa  545  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00372602 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07410  NADH dehydrogenase subunit D  63.47 
 
 		 450 aa  543  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.977582  normal  0.014911 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0472  NADH dehydrogenase I, D subunit  63.23 
 
 		 447 aa  537  1e-151  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0542  NADH dehydrogenase subunit D  61.36 
 
 		 446 aa  518  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502265  normal  0.442373 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.03 
 
 		 417 aa  412  1e-114  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  53.01 
 
 		 417 aa  412  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  53.68 
 
 		 417 aa  410  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  50.61 
 
 		 411 aa  400  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.77 
 
 		 390 aa  391  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.65 
 
 		 401 aa  388  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.06 
 
 		 390 aa  383  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.8 
 
 		 389 aa  379  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1874  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.57 
 
 		 415 aa  379  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598165  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.29 
 
 		 390 aa  376  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.31 
 
 		 389 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.59 
 
 		 422 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.04 
 
 		 390 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0912  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.27 
 
 		 403 aa  374  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1152  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.3 
 
 		 413 aa  370  1e-101  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.32 
 
 		 414 aa  366  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  44.96 
 
 		 406 aa  356  5e-97  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01290  NADH dehydrogenase subunit D  44.16 
 
 		 435 aa  356  5e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191542  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2027  NADH dehydrogenase subunit D  43.46 
 
 		 436 aa  356  5e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  43.56 
 
 		 397 aa  356  5.999999999999999e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0243  NADH dehydrogenase subunit D  43.46 
 
 		 435 aa  355  7.999999999999999e-97  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  44.25 
 
 		 388 aa  355  1e-96  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  43.78 
 
 		 390 aa  354  2e-96  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0272  NADH dehydrogenase subunit D  43.46 
 
 		 435 aa  354  2e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.05 
 
 		 404 aa  349  6e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2828  NADH dehydrogenase subunit D  42.76 
 
 		 435 aa  348  1e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  43.78 
 
 		 393 aa  347  2e-94  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3331  NADH dehydrogenase subunit D  43.75 
 
 		 416 aa  347  3e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150101  normal  0.101451 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  43.46 
 
 		 417 aa  346  4e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1406  NADH dehydrogenase subunit D  42.46 
 
 		 417 aa  345  1e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  42.52 
 
 		 417 aa  344  1e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3253  NADH dehydrogenase subunit D  42.23 
 
 		 417 aa  345  1e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.626895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  42.62 
 
 		 417 aa  344  2e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  42.62 
 
 		 417 aa  344  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  44.14 
 
 		 392 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1496  NADH dehydrogenase subunit D  42 
 
 		 417 aa  343  4e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  42.46 
 
 		 417 aa  342  8e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  44.06 
 
 		 417 aa  341  1e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  43.46 
 
 		 417 aa  341  1e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  44.06 
 
 		 417 aa  341  1e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  43.03 
 
 		 393 aa  340  2e-92  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02414  hypothetical protein similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  42.89 
 
 		 475 aa  340  2.9999999999999998e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151267 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.73 
 
 		 400 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1961  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.82 
 
 		 417 aa  339  5.9999999999999996e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00447389  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1967  NADH dehydrogenase subunit D  42.76 
 
 		 417 aa  339  7e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0788296 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  44.72 
 
 		 794 aa  338  8e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1025  NADH dehydrogenase subunit D  44.06 
 
 		 396 aa  338  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  42.15 
 
 		 417 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4129  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.82 
 
 		 396 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  41.82 
 
 		 417 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1094  NADH dehydrogenase subunit D  42.06 
 
 		 417 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.402289  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0989  NADH dehydrogenase subunit D  43.22 
 
 		 417 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1504  NADH dehydrogenase subunit D  41.3 
 
 		 417 aa  336  5e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00434712 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3297  NADH dehydrogenase subunit D  44.58 
 
 		 402 aa  336  5e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0711  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.89 
 
 		 417 aa  336  5.999999999999999e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.577358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1354  NADH dehydrogenase subunit D  44.06 
 
 		 396 aa  335  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.937388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  41.3 
 
 		 417 aa  334  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  41.3 
 
 		 417 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1715  NADH dehydrogenase subunit D  44.09 
 
 		 396 aa  333  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1262  NADH dehydrogenase subunit D  44.06 
 
 		 396 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  41.3 
 
 		 417 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  41.3 
 
 		 417 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  41.3 
 
 		 417 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4630  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.63 
 
 		 402 aa  333  3e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.193494 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  42.15 
 
 		 417 aa  333  5e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2833  NADH dehydrogenase subunit D  41.36 
 
 		 417 aa  332  6e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0548  NADH dehydrogenase subunit D  41.55 
 
 		 424 aa  332  6e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.899987  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2420  NADH dehydrogenase subunit D  44.8 
 
 		 396 aa  332  7.000000000000001e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  41.3 
 
 		 417 aa  332  8e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>