More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0886 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0886  NADH dehydrogenase subunit D  100 
 
 		 369 aa  754    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.802693  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1221  NADH dehydrogenase subunit D  68.02 
 
 		 367 aa  523  1e-147  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.240217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1602  NADH dehydrogenase subunit D  65.58 
 
 		 368 aa  510  1e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1737  NADH dehydrogenase subunit D  65.85 
 
 		 367 aa  501  1e-141  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.960022  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0375  NADH dehydrogenase (quinone)  48.55 
 
 		 375 aa  368  1e-101  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2206  NADH dehydrogenase subunit D  44.02 
 
 		 391 aa  310  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258074 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  37.5 
 
 		 366 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6679  NADH dehydrogenase subunit D  35.25 
 
 		 483 aa  234  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3409  F420H2 dehydrogenase subunit D  35.12 
 
 		 374 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.170957  normal  0.90197 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4983  NADH dehydrogenase (quinone)  35.31 
 
 		 370 aa  232  8.000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173613  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4555  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.5 
 
 		 443 aa  229  8e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03190  NADH dehydrogenase subunit D  36.07 
 
 		 460 aa  228  9e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1294  F420H2 dehydrogenase subunit D  34.32 
 
 		 374 aa  228  1e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.196635  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1628  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.68 
 
 		 369 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.963572  normal  0.66391 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6091  NADH dehydrogenase subunit D  34.98 
 
 		 457 aa  226  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.489458  normal  0.0112827 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0977  NADH dehydrogenase subunit D  36.07 
 
 		 459 aa  226  6e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0202  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  36.54 
 
 		 373 aa  225  9e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2992  NADH dehydrogenase (quinone)  33.87 
 
 		 374 aa  225  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.9 
 
 		 417 aa  224  2e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2420  NADH dehydrogenase subunit D  32.32 
 
 		 396 aa  224  3e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  34.69 
 
 		 367 aa  223  4e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0744  NADH dehydrogenase subunit D  32.14 
 
 		 403 aa  223  4e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.81 
 
 		 404 aa  222  6e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2091  NADH dehydrogenase (quinone)  33.6 
 
 		 374 aa  222  7e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.42 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2515  NADH dehydrogenase subunit D  31.79 
 
 		 404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2396  NADH dehydrogenase I, D subunit  31.3 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.213945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1177  NADH dehydrogenase subunit D  31.79 
 
 		 402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1631  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  38.78 
 
 		 358 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0284  NADH dehydrogenase I subunit D  35.47 
 
 		 438 aa  220  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2713  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.52 
 
 		 448 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2004  NADH dehydrogenase subunit D  31.79 
 
 		 402 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3226  NADH dehydrogenase subunit D  34.96 
 
 		 445 aa  219  6e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00372602 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0800  NADH dehydrogenase subunit D  31.98 
 
 		 396 aa  219  6e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  32.31 
 
 		 390 aa  219  7.999999999999999e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0805  NADH dehydrogenase subunit D  31.39 
 
 		 396 aa  218  8.999999999999998e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0798929  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2921  NADH dehydrogenase I, D subunit  30.28 
 
 		 394 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  31.68 
 
 		 406 aa  218  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.9 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1354  NADH dehydrogenase subunit D  30.13 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.937388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.59 
 
 		 400 aa  217  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0781  NADH dehydrogenase subunit D  31.57 
 
 		 396 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.673005  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1262  NADH dehydrogenase subunit D  30.03 
 
 		 396 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2692  NADH dehydrogenase subunit D  33.93 
 
 		 434 aa  216  4e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  33.93 
 
 		 397 aa  216  4e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1897  NADH dehydrogenase subunit D  32.73 
 
 		 405 aa  216  5e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.412503  normal  0.283556 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1173  NADH dehydrogenase subunit D  31.12 
 
 		 412 aa  216  5e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.313794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1311  NADH dehydrogenase subunit D  31.79 
 
 		 404 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00990981  normal  0.0474356 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1025  NADH dehydrogenase subunit D  30.71 
 
 		 396 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  35.34 
 
 		 367 aa  216  7e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02414  hypothetical protein similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  33.59 
 
 		 475 aa  215  8e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151267 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1561  NADH dehydrogenase subunit D  34.38 
 
 		 408 aa  214  9.999999999999999e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0422295  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  33.42 
 
 		 392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.68 
 
 		 414 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1277  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.15 
 
 		 444 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.494921  normal  0.687145 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  35.07 
 
 		 367 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1747  NADH dehydrogenase subunit D  34.38 
 
 		 408 aa  213  3.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2575  NADH dehydrogenase subunit D  31.04 
 
 		 401 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0392469  normal  0.134645 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5056  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.25 
 
 		 431 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  33.65 
 
 		 417 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  33.65 
 
 		 417 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2057  NADH dehydrogenase I, D subunit  30.03 
 
 		 396 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.320233  normal  0.342596 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0270  NADH dehydrogenase subunit D  36.44 
 
 		 440 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.877752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1927  NADH dehydrogenase subunit D  34.38 
 
 		 408 aa  211  1e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.371072  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.79 
 
 		 367 aa  212  1e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2884  NADH dehydrogenase subunit D  30.53 
 
 		 416 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736243  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1379  NADH dehydrogenase I chain D  33.67 
 
 		 393 aa  211  1e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0236876  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1357  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  36.26 
 
 		 587 aa  211  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  31.73 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0980  NADH dehydrogenase subunit D  32.88 
 
 		 371 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  30.91 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4415  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.66 
 
 		 449 aa  211  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  32.69 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  31.87 
 
 		 390 aa  210  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02730  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  31.88 
 
 		 452 aa  210  3e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5101  NADH dehydrogenase (quinone)  33.93 
 
 		 410 aa  209  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  31.87 
 
 		 390 aa  210  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  33.57 
 
 		 417 aa  210  4e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1874  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.32 
 
 		 415 aa  210  4e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0891  NADH dehydrogenase subunit D  29.52 
 
 		 396 aa  209  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.984899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0398  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.46 
 
 		 446 aa  209  6e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1125  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  34.76 
 
 		 593 aa  209  7e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.64928  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3748  NADH dehydrogenase (quinone)  33.42 
 
 		 370 aa  209  9e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000362019  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  33.89 
 
 		 417 aa  208  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1715  NADH dehydrogenase subunit D  28.86 
 
 		 396 aa  208  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.64 
 
 		 389 aa  208  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1211  NADH dehydrogenase I, D subunit  29.77 
 
 		 396 aa  208  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1082  NADH dehydrogenase I, D subunit  29.77 
 
 		 396 aa  208  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.129082 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3223  NADH dehydrogenase I, D subunit  31.36 
 
 		 392 aa  208  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0966966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1882  NADH dehydrogenase subunit D  33.76 
 
 		 442 aa  208  1e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.303191  normal  0.424323 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.38 
 
 		 389 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  31.73 
 
 		 417 aa  207  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4393  NADH dehydrogenase I, D subunit  30.03 
 
 		 396 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0182447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4129  NADH dehydrogenase I, D subunit  29.52 
 
 		 396 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0541  NADH dehydrogenase subunit D  33.75 
 
 		 482 aa  207  2e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.482391  normal  0.20204 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  31.73 
 
 		 417 aa  207  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1016  NADH dehydrogenase I, D subunit  29.52 
 
 		 396 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0964  NADH dehydrogenase subunit D  33.57 
 
 		 417 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389115  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68160  NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor  32.56 
 
 		 474 aa  207  3e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7688  NADH dehydrogenase subunit D  32.26 
 
 		 445 aa  207  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.450459  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>