More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0428 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0428  NADH dehydrogenase subunit D  100 
 
 		 424 aa  861    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.366275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1897  NADH dehydrogenase subunit D  50.53 
 
 		 405 aa  381  1e-104  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.412503  normal  0.283556 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1634  NADH dehydrogenase subunit D  50 
 
 		 402 aa  375  1e-103  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0659  NADH dehydrogenase subunit D  48.96 
 
 		 402 aa  374  1e-102  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1300  NADH dehydrogenase (quinone)  50 
 
 		 410 aa  367  1e-100  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.823444  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2120  NADH dehydrogenase subunit D  48.7 
 
 		 407 aa  362  1e-98  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0514  NADH dehydrogenase subunit D  49.22 
 
 		 405 aa  358  8e-98  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1081  NADH dehydrogenase subunit D  46.74 
 
 		 404 aa  352  7e-96  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.152309  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2272  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  46.34 
 
 		 406 aa  350  2e-95  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.242862 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2045  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  45.04 
 
 		 406 aa  345  1e-93  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0264179 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0331  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  46.21 
 
 		 407 aa  341  1e-92  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.925888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1790  NADH dehydrogenase (quinone)  46.74 
 
 		 407 aa  330  2e-89  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.442089  normal  0.696133 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0279  NADH dehydrogenase  40.94 
 
 		 378 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000160652 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  38.62 
 
 		 366 aa  266  4e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  39.02 
 
 		 367 aa  259  7e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0202  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  38.02 
 
 		 373 aa  253  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1961  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.14 
 
 		 417 aa  246  4e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00447389  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.81 
 
 		 400 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  35.7 
 
 		 393 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  35.7 
 
 		 392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2562  NADH dehydrogenase subunit D  35.44 
 
 		 417 aa  243  3e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  35.17 
 
 		 393 aa  243  5e-63  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1048  NADH dehydrogenase subunit D  34.84 
 
 		 417 aa  240  2.9999999999999997e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  35.35 
 
 		 417 aa  239  8e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4518  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.99 
 
 		 415 aa  238  1e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  36.83 
 
 		 367 aa  238  2e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1094  NADH dehydrogenase subunit D  35.42 
 
 		 417 aa  238  2e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.402289  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5101  NADH dehydrogenase (quinone)  35.53 
 
 		 410 aa  237  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1737  NADH dehydrogenase subunit D  36.29 
 
 		 367 aa  237  3e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.960022  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  36.32 
 
 		 367 aa  237  4e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3211  NADH dehydrogenase subunit D  34.7 
 
 		 417 aa  236  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0824  NADH dehydrogenase subunit D  34.62 
 
 		 417 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1118  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  36.98 
 
 		 592 aa  236  6e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.374283  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  34.12 
 
 		 388 aa  236  7e-61  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  34.38 
 
 		 390 aa  236  8e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.06 
 
 		 367 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1064  NADH dehydrogenase subunit D  34.06 
 
 		 417 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240648  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2300  NADH dehydrogenase subunit D  34.87 
 
 		 403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  33.98 
 
 		 417 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  34.38 
 
 		 417 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.5 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  33.98 
 
 		 417 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  33.73 
 
 		 417 aa  234  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  33.73 
 
 		 417 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1346  NADH dehydrogenase subunit D  34.22 
 
 		 417 aa  234  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00313693  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  33.73 
 
 		 417 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1614  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.94 
 
 		 414 aa  233  4.0000000000000004e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2006  NADH dehydrogenase subunit D  33.98 
 
 		 417 aa  233  5e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000196393  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  34.38 
 
 		 417 aa  232  7.000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  33.73 
 
 		 417 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2985  NADH dehydrogenase subunit D  35.4 
 
 		 406 aa  233  7.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0128464  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  33.98 
 
 		 417 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.52 
 
 		 404 aa  232  8.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1826  NADH dehydrogenase subunit D  33.82 
 
 		 417 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0416  NADH dehydrogenase subunit D  33.82 
 
 		 417 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1438  NADH dehydrogenase subunit D  33.82 
 
 		 417 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1133  NADH dehydrogenase subunit D  33.82 
 
 		 417 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154075  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  34.94 
 
 		 417 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  33.82 
 
 		 417 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0734  NADH dehydrogenase subunit D  33.82 
 
 		 417 aa  232  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.301756  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1302  NADH dehydrogenase subunit D  33.82 
 
 		 417 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0711  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.78 
 
 		 417 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.577358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01290  NADH dehydrogenase subunit D  33.11 
 
 		 435 aa  231  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191542  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0744  NADH dehydrogenase subunit D  35.94 
 
 		 403 aa  231  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1967  NADH dehydrogenase subunit D  34.3 
 
 		 417 aa  231  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0788296 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0930  NADH dehydrogenase subunit D  34.22 
 
 		 417 aa  231  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0989  NADH dehydrogenase subunit D  35.51 
 
 		 417 aa  231  3e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2059  NADH dehydrogenase subunit D  34.14 
 
 		 417 aa  230  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102892  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  35.44 
 
 		 417 aa  230  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4983  NADH dehydrogenase (quinone)  33.68 
 
 		 370 aa  230  4e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173613  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0716  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  35.52 
 
 		 601 aa  230  4e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1762  NADH dehydrogenase subunit D  34.14 
 
 		 417 aa  230  4e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  33.85 
 
 		 397 aa  230  5e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1596  NADH dehydrogenase (quinone)  35.97 
 
 		 406 aa  229  6e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.77 
 
 		 390 aa  229  8e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.14 
 
 		 381 aa  229  8e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.950756 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02414  hypothetical protein similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  34.62 
 
 		 475 aa  228  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151267 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  33.85 
 
 		 406 aa  228  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3823  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  35.04 
 
 		 580 aa  228  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.203539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2027  NADH dehydrogenase subunit D  34.06 
 
 		 436 aa  227  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127355  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2702  NADH dehydrogenase subunit D  33.98 
 
 		 417 aa  227  4e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0964  NADH dehydrogenase subunit D  33.49 
 
 		 417 aa  227  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389115  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1602  NADH dehydrogenase subunit D  34.97 
 
 		 368 aa  226  4e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.55 
 
 		 390 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0548  NADH dehydrogenase subunit D  34.78 
 
 		 424 aa  226  5.0000000000000005e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.899987  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.55 
 
 		 390 aa  226  6e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1888  NADH dehydrogenase subunit D  33.9 
 
 		 417 aa  226  6e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2211  NADH dehydrogenase subunit D  33.9 
 
 		 417 aa  226  6e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.518232 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3223  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.01 
 
 		 392 aa  226  7e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0966966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  35.25 
 
 		 794 aa  225  9e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0746  NADH dehydrogenase (quinone)  35.49 
 
 		 399 aa  226  9e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343389 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1615  NADH dehydrogenase subunit D  34.3 
 
 		 417 aa  225  1e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0833647  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3507  NADH dehydrogenase subunit D  34.54 
 
 		 417 aa  225  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.42 
 
 		 414 aa  225  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2833  NADH dehydrogenase subunit D  33.5 
 
 		 417 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  32.69 
 
 		 417 aa  224  2e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68160  NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor  33.33 
 
 		 474 aa  224  2e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0483  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.85 
 
 		 426 aa  224  3e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2992  NADH dehydrogenase (quinone)  34.19 
 
 		 374 aa  224  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0980  NADH dehydrogenase subunit D  36.67 
 
 		 371 aa  223  4.9999999999999996e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>