More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2045 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2272  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  79.8 
 
 		 406 aa  676    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.242862 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1790  NADH dehydrogenase (quinone)  79.26 
 
 		 407 aa  662    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.442089  normal  0.696133 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2045  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  100 
 
 		 406 aa  820    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0264179 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0331  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  76.67 
 
 		 407 aa  662    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.925888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1897  NADH dehydrogenase subunit D  46.72 
 
 		 405 aa  352  1e-95  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.412503  normal  0.283556 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1634  NADH dehydrogenase subunit D  46.08 
 
 		 402 aa  347  2e-94  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2120  NADH dehydrogenase subunit D  47.39 
 
 		 407 aa  347  3e-94  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0659  NADH dehydrogenase subunit D  46.85 
 
 		 402 aa  346  3e-94  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0428  NADH dehydrogenase subunit D  45.04 
 
 		 424 aa  345  8.999999999999999e-94  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.366275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0514  NADH dehydrogenase subunit D  45.82 
 
 		 405 aa  334  1e-90  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1300  NADH dehydrogenase (quinone)  45.93 
 
 		 410 aa  332  7.000000000000001e-90  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.823444  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1081  NADH dehydrogenase subunit D  43.16 
 
 		 404 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.152309  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0279  NADH dehydrogenase  40.11 
 
 		 378 aa  290  4e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000160652 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3020  ech hydrogenase subunit E  35.87 
 
 		 359 aa  233  5e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2155  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.77 
 
 		 441 aa  230  3e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1086  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  37.27 
 
 		 359 aa  223  4e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00746179  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1631  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  36.64 
 
 		 358 aa  219  6e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.06 
 
 		 390 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1734  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  33.24 
 
 		 359 aa  216  7e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00563551  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.68 
 
 		 404 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0028  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  35.44 
 
 		 359 aa  209  6e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.51 
 
 		 390 aa  209  7e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.76 
 
 		 401 aa  209  7e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  32.64 
 
 		 388 aa  206  5e-52  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.85 
 
 		 390 aa  206  6e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.33 
 
 		 390 aa  206  9e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  33.25 
 
 		 367 aa  204  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  33.42 
 
 		 406 aa  204  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  31.35 
 
 		 390 aa  203  5e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.55 
 
 		 389 aa  203  6e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0202  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  33.42 
 
 		 373 aa  202  6e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3409  F420H2 dehydrogenase subunit D  33.07 
 
 		 374 aa  202  9e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.170957  normal  0.90197 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3223  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.99 
 
 		 392 aa  202  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0966966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.42 
 
 		 367 aa  202  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.56 
 
 		 411 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.03 
 
 		 389 aa  200  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1308  NADH dehydrogenase subunit D  33.86 
 
 		 418 aa  200  3e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0360  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  33.06 
 
 		 359 aa  201  3e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3367  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  32.07 
 
 		 359 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4518  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.04 
 
 		 415 aa  199  5e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1243  NADH dehydrogenase (quinone)  32.99 
 
 		 412 aa  199  7.999999999999999e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  31.03 
 
 		 366 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  32.38 
 
 		 367 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  32.81 
 
 		 393 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1221  NADH dehydrogenase subunit D  31.68 
 
 		 367 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.240217  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2728  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  32.97 
 
 		 359 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.316127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2562  NADH dehydrogenase subunit D  31.64 
 
 		 417 aa  196  5.000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  31.69 
 
 		 417 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1294  F420H2 dehydrogenase subunit D  31.44 
 
 		 374 aa  196  6e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.196635  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2505  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  34.89 
 
 		 358 aa  196  7e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1602  NADH dehydrogenase subunit D  31.66 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.05 
 
 		 400 aa  195  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2247  NADH dehydrogenase subunit D  31.96 
 
 		 412 aa  195  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0299939  normal  0.120974 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  30.26 
 
 		 417 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02414  hypothetical protein similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  31.36 
 
 		 475 aa  194  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151267 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  32.03 
 
 		 393 aa  194  2e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0785  ech hydrogenase subunit E  35.37 
 
 		 359 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0744  NADH dehydrogenase subunit D  32.56 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  31.61 
 
 		 392 aa  194  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1669  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  33.24 
 
 		 360 aa  194  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1102  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  34.07 
 
 		 358 aa  193  4e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0803  NADH dehydrogenase (quinone)  31.79 
 
 		 359 aa  193  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2985  NADH dehydrogenase subunit D  33.16 
 
 		 406 aa  192  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0128464  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_002936  DET0867  hydrogenase, group 4, EchE subunit, putative  35.31 
 
 		 359 aa  192  7e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.195553  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3298  NADH dehydrogenase subunit D  31.13 
 
 		 366 aa  192  8e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_770  hydrogenase, EchE subunit  34.84 
 
 		 359 aa  192  8e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1615  NADH dehydrogenase subunit D  30.43 
 
 		 417 aa  192  1e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0833647  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0548  NADH dehydrogenase subunit D  30.77 
 
 		 424 aa  192  1e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.899987  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3823  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  30.13 
 
 		 580 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.203539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2004  NADH dehydrogenase subunit D  31.78 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2833  NADH dehydrogenase subunit D  33.16 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.371933  normal  0.138606 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3410  NADH dehydrogenase subunit D  31.4 
 
 		 367 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2515  NADH dehydrogenase subunit D  31.78 
 
 		 404 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0980  NADH dehydrogenase subunit D  34.84 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  30.26 
 
 		 417 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2575  NADH dehydrogenase subunit D  31.38 
 
 		 401 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0392469  normal  0.134645 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2921  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.39 
 
 		 394 aa  191  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0553  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  34.62 
 
 		 358 aa  191  2e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4393  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.56 
 
 		 396 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0182447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1173  NADH dehydrogenase subunit D  31.6 
 
 		 412 aa  190  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.313794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2884  NADH dehydrogenase subunit D  31.12 
 
 		 416 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736243  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1177  NADH dehydrogenase subunit D  31.78 
 
 		 402 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2414  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  31.51 
 
 		 593 aa  190  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0246987  normal  0.2214 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  30.67 
 
 		 367 aa  189  5e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0716  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  29.95 
 
 		 601 aa  189  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  30.99 
 
 		 794 aa  188  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13380  ech hydrogenase subunit E  30.65 
 
 		 362 aa  189  1e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  31.27 
 
 		 414 aa  189  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1871  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  31.77 
 
 		 593 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.200942 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  31.4 
 
 		 397 aa  188  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5799  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.56 
 
 		 396 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.143218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0148  ech hydrogenase subunit E  31.08 
 
 		 358 aa  187  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3693  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  31.77 
 
 		 593 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1614  NADH dehydrogenase I, D subunit  31.7 
 
 		 414 aa  187  2e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4129  NADH dehydrogenase I, D subunit  31.79 
 
 		 396 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1311  NADH dehydrogenase subunit D  31.78 
 
 		 404 aa  188  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00990981  normal  0.0474356 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5418  NADH dehydrogenase subunit D  30.96 
 
 		 366 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1522  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  34.92 
 
 		 358 aa  187  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3199  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  31.51 
 
 		 593 aa  187  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.415002  normal  0.0311953 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5532  NADH dehydrogenase subunit D  30.96 
 
 		 366 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277354 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>