More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_13380 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_13380  ech hydrogenase subunit E  100 
 
 
362 aa  744    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1574  NADH dehydrogenase (quinone)  72.65 
 
 
362 aa  559  1e-158  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.443946 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07260  ech hydrogenase subunit E  66.3 
 
 
362 aa  509  1e-143  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0794783  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3020  ech hydrogenase subunit E  59.67 
 
 
359 aa  451  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1734  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  59.12 
 
 
359 aa  439  9.999999999999999e-123  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00563551  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1086  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  56.91 
 
 
359 aa  423  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00746179  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3367  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  55.15 
 
 
359 aa  414  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2728  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  54.97 
 
 
359 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.316127  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0803  NADH dehydrogenase (quinone)  54.97 
 
 
359 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0028  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  54.7 
 
 
359 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1522  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  53.63 
 
 
358 aa  393  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0360  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  54.14 
 
 
359 aa  391  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4118  NADH dehydrogenase (quinone)  55.87 
 
 
358 aa  388  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433928  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1745  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  52.21 
 
 
359 aa  388  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.364735  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2505  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  53.89 
 
 
358 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1669  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  51.52 
 
 
360 aa  373  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1102  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  49.02 
 
 
358 aa  360  2e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0553  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  48.62 
 
 
358 aa  348  1e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0148  ech hydrogenase subunit E  46.8 
 
 
358 aa  346  4e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0867  hydrogenase, group 4, EchE subunit, putative  49.58 
 
 
359 aa  344  1e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.195553  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0785  ech hydrogenase subunit E  48.75 
 
 
359 aa  339  4e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_770  hydrogenase, EchE subunit  49.03 
 
 
359 aa  339  5e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1071  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  41.6 
 
 
537 aa  299  5e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0595  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  41.64 
 
 
409 aa  276  3e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3524  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  39.94 
 
 
409 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2227  NADH dehydrogenase (quinone)  39.62 
 
 
419 aa  263  3e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0316  NADH-ubiquinone oxidoreductase  39.94 
 
 
561 aa  259  4e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.371145  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0959  membrane bound hydrogenase subunit mbhL  37.07 
 
 
406 aa  251  1e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.105572  normal  0.5876 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1130  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  39.39 
 
 
402 aa  250  2e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0183  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  37.71 
 
 
567 aa  239  5e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0675  NADH dehydrogenase (quinone)  36.19 
 
 
414 aa  238  1e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2186  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  38.44 
 
 
574 aa  238  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2590  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  36.39 
 
 
409 aa  237  3e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1425  ech hydrogenase subunit E  36.03 
 
 
361 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0964  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  38.44 
 
 
366 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.138643 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2786  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  37.88 
 
 
557 aa  227  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2794  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  37.88 
 
 
557 aa  227  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1885  NADH dehydrogenase (quinone)  34.99 
 
 
360 aa  226  6e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3189  NADH dehydrogenase (quinone)  36.13 
 
 
377 aa  225  7e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.482242 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4501  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  34.35 
 
 
361 aa  220  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0565202 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0127  hydrogenase-4 component G  34.99 
 
 
582 aa  220  3e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.548953  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2430  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  35.64 
 
 
567 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85735  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1197  NADH dehydrogenase (quinone)  35.67 
 
 
362 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.450071  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0371  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  37.29 
 
 
378 aa  216  5e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3709  hydrogenase-4, G subunit  34.81 
 
 
571 aa  212  7e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2105  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  33.98 
 
 
361 aa  212  7e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2634  hydrogenase-4, G subunit  34.81 
 
 
571 aa  212  7e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3409  F420H2 dehydrogenase subunit D  34.15 
 
 
374 aa  212  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.170957  normal  0.90197 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2769  hydrogenase-4, G subunit  34.81 
 
 
571 aa  211  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4570  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  34.07 
 
 
571 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2713  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  35.26 
 
 
575 aa  211  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1280  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  35.71 
 
 
575 aa  210  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.637418  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0069  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  34.53 
 
 
359 aa  209  7e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2859  hydrogenase-4, G subunit  34.53 
 
 
571 aa  209  8e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3036  formate hydrogenlyase subunit E  34.7 
 
 
569 aa  208  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143989 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3159  formate hydrogenlyase, subunit E  34.7 
 
 
569 aa  208  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.146854 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2970  formate hydrogenlyase, subunit E  34.7 
 
 
569 aa  208  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3001  formate hydrogenlyase subunit E  34.7 
 
 
569 aa  208  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.33609  normal  0.016492 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3052  formate hydrogenlyase subunit E  34.7 
 
 
569 aa  208  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.309808 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1866  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  34.45 
 
 
579 aa  208  9e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02571  hydrogenase 3, large subunit  34.43 
 
 
569 aa  208  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.671666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0968  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  34.43 
 
 
569 aa  208  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02536  hypothetical protein  34.43 
 
 
569 aa  208  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.576982  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3972  formate hydrogenlyase, subunit E  34.43 
 
 
576 aa  208  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3009  formate hydrogenlyase, subunit E  34.43 
 
 
569 aa  208  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0991  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  34.43 
 
 
569 aa  208  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0591467 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2857  formate hydrogenlyase, subunit E  34.43 
 
 
569 aa  208  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2846  formate hydrogenlyase, subunit E  34.43 
 
 
576 aa  208  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.15789 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3155  formate hydrogenlyase, subunit E  34.15 
 
 
569 aa  207  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3194  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  34.43 
 
 
569 aa  206  4e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0773  NADH dehydrogenase (quinone)  33.8 
 
 
378 aa  204  1e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.597938  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0707  NADH dehydrogenase (quinone)  33.7 
 
 
375 aa  202  5e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1294  F420H2 dehydrogenase subunit D  32.6 
 
 
374 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.196635  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0116  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  33.7 
 
 
376 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1211  NADH dehydrogenase (quinone)  33.52 
 
 
375 aa  200  3e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1052  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  34.35 
 
 
390 aa  200  3e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.718525  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02379  hydrogenase 4, subunit  33.61 
 
 
555 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1182  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  33.61 
 
 
555 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1189  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  33.61 
 
 
555 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.454918 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02341  hypothetical protein  33.61 
 
 
555 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3748  NADH dehydrogenase (quinone)  33.71 
 
 
370 aa  199  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000362019  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1635  phage integrase family site specific recombinase  33.15 
 
 
578 aa  199  9e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0144556  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0711  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33.42 
 
 
578 aa  199  9e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0105954  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0473  NADH dehydrogenase (quinone)  34.52 
 
 
375 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.330146  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2621  hydrogenase-4, G subunit  33.33 
 
 
555 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  31.66 
 
 
401 aa  196  5.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00990  Ni,Fe-hydrogenase III large subunit  33.33 
 
 
576 aa  195  9e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  34.29 
 
 
366 aa  195  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0912  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.16 
 
 
403 aa  191  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0331  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  31.45 
 
 
407 aa  191  1e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.925888  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  33.81 
 
 
367 aa  191  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2091  NADH dehydrogenase (quinone)  33.15 
 
 
374 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0401  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  32.33 
 
 
375 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0434  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  33.79 
 
 
375 aa  189  8e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.706219  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2045  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  30.65 
 
 
406 aa  189  8e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0264179 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1518  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  32.05 
 
 
375 aa  187  2e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.100115  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2992  NADH dehydrogenase (quinone)  33.06 
 
 
374 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4983  NADH dehydrogenase (quinone)  32.14 
 
 
370 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173613  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1184  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  33.33 
 
 
362 aa  187  3e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  32.47 
 
 
794 aa  186  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>