More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1634 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1634  NADH dehydrogenase subunit D  100 
 
 
402 aa  823    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0514  NADH dehydrogenase subunit D  89.03 
 
 
405 aa  735    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0659  NADH dehydrogenase subunit D  84.08 
 
 
402 aa  737    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2120  NADH dehydrogenase subunit D  89.28 
 
 
407 aa  743    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0428  NADH dehydrogenase subunit D  50 
 
 
424 aa  375  1e-103  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.366275  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1081  NADH dehydrogenase subunit D  47.04 
 
 
404 aa  364  1e-99  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.152309  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2045  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  46.08 
 
 
406 aa  347  2e-94  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0264179 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1897  NADH dehydrogenase subunit D  45.12 
 
 
405 aa  332  8e-90  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.412503  normal  0.283556 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0331  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  43.91 
 
 
407 aa  330  2e-89  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.925888  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2272  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  43.37 
 
 
406 aa  331  2e-89  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.242862 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1790  NADH dehydrogenase (quinone)  44.16 
 
 
407 aa  318  1e-85  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.442089  normal  0.696133 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1300  NADH dehydrogenase (quinone)  43.54 
 
 
410 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.823444  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0279  NADH dehydrogenase  38.23 
 
 
378 aa  271  2e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000160652 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  37.87 
 
 
366 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.6 
 
 
390 aa  243  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.68 
 
 
401 aa  242  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  34.88 
 
 
388 aa  239  5.999999999999999e-62  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.84 
 
 
400 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1048  NADH dehydrogenase subunit D  34.23 
 
 
417 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2300  NADH dehydrogenase subunit D  35.32 
 
 
403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.25 
 
 
390 aa  232  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.1 
 
 
390 aa  231  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.59 
 
 
390 aa  230  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0964  NADH dehydrogenase subunit D  34.47 
 
 
417 aa  229  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389115  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  34.75 
 
 
367 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0824  NADH dehydrogenase subunit D  34.23 
 
 
417 aa  228  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  34.73 
 
 
397 aa  228  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1596  NADH dehydrogenase (quinone)  37.23 
 
 
406 aa  227  4e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  33.94 
 
 
393 aa  226  6e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  33.99 
 
 
417 aa  225  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  34.68 
 
 
793 aa  224  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  33.68 
 
 
393 aa  224  2e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2985  NADH dehydrogenase subunit D  35.14 
 
 
406 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0128464  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  36.03 
 
 
367 aa  224  3e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  34.79 
 
 
417 aa  224  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  34.96 
 
 
417 aa  223  3e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  36.03 
 
 
367 aa  223  3e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.51 
 
 
367 aa  223  4e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0930  NADH dehydrogenase subunit D  33.74 
 
 
417 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156514  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.25 
 
 
404 aa  222  8e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1094  NADH dehydrogenase subunit D  33.99 
 
 
417 aa  222  8e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.402289  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0202  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  34.73 
 
 
373 aa  222  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1967  NADH dehydrogenase subunit D  35.04 
 
 
417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0788296 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  35.43 
 
 
792 aa  220  3e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.56 
 
 
389 aa  220  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  34.73 
 
 
794 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2059  NADH dehydrogenase subunit D  33.01 
 
 
417 aa  219  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102892  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  34.97 
 
 
791 aa  219  6e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1308  NADH dehydrogenase subunit D  35.23 
 
 
418 aa  219  7.999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1604  NADH dehydrogenase (quinone)  34 
 
 
400 aa  219  8.999999999999998e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3253  NADH dehydrogenase subunit D  33.91 
 
 
417 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.626895  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1614  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.47 
 
 
414 aa  218  2e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0716  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  33.42 
 
 
601 aa  218  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.05 
 
 
389 aa  218  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3748  NADH dehydrogenase (quinone)  33.59 
 
 
370 aa  218  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000362019  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  33.66 
 
 
417 aa  218  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3211  NADH dehydrogenase subunit D  33.25 
 
 
417 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0744  NADH dehydrogenase subunit D  33.93 
 
 
403 aa  218  2e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1961  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.47 
 
 
417 aa  217  2.9999999999999998e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00447389  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2006  NADH dehydrogenase subunit D  33.01 
 
 
417 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000196393  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3410  NADH dehydrogenase subunit D  34.13 
 
 
367 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.3 
 
 
414 aa  217  2.9999999999999998e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1602  NADH dehydrogenase subunit D  34.38 
 
 
368 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  34.23 
 
 
417 aa  217  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  30.81 
 
 
390 aa  217  4e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1286  NADH dehydrogenase (quinone)  34.74 
 
 
381 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.511189  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  34 
 
 
400 aa  217  4e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.491402  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1221  NADH dehydrogenase subunit D  34.2 
 
 
367 aa  217  4e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.240217  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1025  NADH dehydrogenase subunit D  33.92 
 
 
396 aa  216  4e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1346  NADH dehydrogenase subunit D  33.25 
 
 
417 aa  216  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00313693  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0891  NADH dehydrogenase subunit D  33.5 
 
 
396 aa  216  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.984899  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1262  NADH dehydrogenase subunit D  33.33 
 
 
396 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2211  NADH dehydrogenase subunit D  33.25 
 
 
417 aa  216  7e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.518232 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1737  NADH dehydrogenase subunit D  33.94 
 
 
367 aa  216  8e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.960022  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  33.74 
 
 
417 aa  215  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0989  NADH dehydrogenase subunit D  34.72 
 
 
417 aa  215  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1888  NADH dehydrogenase subunit D  33.01 
 
 
417 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2036  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  34.47 
 
 
394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  34.47 
 
 
417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  34.47 
 
 
417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3507  NADH dehydrogenase subunit D  32.76 
 
 
417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2062  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  34.47 
 
 
394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3298  NADH dehydrogenase subunit D  32.8 
 
 
366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68160  NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor  34.09 
 
 
474 aa  214  1.9999999999999998e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1354  NADH dehydrogenase subunit D  32.83 
 
 
396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.937388  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0781  NADH dehydrogenase subunit D  34.1 
 
 
396 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.673005  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4815  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  36.58 
 
 
394 aa  214  2.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02414  hypothetical protein similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  33.92 
 
 
475 aa  213  3.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151267 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5095  NADH dehydrogenase subunit D  32 
 
 
366 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1406  NADH dehydrogenase subunit D  33.5 
 
 
417 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1173  NADH dehydrogenase subunit D  32.73 
 
 
412 aa  213  4.9999999999999996e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.313794  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0548  NADH dehydrogenase subunit D  33.5 
 
 
424 aa  213  5.999999999999999e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.899987  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0375  NADH dehydrogenase (quinone)  34.54 
 
 
375 aa  213  7e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  33.59 
 
 
392 aa  213  7e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  33.17 
 
 
417 aa  212  7.999999999999999e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  32.27 
 
 
417 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.99 
 
 
417 aa  212  7.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.5 
 
 
422 aa  212  7.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  32.27 
 
 
417 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.9 
 
 
417 aa  212  7.999999999999999e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>