More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2120 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2120  NADH dehydrogenase subunit D  100 
 
 		 407 aa  834    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1634  NADH dehydrogenase subunit D  89.28 
 
 		 402 aa  765    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0514  NADH dehydrogenase subunit D  90.27 
 
 		 405 aa  741    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0659  NADH dehydrogenase subunit D  87.03 
 
 		 402 aa  746    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0428  NADH dehydrogenase subunit D  48.7 
 
 		 424 aa  372  1e-102  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.366275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1081  NADH dehydrogenase subunit D  45.76 
 
 		 404 aa  359  5e-98  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.152309  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2045  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  47.39 
 
 		 406 aa  358  8e-98  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0264179 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2272  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  44.44 
 
 		 406 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.242862 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0331  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  43.91 
 
 		 407 aa  335  1e-90  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.925888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1897  NADH dehydrogenase subunit D  44.33 
 
 		 405 aa  334  2e-90  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.412503  normal  0.283556 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1790  NADH dehydrogenase (quinone)  45.18 
 
 		 407 aa  325  7e-88  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.442089  normal  0.696133 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1300  NADH dehydrogenase (quinone)  41.95 
 
 		 410 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.823444  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0279  NADH dehydrogenase  39.24 
 
 		 378 aa  282  9e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000160652 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  37.87 
 
 		 366 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  38.76 
 
 		 390 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.15 
 
 		 401 aa  250  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  34.54 
 
 		 388 aa  244  9.999999999999999e-64  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.81 
 
 		 390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2300  NADH dehydrogenase subunit D  35.89 
 
 		 403 aa  243  3e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.43 
 
 		 390 aa  242  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.66 
 
 		 390 aa  239  5e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.59 
 
 		 400 aa  237  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  38.38 
 
 		 367 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  37.86 
 
 		 367 aa  236  5.0000000000000005e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  37.86 
 
 		 367 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.14 
 
 		 389 aa  233  6e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.92 
 
 		 404 aa  232  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2985  NADH dehydrogenase subunit D  36.18 
 
 		 406 aa  231  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0128464  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  34.73 
 
 		 393 aa  230  3e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.63 
 
 		 389 aa  230  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1596  NADH dehydrogenase (quinone)  36.7 
 
 		 406 aa  230  4e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1048  NADH dehydrogenase subunit D  33.01 
 
 		 417 aa  230  4e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0964  NADH dehydrogenase subunit D  33.99 
 
 		 417 aa  229  6e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389115  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  34.73 
 
 		 393 aa  229  6e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  34.03 
 
 		 367 aa  229  7e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1308  NADH dehydrogenase subunit D  36.43 
 
 		 418 aa  229  9e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  34.43 
 
 		 793 aa  227  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0824  NADH dehydrogenase subunit D  33.5 
 
 		 417 aa  227  3e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0930  NADH dehydrogenase subunit D  33.74 
 
 		 417 aa  227  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1025  NADH dehydrogenase subunit D  34.94 
 
 		 396 aa  227  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  36.09 
 
 		 406 aa  226  4e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3410  NADH dehydrogenase subunit D  34.37 
 
 		 367 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  34.73 
 
 		 397 aa  226  5.0000000000000005e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1354  NADH dehydrogenase subunit D  34.17 
 
 		 396 aa  226  7e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.937388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1262  NADH dehydrogenase subunit D  34.42 
 
 		 396 aa  226  8e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  34.7 
 
 		 417 aa  225  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1602  NADH dehydrogenase subunit D  34.65 
 
 		 368 aa  225  1e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0891  NADH dehydrogenase subunit D  34.52 
 
 		 396 aa  225  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.984899  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2059  NADH dehydrogenase subunit D  33.5 
 
 		 417 aa  224  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102892  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3298  NADH dehydrogenase subunit D  33.85 
 
 		 366 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1221  NADH dehydrogenase subunit D  34.46 
 
 		 367 aa  223  3e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.240217  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1094  NADH dehydrogenase subunit D  33.99 
 
 		 417 aa  224  3e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.402289  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  33.99 
 
 		 417 aa  223  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2574  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  35.75 
 
 		 379 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.677679  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1375  NADH dehydrogenase (quinone)  35.5 
 
 		 379 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.278436  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1274  NADH dehydrogenase (quinone)  35.5 
 
 		 379 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.2 
 
 		 417 aa  223  6e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  34.97 
 
 		 791 aa  223  6e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0744  NADH dehydrogenase subunit D  33.59 
 
 		 403 aa  223  6e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  34.43 
 
 		 792 aa  223  7e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5095  NADH dehydrogenase subunit D  34.25 
 
 		 366 aa  223  7e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3748  NADH dehydrogenase (quinone)  34.37 
 
 		 370 aa  223  7e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000362019  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0202  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  33.94 
 
 		 373 aa  223  7e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0716  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  34.74 
 
 		 601 aa  222  8e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1211  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.25 
 
 		 396 aa  222  8e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1082  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.25 
 
 		 396 aa  222  9e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.129082 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1173  NADH dehydrogenase subunit D  33.33 
 
 		 412 aa  222  9e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.313794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  33.41 
 
 		 417 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  31.85 
 
 		 390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1737  NADH dehydrogenase subunit D  33.68 
 
 		 367 aa  221  1.9999999999999999e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.960022  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  33.99 
 
 		 417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1961  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.23 
 
 		 417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00447389  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4630  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.62 
 
 		 402 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.193494 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1604  NADH dehydrogenase (quinone)  34.5 
 
 		 400 aa  220  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1016  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.99 
 
 		 396 aa  220  3e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.11 
 
 		 414 aa  220  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  33.66 
 
 		 417 aa  220  3e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0781  NADH dehydrogenase subunit D  34.61 
 
 		 396 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.673005  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2420  NADH dehydrogenase subunit D  34.18 
 
 		 396 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1715  NADH dehydrogenase subunit D  34.18 
 
 		 396 aa  220  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2396  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.42 
 
 		 396 aa  219  5e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.213945  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5422  NADH dehydrogenase subunit D  33.7 
 
 		 366 aa  219  7e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1888  NADH dehydrogenase subunit D  33.25 
 
 		 417 aa  219  7e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5473  NADH dehydrogenase subunit D  33.7 
 
 		 366 aa  219  7e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2211  NADH dehydrogenase subunit D  33.5 
 
 		 417 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.518232 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  34.29 
 
 		 794 aa  219  8.999999999999998e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5147  NADH dehydrogenase subunit D  33.7 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5388  NADH dehydrogenase subunit D  33.7 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9747399999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3394  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  36.48 
 
 		 394 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.397939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5539  NADH dehydrogenase subunit D  33.7 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4518  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.1 
 
 		 415 aa  218  1e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5418  NADH dehydrogenase subunit D  33.7 
 
 		 366 aa  218  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0805  NADH dehydrogenase subunit D  34.09 
 
 		 396 aa  217  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0798929  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1540  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  33.84 
 
 		 394 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  33.5 
 
 		 417 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1743  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  34.44 
 
 		 394 aa  218  2e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.134879  normal  0.321495 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0800  NADH dehydrogenase subunit D  34.09 
 
 		 396 aa  217  2e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02471  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  33.84 
 
 		 394 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1631  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  34.97 
 
 		 358 aa  218  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1967  NADH dehydrogenase subunit D  34.06 
 
 		 417 aa  218  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0788296 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>