More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0279 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0279  NADH dehydrogenase  100 
 
 		 378 aa  782    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000160652 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1897  NADH dehydrogenase subunit D  43.08 
 
 		 405 aa  323  3e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.412503  normal  0.283556 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1300  NADH dehydrogenase (quinone)  43.08 
 
 		 410 aa  319  5e-86  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.823444  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1081  NADH dehydrogenase subunit D  40.82 
 
 		 404 aa  305  9.000000000000001e-82  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.152309  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2272  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  41.16 
 
 		 406 aa  297  3e-79  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.242862 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0331  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  40.53 
 
 		 407 aa  293  4e-78  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.925888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2045  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  40.11 
 
 		 406 aa  290  4e-77  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0264179 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0428  NADH dehydrogenase subunit D  40.94 
 
 		 424 aa  285  9e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.366275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1790  NADH dehydrogenase (quinone)  40.46 
 
 		 407 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.442089  normal  0.696133 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0659  NADH dehydrogenase subunit D  39.27 
 
 		 402 aa  280  3e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0514  NADH dehydrogenase subunit D  40.05 
 
 		 405 aa  279  7e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2120  NADH dehydrogenase subunit D  38.99 
 
 		 407 aa  277  2e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1634  NADH dehydrogenase subunit D  38.23 
 
 		 402 aa  271  1e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.66 
 
 		 401 aa  252  7e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3298  NADH dehydrogenase subunit D  38.33 
 
 		 366 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0202  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  38.2 
 
 		 373 aa  249  6e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.8 
 
 		 400 aa  248  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  38.33 
 
 		 366 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4997  NADH dehydrogenase subunit D  38.4 
 
 		 366 aa  246  6e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4979  NADH dehydrogenase subunit D  38.4 
 
 		 366 aa  245  9e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.71 
 
 		 390 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.57 
 
 		 390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3410  NADH dehydrogenase subunit D  37.5 
 
 		 367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  37.47 
 
 		 390 aa  243  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5473  NADH dehydrogenase subunit D  38.11 
 
 		 366 aa  242  6e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5422  NADH dehydrogenase subunit D  38.11 
 
 		 366 aa  242  7e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.93 
 
 		 390 aa  242  7e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5147  NADH dehydrogenase subunit D  38.11 
 
 		 366 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5388  NADH dehydrogenase subunit D  38.11 
 
 		 366 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9747399999999995e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5418  NADH dehydrogenase subunit D  38.11 
 
 		 366 aa  241  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5539  NADH dehydrogenase subunit D  38.11 
 
 		 366 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5532  NADH dehydrogenase subunit D  38.11 
 
 		 366 aa  241  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277354 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.46 
 
 		 389 aa  241  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.46 
 
 		 389 aa  241  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5095  NADH dehydrogenase subunit D  38.11 
 
 		 366 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3816  NADH dehydrogenase subunit D  37.54 
 
 		 366 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1442  NADH dehydrogenase subunit D  37.37 
 
 		 408 aa  238  1e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.331272  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.55 
 
 		 417 aa  237  2e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1596  NADH dehydrogenase (quinone)  37.02 
 
 		 406 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.1 
 
 		 417 aa  233  5e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.57 
 
 		 417 aa  232  9e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  36.44 
 
 		 367 aa  229  5e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  34.29 
 
 		 388 aa  229  5e-59  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.37 
 
 		 404 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3409  F420H2 dehydrogenase subunit D  33.33 
 
 		 374 aa  228  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.170957  normal  0.90197 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1561  NADH dehydrogenase subunit D  35.26 
 
 		 408 aa  227  3e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0422295  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02414  hypothetical protein similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  34.44 
 
 		 475 aa  226  4e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151267 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1747  NADH dehydrogenase subunit D  35.26 
 
 		 408 aa  226  4e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1604  NADH dehydrogenase (quinone)  37.23 
 
 		 400 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.86 
 
 		 411 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3394  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  35.04 
 
 		 394 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.397939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1927  NADH dehydrogenase subunit D  35.26 
 
 		 408 aa  226  6e-58  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.371072  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0352  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  36.53 
 
 		 394 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  35.71 
 
 		 367 aa  224  2e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  35.71 
 
 		 367 aa  224  2e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0980  NADH dehydrogenase subunit D  37.29 
 
 		 371 aa  224  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.16 
 
 		 367 aa  224  2e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  34.11 
 
 		 397 aa  224  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  35.88 
 
 		 400 aa  223  3e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.491402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2155  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.2 
 
 		 441 aa  223  3e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  34.62 
 
 		 417 aa  223  3e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1743  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  34.84 
 
 		 394 aa  223  3e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.134879  normal  0.321495 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  34.38 
 
 		 417 aa  223  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0912  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.75 
 
 		 403 aa  223  3e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4815  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  35.25 
 
 		 394 aa  223  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2992  NADH dehydrogenase (quinone)  35.6 
 
 		 374 aa  223  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  35.06 
 
 		 406 aa  223  4e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1048  NADH dehydrogenase subunit D  34.15 
 
 		 417 aa  223  4e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1874  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.36 
 
 		 415 aa  223  4e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0744  NADH dehydrogenase subunit D  33.33 
 
 		 403 aa  223  4e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1294  F420H2 dehydrogenase subunit D  34.32 
 
 		 374 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.196635  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.21 
 
 		 381 aa  223  6e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1628  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.54 
 
 		 369 aa  222  7e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.963572  normal  0.66391 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0637  NADH dehydrogenase I, 49 kDa subunit  36.68 
 
 		 400 aa  222  9e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.447467  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3198  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  35.7 
 
 		 394 aa  221  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642861 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  34.19 
 
 		 794 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3748  NADH dehydrogenase (quinone)  36.09 
 
 		 370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000362019  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3889  NADH dehydrogenase  35.25 
 
 		 394 aa  221  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  34.39 
 
 		 417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  35.77 
 
 		 417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0964  NADH dehydrogenase subunit D  33.41 
 
 		 417 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389115  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0847  NADH dehydrogenase (quinone)  36.63 
 
 		 395 aa  220  3e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2091  NADH dehydrogenase (quinone)  34.78 
 
 		 374 aa  219  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0952  NADH dehydrogenase subunit D  34.29 
 
 		 417 aa  219  6e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.597503 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  34.62 
 
 		 417 aa  219  7e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1602  NADH dehydrogenase subunit D  33.97 
 
 		 368 aa  219  7e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2062  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  34.86 
 
 		 394 aa  218  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1504  NADH dehydrogenase subunit D  33.81 
 
 		 417 aa  219  8.999999999999998e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00434712 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2036  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  34.86 
 
 		 394 aa  218  8.999999999999998e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  33.58 
 
 		 417 aa  219  8.999999999999998e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1094  NADH dehydrogenase subunit D  33.9 
 
 		 417 aa  218  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.402289  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  32.16 
 
 		 793 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  32.47 
 
 		 393 aa  218  1e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0141  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.33 
 
 		 408 aa  217  2e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  34.3 
 
 		 417 aa  218  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2985  NADH dehydrogenase subunit D  32.92 
 
 		 406 aa  217  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0128464  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.48 
 
 		 414 aa  218  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  35.04 
 
 		 417 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  35.04 
 
 		 417 aa  217  2.9999999999999998e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0824  NADH dehydrogenase subunit D  32.2 
 
 		 417 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>