More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0514 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0514  NADH dehydrogenase subunit D  100 
 
 		 405 aa  827    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0659  NADH dehydrogenase subunit D  85.04 
 
 		 402 aa  734    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2120  NADH dehydrogenase subunit D  90.27 
 
 		 407 aa  742    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1634  NADH dehydrogenase subunit D  89.03 
 
 		 402 aa  756    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0428  NADH dehydrogenase subunit D  49.22 
 
 		 424 aa  372  1e-102  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.366275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1081  NADH dehydrogenase subunit D  46.53 
 
 		 404 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.152309  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2045  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  45.82 
 
 		 406 aa  345  6e-94  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0264179 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0331  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  42.89 
 
 		 407 aa  332  6e-90  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.925888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2272  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  42.89 
 
 		 406 aa  325  6e-88  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.242862 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1790  NADH dehydrogenase (quinone)  43.91 
 
 		 407 aa  319  6e-86  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.442089  normal  0.696133 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1897  NADH dehydrogenase subunit D  43.01 
 
 		 405 aa  319  6e-86  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.412503  normal  0.283556 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1300  NADH dehydrogenase (quinone)  41.42 
 
 		 410 aa  305  9.000000000000001e-82  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.823444  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0279  NADH dehydrogenase  40.05 
 
 		 378 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000160652 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  38.24 
 
 		 390 aa  252  7e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  37.33 
 
 		 366 aa  249  6e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.55 
 
 		 390 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.86 
 
 		 401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  34.45 
 
 		 388 aa  244  3e-63  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.66 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.14 
 
 		 390 aa  240  4e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.24 
 
 		 400 aa  239  8e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2300  NADH dehydrogenase subunit D  35.58 
 
 		 403 aa  239  8e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0964  NADH dehydrogenase subunit D  34.72 
 
 		 417 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389115  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.46 
 
 		 404 aa  234  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1048  NADH dehydrogenase subunit D  33.5 
 
 		 417 aa  233  6e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  37.14 
 
 		 367 aa  232  1e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1596  NADH dehydrogenase (quinone)  37.08 
 
 		 406 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.6 
 
 		 367 aa  231  2e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0930  NADH dehydrogenase subunit D  33.74 
 
 		 417 aa  230  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156514  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2059  NADH dehydrogenase subunit D  34.47 
 
 		 417 aa  229  5e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102892  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.85 
 
 		 389 aa  229  7e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  36.6 
 
 		 367 aa  229  8e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  34.46 
 
 		 417 aa  228  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.33 
 
 		 389 aa  226  4e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0824  NADH dehydrogenase subunit D  34.06 
 
 		 417 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2211  NADH dehydrogenase subunit D  34.47 
 
 		 417 aa  226  6e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.518232 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0202  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  34.84 
 
 		 373 aa  226  6e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  34.18 
 
 		 793 aa  226  7e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  33.99 
 
 		 417 aa  226  7e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  36.09 
 
 		 406 aa  224  1e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1888  NADH dehydrogenase subunit D  34.23 
 
 		 417 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  34.82 
 
 		 794 aa  224  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2985  NADH dehydrogenase subunit D  35.32 
 
 		 406 aa  224  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0128464  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  33.94 
 
 		 367 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  34.15 
 
 		 417 aa  224  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  33.01 
 
 		 417 aa  223  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  33.68 
 
 		 397 aa  223  4.9999999999999996e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1308  NADH dehydrogenase subunit D  35.23 
 
 		 418 aa  223  6e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1094  NADH dehydrogenase subunit D  33.99 
 
 		 417 aa  222  7e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.402289  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  34.37 
 
 		 791 aa  222  9e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3410  NADH dehydrogenase subunit D  34.13 
 
 		 367 aa  222  9e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  33.16 
 
 		 393 aa  222  9e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  33.92 
 
 		 792 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0716  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  34.47 
 
 		 601 aa  221  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.04 
 
 		 414 aa  221  9.999999999999999e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3211  NADH dehydrogenase subunit D  32.52 
 
 		 417 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1025  NADH dehydrogenase subunit D  34.18 
 
 		 396 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1961  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.72 
 
 		 417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00447389  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1262  NADH dehydrogenase subunit D  33.84 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  33.16 
 
 		 393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.68 
 
 		 417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  33.9 
 
 		 417 aa  220  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  33.42 
 
 		 417 aa  220  3e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4518  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.1 
 
 		 415 aa  220  3.9999999999999997e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1346  NADH dehydrogenase subunit D  32.27 
 
 		 417 aa  219  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00313693  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1967  NADH dehydrogenase subunit D  34.06 
 
 		 417 aa  219  5e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0788296 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3298  NADH dehydrogenase subunit D  33.07 
 
 		 366 aa  219  6e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1354  NADH dehydrogenase subunit D  33.08 
 
 		 396 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.937388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0891  NADH dehydrogenase subunit D  33.5 
 
 		 396 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.984899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  33.25 
 
 		 417 aa  218  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0744  NADH dehydrogenase subunit D  33.33 
 
 		 403 aa  218  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1631  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  34.7 
 
 		 358 aa  218  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3748  NADH dehydrogenase (quinone)  33.25 
 
 		 370 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000362019  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  32.27 
 
 		 417 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2006  NADH dehydrogenase subunit D  32.03 
 
 		 417 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000196393  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3253  NADH dehydrogenase subunit D  33.17 
 
 		 417 aa  218  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.626895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  32.27 
 
 		 417 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0989  NADH dehydrogenase subunit D  33.98 
 
 		 417 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1604  NADH dehydrogenase (quinone)  33.92 
 
 		 400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1173  NADH dehydrogenase subunit D  32.73 
 
 		 412 aa  216  4e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.313794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  34.39 
 
 		 417 aa  216  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68160  NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor  34.11 
 
 		 474 aa  216  5e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  34.39 
 
 		 417 aa  216  5e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  31.78 
 
 		 417 aa  216  8e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1826  NADH dehydrogenase subunit D  31.78 
 
 		 417 aa  216  8e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0734  NADH dehydrogenase subunit D  31.78 
 
 		 417 aa  216  8e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.301756  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1438  NADH dehydrogenase subunit D  31.78 
 
 		 417 aa  216  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1064  NADH dehydrogenase subunit D  31.78 
 
 		 417 aa  216  8e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240648  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1133  NADH dehydrogenase subunit D  31.78 
 
 		 417 aa  216  8e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154075  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0416  NADH dehydrogenase subunit D  31.78 
 
 		 417 aa  216  8e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1406  NADH dehydrogenase subunit D  33.25 
 
 		 417 aa  216  8e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1302  NADH dehydrogenase subunit D  31.78 
 
 		 417 aa  216  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3507  NADH dehydrogenase subunit D  32.76 
 
 		 417 aa  215  9e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2420  NADH dehydrogenase subunit D  33.76 
 
 		 396 aa  215  9e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1211  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.74 
 
 		 396 aa  215  9e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1737  NADH dehydrogenase subunit D  33.68 
 
 		 367 aa  215  9e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.960022  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1628  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.08 
 
 		 369 aa  215  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.963572  normal  0.66391 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  31.78 
 
 		 417 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  31.78 
 
 		 417 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  31.78 
 
 		 417 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>