More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0659 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1634  NADH dehydrogenase subunit D  84.08 
 
 
402 aa  737    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2120  NADH dehydrogenase subunit D  87.03 
 
 
407 aa  728    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0514  NADH dehydrogenase subunit D  85.04 
 
 
405 aa  716    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0659  NADH dehydrogenase subunit D  100 
 
 
402 aa  822    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0428  NADH dehydrogenase subunit D  48.96 
 
 
424 aa  374  1e-102  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.366275  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1081  NADH dehydrogenase subunit D  45.84 
 
 
404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.152309  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2045  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  46.85 
 
 
406 aa  346  3e-94  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0264179 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2272  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  44.03 
 
 
406 aa  332  5e-90  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.242862 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0331  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  43.65 
 
 
407 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.925888  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1897  NADH dehydrogenase subunit D  43.27 
 
 
405 aa  326  4.0000000000000003e-88  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.412503  normal  0.283556 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1790  NADH dehydrogenase (quinone)  45.18 
 
 
407 aa  317  2e-85  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.442089  normal  0.696133 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1300  NADH dehydrogenase (quinone)  42.74 
 
 
410 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.823444  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0279  NADH dehydrogenase  39.27 
 
 
378 aa  280  4e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000160652 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  36.69 
 
 
388 aa  252  8.000000000000001e-66  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  38.24 
 
 
390 aa  251  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.81 
 
 
401 aa  248  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.55 
 
 
390 aa  242  7e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  36.8 
 
 
366 aa  242  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.95 
 
 
390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.16 
 
 
404 aa  237  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.92 
 
 
390 aa  236  4e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.85 
 
 
400 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  34.55 
 
 
393 aa  231  1e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  37.4 
 
 
367 aa  231  2e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.87 
 
 
367 aa  231  2e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.88 
 
 
389 aa  229  5e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  34.55 
 
 
393 aa  229  5e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  36.87 
 
 
367 aa  229  7e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2300  NADH dehydrogenase subunit D  34.55 
 
 
403 aa  228  2e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.37 
 
 
389 aa  227  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  34.2 
 
 
397 aa  227  3e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2985  NADH dehydrogenase subunit D  34.88 
 
 
406 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0128464  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1048  NADH dehydrogenase subunit D  33.01 
 
 
417 aa  222  7e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0202  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  35.11 
 
 
373 aa  223  7e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  30.93 
 
 
390 aa  222  8e-57  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1596  NADH dehydrogenase (quinone)  35.9 
 
 
406 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1631  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  35.79 
 
 
358 aa  222  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  34.26 
 
 
793 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1354  NADH dehydrogenase subunit D  33.42 
 
 
396 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.937388  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1221  NADH dehydrogenase subunit D  34.2 
 
 
367 aa  220  3e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.240217  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.56 
 
 
414 aa  220  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  35.26 
 
 
792 aa  219  5e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  33.86 
 
 
794 aa  219  5e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  32.64 
 
 
367 aa  219  6e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1604  NADH dehydrogenase (quinone)  34.41 
 
 
400 aa  219  6e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0964  NADH dehydrogenase subunit D  32.52 
 
 
417 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389115  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1737  NADH dehydrogenase subunit D  33.42 
 
 
367 aa  218  1e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.960022  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3748  NADH dehydrogenase (quinone)  34.03 
 
 
370 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000362019  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1602  NADH dehydrogenase subunit D  33.86 
 
 
368 aa  219  1e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  34.46 
 
 
791 aa  219  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0716  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  33.95 
 
 
601 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  35.55 
 
 
787 aa  218  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1262  NADH dehydrogenase subunit D  32.91 
 
 
396 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0352  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  35.7 
 
 
394 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0824  NADH dehydrogenase subunit D  33.25 
 
 
417 aa  216  4e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0744  NADH dehydrogenase subunit D  33.5 
 
 
403 aa  216  8e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2155  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.45 
 
 
441 aa  215  9e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0891  NADH dehydrogenase subunit D  33.33 
 
 
396 aa  215  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.984899  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1211  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.05 
 
 
396 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1082  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.05 
 
 
396 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.129082 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1025  NADH dehydrogenase subunit D  33.5 
 
 
396 aa  214  9.999999999999999e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  35.01 
 
 
406 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1715  NADH dehydrogenase subunit D  33.5 
 
 
396 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1743  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  35.26 
 
 
394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.134879  normal  0.321495 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1308  NADH dehydrogenase subunit D  34.37 
 
 
418 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4815  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  36.32 
 
 
394 aa  214  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02414  hypothetical protein similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  32.08 
 
 
475 aa  214  2.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151267 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1016  NADH dehydrogenase I, D subunit  31.79 
 
 
396 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1094  NADH dehydrogenase subunit D  33.25 
 
 
417 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.402289  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4630  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.25 
 
 
402 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.193494 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  32.53 
 
 
417 aa  211  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1874  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.98 
 
 
415 aa  212  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.598165  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  33.01 
 
 
417 aa  211  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1614  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.95 
 
 
414 aa  212  1e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1173  NADH dehydrogenase subunit D  31.88 
 
 
412 aa  212  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.313794  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  32.43 
 
 
417 aa  212  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3394  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  36.58 
 
 
394 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.397939  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3410  NADH dehydrogenase subunit D  31.73 
 
 
367 aa  211  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2059  NADH dehydrogenase subunit D  32.27 
 
 
417 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102892  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  33.75 
 
 
400 aa  211  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.491402  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2036  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  34.65 
 
 
394 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3409  F420H2 dehydrogenase subunit D  33.6 
 
 
374 aa  211  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.170957  normal  0.90197 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2062  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  34.65 
 
 
394 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0930  NADH dehydrogenase subunit D  31.54 
 
 
417 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156514  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2992  NADH dehydrogenase (quinone)  34.46 
 
 
374 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1358  NADH dehydrogenase subunit D  33.67 
 
 
402 aa  211  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121379  normal  0.0313197 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3859  NADH dehydrogenase (quinone)  34.79 
 
 
420 aa  211  2e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1118  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  34.46 
 
 
592 aa  210  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.374283  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3298  NADH dehydrogenase subunit D  31.47 
 
 
366 aa  211  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2921  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.48 
 
 
394 aa  210  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2396  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.48 
 
 
396 aa  210  4e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.213945  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  31.85 
 
 
417 aa  209  5e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5095  NADH dehydrogenase subunit D  32.05 
 
 
366 aa  209  5e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  32.56 
 
 
392 aa  209  5e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.02 
 
 
381 aa  209  5e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4518  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.16 
 
 
415 aa  209  6e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2432  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  33.68 
 
 
394 aa  209  7e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0877111  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01901  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  32.9 
 
 
394 aa  209  7e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_68160  NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor  32.56 
 
 
474 aa  209  7e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2833  NADH dehydrogenase subunit D  33.59 
 
 
416 aa  209  7e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.371933  normal  0.138606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>