More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1081 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1081  NADH dehydrogenase subunit D  100 
 
 
404 aa  818    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.152309  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1897  NADH dehydrogenase subunit D  53.79 
 
 
405 aa  429  1e-119  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.412503  normal  0.283556 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1300  NADH dehydrogenase (quinone)  52.36 
 
 
410 aa  426  1e-118  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.823444  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1634  NADH dehydrogenase subunit D  47.04 
 
 
402 aa  364  1e-99  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0659  NADH dehydrogenase subunit D  45.84 
 
 
402 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0428  NADH dehydrogenase subunit D  46.74 
 
 
424 aa  352  5.9999999999999994e-96  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.366275  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2120  NADH dehydrogenase subunit D  45.76 
 
 
407 aa  348  1e-94  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0514  NADH dehydrogenase subunit D  46.53 
 
 
405 aa  347  2e-94  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0331  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  44.87 
 
 
407 aa  333  4e-90  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.925888  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1790  NADH dehydrogenase (quinone)  44.96 
 
 
407 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.442089  normal  0.696133 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2045  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  43.16 
 
 
406 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0264179 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2272  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  43.95 
 
 
406 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.242862 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0279  NADH dehydrogenase  40.82 
 
 
378 aa  305  9.000000000000001e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000160652 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  38.38 
 
 
404 aa  263  6e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.93 
 
 
400 aa  258  1e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0375  NADH dehydrogenase (quinone)  38.83 
 
 
375 aa  254  1.0000000000000001e-66  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1614  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.39 
 
 
414 aa  253  3e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  37.11 
 
 
791 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3409  F420H2 dehydrogenase subunit D  37.73 
 
 
374 aa  250  3e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.170957  normal  0.90197 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  36.66 
 
 
793 aa  250  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  36.6 
 
 
792 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1294  F420H2 dehydrogenase subunit D  36.41 
 
 
374 aa  246  6e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.196635  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.59 
 
 
401 aa  246  6e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0202  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  36.79 
 
 
373 aa  245  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.48 
 
 
417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0352  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  36.65 
 
 
394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02414  hypothetical protein similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  35.68 
 
 
475 aa  243  3.9999999999999997e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151267 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.45 
 
 
390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.58 
 
 
417 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0548  NADH dehydrogenase subunit D  37.29 
 
 
424 aa  242  7e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.899987  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2562  NADH dehydrogenase subunit D  35.92 
 
 
417 aa  242  9e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1743  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  36.65 
 
 
394 aa  241  2e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.134879  normal  0.321495 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.81 
 
 
390 aa  241  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  37.43 
 
 
787 aa  241  2e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4518  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.65 
 
 
415 aa  240  2.9999999999999997e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.871032  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0989  NADH dehydrogenase subunit D  37.35 
 
 
417 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2036  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  35.86 
 
 
394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3410  NADH dehydrogenase subunit D  37.27 
 
 
367 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2062  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  35.86 
 
 
394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4815  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  36.81 
 
 
394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0483  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.55 
 
 
426 aa  240  4e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.9 
 
 
417 aa  240  4e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0426  NADH dehydrogenase subunit D  36.29 
 
 
393 aa  240  4e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.58 
 
 
389 aa  239  5e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1615  NADH dehydrogenase subunit D  37.05 
 
 
417 aa  239  5.999999999999999e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0833647  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.82 
 
 
381 aa  239  5.999999999999999e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.32 
 
 
389 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1662  NADH dehydrogenase I, D subunit  37.34 
 
 
383 aa  239  6.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2155  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.77 
 
 
441 aa  239  8e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  37.4 
 
 
367 aa  239  9e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.26 
 
 
390 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.26 
 
 
390 aa  238  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2300  NADH dehydrogenase subunit D  34.34 
 
 
403 aa  237  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  35.77 
 
 
393 aa  237  2e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  34.11 
 
 
397 aa  237  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  37.44 
 
 
794 aa  237  3e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  36.6 
 
 
794 aa  237  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  36.6 
 
 
794 aa  237  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.86 
 
 
414 aa  237  3e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  37.14 
 
 
367 aa  236  4e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0711  NADH dehydrogenase I, D subunit  37.2 
 
 
417 aa  236  4e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.577358  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1308  NADH dehydrogenase subunit D  35.35 
 
 
418 aa  236  4e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.652404  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2702  NADH dehydrogenase subunit D  36.06 
 
 
417 aa  236  5.0000000000000005e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  34.12 
 
 
406 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2833  NADH dehydrogenase subunit D  35.58 
 
 
417 aa  236  7e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  36.58 
 
 
366 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  35.44 
 
 
417 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3298  NADH dehydrogenase subunit D  36.75 
 
 
366 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  35.25 
 
 
390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  34.97 
 
 
388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01901  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  34.21 
 
 
395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.468613  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  35.92 
 
 
417 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  35.35 
 
 
417 aa  234  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  35.35 
 
 
417 aa  234  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0631  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  33.95 
 
 
403 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1626  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  33.95 
 
 
403 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3190  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  33.95 
 
 
403 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  35.68 
 
 
417 aa  233  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  35.68 
 
 
417 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1558  NADH dehydrogenase subunit D  35.06 
 
 
392 aa  233  5e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.970995  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  35.92 
 
 
417 aa  233  5e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  35.68 
 
 
417 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  35.68 
 
 
417 aa  233  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3748  NADH dehydrogenase (quinone)  36.22 
 
 
370 aa  233  6e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000362019  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0174  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  34.21 
 
 
395 aa  233  6e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01921  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  34.21 
 
 
395 aa  232  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.132694  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2112  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  34.74 
 
 
394 aa  232  7.000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.11577  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  35.68 
 
 
417 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  35.02 
 
 
417 aa  232  9e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  35.02 
 
 
417 aa  232  9e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3198  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  35.08 
 
 
394 aa  232  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642861 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2432  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  35 
 
 
394 aa  231  1e-59  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0877111  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02011  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  33.95 
 
 
395 aa  231  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0852756  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01901  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  34.83 
 
 
394 aa  232  1e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3394  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  35.17 
 
 
394 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.397939  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  33.74 
 
 
417 aa  231  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3889  NADH dehydrogenase  34.29 
 
 
394 aa  231  2e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03190  NADH dehydrogenase subunit D  33.25 
 
 
460 aa  231  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0757  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  37.5 
 
 
571 aa  231  2e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000017258  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1071  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  35.85 
 
 
537 aa  231  2e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>