More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0757 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0748  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  55.54 
 
 
586 aa  647    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0615291  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0628  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  60.21 
 
 
576 aa  705    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0757  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  100 
 
 
571 aa  1180    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000017258  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0882  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  58.56 
 
 
580 aa  677    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000293416  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.72 
 
 
400 aa  382  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1357  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  37.11 
 
 
587 aa  366  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.34 
 
 
404 aa  361  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  38.19 
 
 
793 aa  359  8e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.52 
 
 
411 aa  356  7.999999999999999e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  38.19 
 
 
791 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1561  NADH dehydrogenase subunit D  44.78 
 
 
408 aa  354  2.9999999999999997e-96  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0422295  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1442  NADH dehydrogenase subunit D  44.27 
 
 
408 aa  354  2.9999999999999997e-96  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.331272  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1747  NADH dehydrogenase subunit D  44.78 
 
 
408 aa  353  4e-96  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0184  NADH dehydrogenase subunit D  44.67 
 
 
408 aa  352  7e-96  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  44.42 
 
 
397 aa  352  8.999999999999999e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3823  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  35.95 
 
 
580 aa  352  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.203539  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2155  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.17 
 
 
441 aa  352  2e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0141  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.32 
 
 
408 aa  350  4e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1927  NADH dehydrogenase subunit D  44.53 
 
 
408 aa  349  6e-95  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.371072  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2833  NADH dehydrogenase subunit D  42.96 
 
 
417 aa  349  8e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2702  NADH dehydrogenase subunit D  43.45 
 
 
417 aa  349  9e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  42.96 
 
 
417 aa  348  1e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  42.96 
 
 
417 aa  348  1e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  36.14 
 
 
794 aa  348  1e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  37.66 
 
 
792 aa  348  2e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1406  NADH dehydrogenase subunit D  41.99 
 
 
417 aa  348  2e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  42.09 
 
 
417 aa  347  3e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0483  NADH dehydrogenase I, D subunit  46.13 
 
 
426 aa  347  4e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1967  NADH dehydrogenase subunit D  42.96 
 
 
417 aa  347  4e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0788296 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5177  NADH dehydrogenase subunit D  43.55 
 
 
417 aa  346  7e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752973  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02414  hypothetical protein similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  44.31 
 
 
475 aa  345  1e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151267 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1614  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.41 
 
 
414 aa  345  1e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0178  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  38.46 
 
 
794 aa  344  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2414  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  35.31 
 
 
593 aa  345  2e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0246987  normal  0.2214 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1762  NADH dehydrogenase subunit D  42.48 
 
 
417 aa  344  2e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  45.36 
 
 
381 aa  345  2e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1662  NADH dehydrogenase I, D subunit  44.79 
 
 
383 aa  344  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1526  NADH dehydrogenase subunit D  44.01 
 
 
409 aa  344  2.9999999999999997e-93  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.013165  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.82 
 
 
389 aa  343  4e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.68 
 
 
417 aa  343  4e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0548  NADH dehydrogenase subunit D  43.47 
 
 
424 aa  343  4e-93  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.899987  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1496  NADH dehydrogenase subunit D  43.2 
 
 
417 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  42.82 
 
 
389 aa  343  7e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2059  NADH dehydrogenase subunit D  42.09 
 
 
417 aa  342  8e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102892  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3367  NADH dehydrogenase I, C/D subunit  34.57 
 
 
593 aa  342  8e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.812668  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  41.85 
 
 
417 aa  342  9e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  41.85 
 
 
417 aa  342  9e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  42.72 
 
 
417 aa  342  1e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1615  NADH dehydrogenase subunit D  43.55 
 
 
417 aa  342  1e-92  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0833647  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2006  NADH dehydrogenase subunit D  41.85 
 
 
417 aa  341  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000196393  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02730  NADH-ubiquinone oxidoreductase, putative  39.43 
 
 
452 aa  341  2e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2211  NADH dehydrogenase subunit D  41.85 
 
 
417 aa  342  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.518232 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1888  NADH dehydrogenase subunit D  41.85 
 
 
417 aa  342  2e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1871  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  35.26 
 
 
593 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.200942 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  41.61 
 
 
417 aa  341  2e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.19 
 
 
390 aa  341  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3693  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  35.26 
 
 
593 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.210857  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1744  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  35.09 
 
 
593 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0734404  normal  0.199576 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4121  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  35.09 
 
 
593 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  41.75 
 
 
417 aa  340  4e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3253  NADH dehydrogenase subunit D  41.5 
 
 
417 aa  340  4e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.626895  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3211  NADH dehydrogenase subunit D  41.36 
 
 
417 aa  340  4e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1346  NADH dehydrogenase subunit D  41.36 
 
 
417 aa  340  4e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00313693  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3199  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  34.4 
 
 
593 aa  340  5e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.415002  normal  0.0311953 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1504  NADH dehydrogenase subunit D  42.23 
 
 
417 aa  340  5e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00434712 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  41.99 
 
 
417 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0989  NADH dehydrogenase subunit D  42.51 
 
 
417 aa  339  7e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1125  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  37.06 
 
 
593 aa  339  8e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.64928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0160  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  37.54 
 
 
794 aa  339  8e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.155081 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2562  NADH dehydrogenase subunit D  42.23 
 
 
417 aa  339  9e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  41.61 
 
 
417 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01290  NADH dehydrogenase subunit D  41.02 
 
 
435 aa  338  9.999999999999999e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191542  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3605  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  34.12 
 
 
594 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  41.61 
 
 
417 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  41.61 
 
 
417 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0243  NADH dehydrogenase subunit D  40.89 
 
 
435 aa  338  1.9999999999999998e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  41.02 
 
 
417 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  43.51 
 
 
417 aa  338  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  41.61 
 
 
417 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  41.61 
 
 
417 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  41.12 
 
 
417 aa  337  5e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1064  NADH dehydrogenase subunit D  41.12 
 
 
417 aa  337  5e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240648  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0272  NADH dehydrogenase subunit D  40.52 
 
 
435 aa  336  5e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1826  NADH dehydrogenase subunit D  41.12 
 
 
417 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1438  NADH dehydrogenase subunit D  41.12 
 
 
417 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0734  NADH dehydrogenase subunit D  41.12 
 
 
417 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.301756  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1133  NADH dehydrogenase subunit D  41.12 
 
 
417 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154075  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  41.12 
 
 
417 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1302  NADH dehydrogenase subunit D  41.12 
 
 
417 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0416  NADH dehydrogenase subunit D  41.12 
 
 
417 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0964  NADH dehydrogenase subunit D  41.85 
 
 
417 aa  336  7.999999999999999e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389115  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1961  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.01 
 
 
417 aa  336  7.999999999999999e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00447389  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0711  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.79 
 
 
417 aa  335  1e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.577358  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  41.36 
 
 
417 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0930  NADH dehydrogenase subunit D  41.36 
 
 
417 aa  335  1e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156514  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2828  NADH dehydrogenase subunit D  41.02 
 
 
435 aa  335  1e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1826  NADH dehydrogenase subunit D  42.46 
 
 
412 aa  335  2e-90  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.063533  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  34.99 
 
 
787 aa  335  2e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  41.94 
 
 
422 aa  334  3e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  46.11 
 
 
367 aa  333  4e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>