More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3367 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3367  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  100 
 
 		 359 aa  748    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1086  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  71.07 
 
 		 359 aa  549  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00746179  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1522  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  63.23 
 
 		 358 aa  498  1e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1734  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  61.8 
 
 		 359 aa  481  1e-135  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00563551  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3020  ech hydrogenase subunit E  62.08 
 
 		 359 aa  480  1e-134  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2505  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  60.72 
 
 		 358 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0360  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  56.62 
 
 		 359 aa  448  1e-125  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1669  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  57.14 
 
 		 360 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0803  NADH dehydrogenase (quinone)  56.18 
 
 		 359 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4118  NADH dehydrogenase (quinone)  55.43 
 
 		 358 aa  442  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1102  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  55.43 
 
 		 358 aa  439  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_770  hydrogenase, EchE subunit  55.56 
 
 		 359 aa  434  1e-120  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0867  hydrogenase, group 4, EchE subunit, putative  54.72 
 
 		 359 aa  430  1e-119  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.195553  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0148  ech hydrogenase subunit E  55.59 
 
 		 358 aa  430  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0785  ech hydrogenase subunit E  54.72 
 
 		 359 aa  429  1e-119  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2728  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  53.09 
 
 		 359 aa  425  1e-118  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.316127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0028  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  53.11 
 
 		 359 aa  423  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1574  NADH dehydrogenase (quinone)  55.71 
 
 		 362 aa  424  1e-117  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.443946 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1745  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  52.11 
 
 		 359 aa  422  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.364735  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07260  ech hydrogenase subunit E  55.99 
 
 		 362 aa  419  1e-116  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0794783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13380  ech hydrogenase subunit E  55.15 
 
 		 362 aa  414  1e-114  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0553  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  52.65 
 
 		 358 aa  402  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3524  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  44.17 
 
 		 409 aa  326  5e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2227  NADH dehydrogenase (quinone)  41.89 
 
 		 419 aa  322  4e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0595  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  41.67 
 
 		 409 aa  323  4e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1071  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  43.33 
 
 		 537 aa  317  1e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1130  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  44.17 
 
 		 402 aa  301  9e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0316  NADH-ubiquinone oxidoreductase  41.78 
 
 		 561 aa  290  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.371145  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2590  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  38.21 
 
 		 409 aa  278  7e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0964  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  39.15 
 
 		 366 aa  278  7e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.138643 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4501  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  38.5 
 
 		 361 aa  276  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0565202 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3189  NADH dehydrogenase (quinone)  37.46 
 
 		 377 aa  276  4e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.482242 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0959  membrane bound hydrogenase subunit mbhL  37.13 
 
 		 406 aa  275  9e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.105572  normal  0.5876 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1425  ech hydrogenase subunit E  37.53 
 
 		 361 aa  271  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2186  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  37.92 
 
 		 574 aa  263  4e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1197  NADH dehydrogenase (quinone)  37.57 
 
 		 362 aa  263  4.999999999999999e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.450071  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1885  NADH dehydrogenase (quinone)  36.84 
 
 		 360 aa  262  8e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2634  hydrogenase-4, G subunit  38.61 
 
 		 571 aa  262  8.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2769  hydrogenase-4, G subunit  38.72 
 
 		 571 aa  261  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3709  hydrogenase-4, G subunit  38.72 
 
 		 571 aa  261  1e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0675  NADH dehydrogenase (quinone)  38.27 
 
 		 414 aa  261  2e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2713  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  38.16 
 
 		 575 aa  260  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2970  formate hydrogenlyase, subunit E  38.06 
 
 		 569 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3036  formate hydrogenlyase subunit E  38.06 
 
 		 569 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143989 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3159  formate hydrogenlyase, subunit E  38.06 
 
 		 569 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.146854 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3052  formate hydrogenlyase subunit E  38.06 
 
 		 569 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.309808 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3001  formate hydrogenlyase subunit E  38.06 
 
 		 569 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.33609  normal  0.016492 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0183  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  37.08 
 
 		 567 aa  258  1e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1280  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  37.88 
 
 		 575 aa  257  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.637418  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02571  hydrogenase 3, large subunit  37.5 
 
 		 569 aa  256  6e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.671666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0968  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  37.5 
 
 		 569 aa  256  6e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02536  hypothetical protein  37.5 
 
 		 569 aa  256  6e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.576982  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3972  formate hydrogenlyase, subunit E  37.5 
 
 		 576 aa  256  6e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2857  formate hydrogenlyase, subunit E  37.5 
 
 		 569 aa  256  6e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0991  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  37.5 
 
 		 569 aa  256  6e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0591467 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2846  formate hydrogenlyase, subunit E  37.5 
 
 		 576 aa  256  6e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.15789 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3009  formate hydrogenlyase, subunit E  37.5 
 
 		 569 aa  256  6e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4570  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  37.6 
 
 		 571 aa  255  7e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3155  formate hydrogenlyase, subunit E  37.22 
 
 		 569 aa  255  8e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2859  hydrogenase-4, G subunit  38.16 
 
 		 571 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3194  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  37.6 
 
 		 569 aa  253  4.0000000000000004e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2430  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  36.77 
 
 		 567 aa  252  7e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0069  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  36.59 
 
 		 359 aa  251  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0371  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  38.94 
 
 		 378 aa  249  5e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2786  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  37.5 
 
 		 557 aa  248  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2794  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  37.5 
 
 		 557 aa  248  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02379  hydrogenase 4, subunit  36.39 
 
 		 555 aa  236  7e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1182  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  36.39 
 
 		 555 aa  236  7e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02341  hypothetical protein  36.39 
 
 		 555 aa  236  7e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1189  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  36.39 
 
 		 555 aa  236  7e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.454918 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2621  hydrogenase-4, G subunit  36.11 
 
 		 555 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0773  NADH dehydrogenase (quinone)  35.93 
 
 		 378 aa  231  1e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.597938  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1211  NADH dehydrogenase (quinone)  36.69 
 
 		 375 aa  230  3e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3409  F420H2 dehydrogenase subunit D  33.24 
 
 		 374 aa  229  4e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.170957  normal  0.90197 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0707  NADH dehydrogenase (quinone)  35.85 
 
 		 375 aa  229  7e-59  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00990  Ni,Fe-hydrogenase III large subunit  34.35 
 
 		 576 aa  228  1e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.08 
 
 		 381 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0116  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  35.85 
 
 		 376 aa  228  1e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  37.25 
 
 		 367 aa  227  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1866  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  34.45 
 
 		 579 aa  227  2e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1294  F420H2 dehydrogenase subunit D  31.34 
 
 		 374 aa  226  4e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.196635  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3859  NADH dehydrogenase (quinone)  33.87 
 
 		 420 aa  223  3e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2105  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  33.43 
 
 		 361 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0127  hydrogenase-4 component G  33.8 
 
 		 582 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.548953  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0711  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33.33 
 
 		 578 aa  220  3e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0105954  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1635  phage integrase family site specific recombinase  33.05 
 
 		 578 aa  218  1e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0144556  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  33.24 
 
 		 367 aa  218  2e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3298  NADH dehydrogenase subunit D  33.62 
 
 		 366 aa  217  2e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  34.29 
 
 		 366 aa  216  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.25 
 
 		 400 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  33.15 
 
 		 367 aa  214  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1897  NADH dehydrogenase subunit D  34.5 
 
 		 405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.412503  normal  0.283556 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1184  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  33.98 
 
 		 362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.25 
 
 		 401 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3410  NADH dehydrogenase subunit D  34.47 
 
 		 367 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  31.59 
 
 		 417 aa  212  7e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.61 
 
 		 367 aa  211  1e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1052  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  32.78 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.718525  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0748  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  32.82 
 
 		 586 aa  211  2e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0615291  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  31.54 
 
 		 390 aa  210  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>