More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_00990 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02379  hydrogenase 4, subunit  61.95 
 
 		 555 aa  736    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02571  hydrogenase 3, large subunit  64.15 
 
 		 569 aa  796    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.671666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0968  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  64.15 
 
 		 569 aa  796    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1182  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  61.95 
 
 		 555 aa  736    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2857  formate hydrogenlyase, subunit E  64.15 
 
 		 569 aa  796    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2621  hydrogenase-4, G subunit  61.77 
 
 		 555 aa  734    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1280  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  61.77 
 
 		 575 aa  748    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.637418  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2859  hydrogenase-4, G subunit  63.72 
 
 		 571 aa  766    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2846  formate hydrogenlyase, subunit E  64.15 
 
 		 576 aa  797    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.15789 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2430  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  62.23 
 
 		 567 aa  761    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3709  hydrogenase-4, G subunit  64.07 
 
 		 571 aa  773    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3001  formate hydrogenlyase subunit E  64.85 
 
 		 569 aa  803    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.33609  normal  0.016492 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1189  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  61.95 
 
 		 555 aa  736    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.454918 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02536  hypothetical protein  64.15 
 
 		 569 aa  796    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.576982  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2186  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  61.08 
 
 		 574 aa  740    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02341  hypothetical protein  61.95 
 
 		 555 aa  736    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2634  hydrogenase-4, G subunit  64.07 
 
 		 571 aa  772    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3036  formate hydrogenlyase subunit E  64.85 
 
 		 569 aa  803    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143989 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4570  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  64.73 
 
 		 571 aa  785    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2970  formate hydrogenlyase, subunit E  64.85 
 
 		 569 aa  803    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3159  formate hydrogenlyase, subunit E  64.85 
 
 		 569 aa  803    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.146854 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2769  hydrogenase-4, G subunit  63.89 
 
 		 571 aa  769    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3009  formate hydrogenlyase, subunit E  64.15 
 
 		 569 aa  797    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2713  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  62.01 
 
 		 575 aa  748    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3972  formate hydrogenlyase, subunit E  64.15 
 
 		 576 aa  797    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3052  formate hydrogenlyase subunit E  64.85 
 
 		 569 aa  803    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.309808 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00990  Ni,Fe-hydrogenase III large subunit  100 
 
 		 576 aa  1198    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3194  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  63.62 
 
 		 569 aa  790    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3155  formate hydrogenlyase, subunit E  64.32 
 
 		 569 aa  797    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0991  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  64.15 
 
 		 569 aa  796    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0591467 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0711  DNA-3-methyladenine glycosylase I  54.05 
 
 		 578 aa  596  1e-169  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0105954  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1635  phage integrase family site specific recombinase  53.16 
 
 		 578 aa  594  1e-168  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0144556  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0127  hydrogenase-4 component G  51.37 
 
 		 582 aa  587  1e-166  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.548953  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1866  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  51.13 
 
 		 579 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0183  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  48.82 
 
 		 567 aa  546  1e-154  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0316  NADH-ubiquinone oxidoreductase  39.31 
 
 		 561 aa  397  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.371145  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2786  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  37.59 
 
 		 557 aa  390  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2794  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  37.59 
 
 		 557 aa  390  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0795  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  35.8 
 
 		 525 aa  340  4e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1130  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  44.35 
 
 		 402 aa  286  7e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2464  NADH dehydrogenase (quinone)  34.6 
 
 		 531 aa  285  2.0000000000000002e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.511351  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1687  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  34.02 
 
 		 530 aa  278  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1071  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  34.81 
 
 		 537 aa  278  2e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0595  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  38.78 
 
 		 409 aa  266  8.999999999999999e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3524  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  39.39 
 
 		 409 aa  265  1e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0675  NADH dehydrogenase (quinone)  37.96 
 
 		 414 aa  265  2e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0959  membrane bound hydrogenase subunit mbhL  39.44 
 
 		 406 aa  262  2e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.105572  normal  0.5876 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4284  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  32.89 
 
 		 551 aa  259  8e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0964  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  36.59 
 
 		 366 aa  249  7e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.138643 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2590  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  36.59 
 
 		 409 aa  248  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0699  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  29.69 
 
 		 524 aa  246  9.999999999999999e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1123  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  34.69 
 
 		 526 aa  243  9e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3189  NADH dehydrogenase (quinone)  36.59 
 
 		 377 aa  239  8e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.482242 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2227  NADH dehydrogenase (quinone)  33.93 
 
 		 419 aa  236  7e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07260  ech hydrogenase subunit E  36.81 
 
 		 362 aa  236  9e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0794783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1669  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  36.09 
 
 		 360 aa  235  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1425  ech hydrogenase subunit E  36.36 
 
 		 361 aa  234  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2728  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  35 
 
 		 359 aa  229  9e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.316127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0028  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  37.6 
 
 		 359 aa  229  1e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1885  NADH dehydrogenase (quinone)  35.91 
 
 		 360 aa  229  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3367  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  34.35 
 
 		 359 aa  228  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1522  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  36.46 
 
 		 358 aa  227  4e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4501  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  35.65 
 
 		 361 aa  226  7e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0565202 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1734  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  34.53 
 
 		 359 aa  226  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00563551  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1138  hydrogenase subunit  33.33 
 
 		 527 aa  225  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0311036  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2505  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  35.64 
 
 		 358 aa  224  4e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1086  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  35.28 
 
 		 359 aa  221  3e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00746179  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0148  ech hydrogenase subunit E  34.07 
 
 		 358 aa  221  3e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1745  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  34.69 
 
 		 359 aa  217  5e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.364735  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4118  NADH dehydrogenase (quinone)  34.44 
 
 		 358 aa  216  5.9999999999999996e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6069  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  32.66 
 
 		 524 aa  216  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289137 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1303  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  31.64 
 
 		 478 aa  216  7e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1574  NADH dehydrogenase (quinone)  35.16 
 
 		 362 aa  215  1.9999999999999998e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.443946 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3020  ech hydrogenase subunit E  32.04 
 
 		 359 aa  213  7e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0803  NADH dehydrogenase (quinone)  34.25 
 
 		 359 aa  212  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0360  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  34.71 
 
 		 359 aa  212  2e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0867  hydrogenase, group 4, EchE subunit, putative  34.35 
 
 		 359 aa  211  3e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.195553  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_770  hydrogenase, EchE subunit  34.35 
 
 		 359 aa  210  7e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0069  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  31.3 
 
 		 359 aa  208  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0785  ech hydrogenase subunit E  34.07 
 
 		 359 aa  208  3e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0553  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  34.44 
 
 		 358 aa  207  4e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1197  NADH dehydrogenase (quinone)  33.98 
 
 		 362 aa  207  5e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.450071  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0325  putative formate hydrogenlyase subunit  31.62 
 
 		 515 aa  206  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1102  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  35.01 
 
 		 358 aa  206  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1818  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  32.98 
 
 		 519 aa  204  4e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.207478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1294  F420H2 dehydrogenase subunit D  33.6 
 
 		 374 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.196635  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0707  NADH dehydrogenase (quinone)  33.7 
 
 		 375 aa  200  5e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0116  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  33.98 
 
 		 376 aa  200  5e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0371  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  34.29 
 
 		 378 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  30.3 
 
 		 792 aa  198  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  30.1 
 
 		 791 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0473  NADH dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 		 375 aa  196  1e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.330146  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1211  NADH dehydrogenase (quinone)  33.43 
 
 		 375 aa  196  1e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13380  ech hydrogenase subunit E  33.33 
 
 		 362 aa  195  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0933  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  32.05 
 
 		 502 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1571  hydrogenase, group 4, HycE subunit, putative  31.39 
 
 		 526 aa  192  1e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0265592  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1317  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  31.6 
 
 		 526 aa  192  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3409  F420H2 dehydrogenase subunit D  31.45 
 
 		 374 aa  192  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.170957  normal  0.90197 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4465  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  33.75 
 
 		 391 aa  192  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.314486  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  29.01 
 
 		 794 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>