More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1280 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02379  hydrogenase 4, subunit  74.91 
 
 		 555 aa  907    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02571  hydrogenase 3, large subunit  73.64 
 
 		 569 aa  898    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.671666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0968  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  73.64 
 
 		 569 aa  898    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1182  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  74.91 
 
 		 555 aa  907    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3155  formate hydrogenlyase, subunit E  73.99 
 
 		 569 aa  899    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2634  hydrogenase-4, G subunit  77.4 
 
 		 571 aa  944    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3194  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  73.71 
 
 		 569 aa  893    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3159  formate hydrogenlyase, subunit E  74.69 
 
 		 569 aa  903    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.146854 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1189  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  74.91 
 
 		 555 aa  907    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.454918 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2769  hydrogenase-4, G subunit  77.05 
 
 		 571 aa  941    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00990  Ni,Fe-hydrogenase III large subunit  61.77 
 
 		 576 aa  748    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3036  formate hydrogenlyase subunit E  74.69 
 
 		 569 aa  903    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143989 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0991  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  73.64 
 
 		 569 aa  898    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0591467 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3009  formate hydrogenlyase, subunit E  73.81 
 
 		 569 aa  898    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2186  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  65.66 
 
 		 574 aa  784    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2713  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  94.96 
 
 		 575 aa  1144    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3972  formate hydrogenlyase, subunit E  73.14 
 
 		 576 aa  904    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2857  formate hydrogenlyase, subunit E  73.64 
 
 		 569 aa  898    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3052  formate hydrogenlyase subunit E  74.69 
 
 		 569 aa  903    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.309808 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2970  formate hydrogenlyase, subunit E  74.69 
 
 		 569 aa  903    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4570  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  70.49 
 
 		 571 aa  857    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2430  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  74.51 
 
 		 567 aa  891    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2859  hydrogenase-4, G subunit  77.05 
 
 		 571 aa  941    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3001  formate hydrogenlyase subunit E  74.69 
 
 		 569 aa  903    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.33609  normal  0.016492 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1280  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  100 
 
 		 575 aa  1191    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.637418  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3709  hydrogenase-4, G subunit  77.22 
 
 		 571 aa  943    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02341  hypothetical protein  74.91 
 
 		 555 aa  907    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02536  hypothetical protein  73.64 
 
 		 569 aa  898    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.576982  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2846  formate hydrogenlyase, subunit E  72.96 
 
 		 576 aa  902    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.15789 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2621  hydrogenase-4, G subunit  74.73 
 
 		 555 aa  904    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1866  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  49.91 
 
 		 579 aa  607  9.999999999999999e-173  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0127  hydrogenase-4 component G  49.05 
 
 		 582 aa  593  1e-168  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.548953  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0711  DNA-3-methyladenine glycosylase I  50.62 
 
 		 578 aa  591  1e-167  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0105954  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1635  phage integrase family site specific recombinase  50.79 
 
 		 578 aa  588  1e-167  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0144556  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0183  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  49.91 
 
 		 567 aa  580  1e-164  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0316  NADH-ubiquinone oxidoreductase  38.21 
 
 		 561 aa  412  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.371145  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2786  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  38.06 
 
 		 557 aa  397  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2794  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  38.06 
 
 		 557 aa  397  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0795  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  36.96 
 
 		 525 aa  356  5.999999999999999e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4284  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  35.73 
 
 		 551 aa  294  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1687  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  32.77 
 
 		 530 aa  293  7e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2464  NADH dehydrogenase (quinone)  33.59 
 
 		 531 aa  286  5e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.511351  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0959  membrane bound hydrogenase subunit mbhL  38.19 
 
 		 406 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.105572  normal  0.5876 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1071  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  35.38 
 
 		 537 aa  281  3e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0675  NADH dehydrogenase (quinone)  38.16 
 
 		 414 aa  270  5.9999999999999995e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1130  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  39.9 
 
 		 402 aa  270  7e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3524  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  39.22 
 
 		 409 aa  269  8e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3020  ech hydrogenase subunit E  38.5 
 
 		 359 aa  261  3e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2590  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  34.67 
 
 		 409 aa  257  4e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3367  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  37.88 
 
 		 359 aa  257  5e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0595  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  37.54 
 
 		 409 aa  256  7e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1086  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  37.95 
 
 		 359 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00746179  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2227  NADH dehydrogenase (quinone)  34.28 
 
 		 419 aa  254  3e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1734  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  36.01 
 
 		 359 aa  254  4.0000000000000004e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00563551  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1425  ech hydrogenase subunit E  38.29 
 
 		 361 aa  252  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1745  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  37.99 
 
 		 359 aa  250  6e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.364735  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2728  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  36.41 
 
 		 359 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.316127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0803  NADH dehydrogenase (quinone)  36.41 
 
 		 359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0028  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  36.24 
 
 		 359 aa  244  3.9999999999999997e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2505  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  36.13 
 
 		 358 aa  243  7e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1123  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  35.24 
 
 		 526 aa  240  4e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1669  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  37.02 
 
 		 360 aa  241  4e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3189  NADH dehydrogenase (quinone)  35.96 
 
 		 377 aa  240  5e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.482242 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0553  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  36.52 
 
 		 358 aa  238  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0360  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  36.31 
 
 		 359 aa  238  3e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0148  ech hydrogenase subunit E  34.82 
 
 		 358 aa  237  4e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4118  NADH dehydrogenase (quinone)  36.03 
 
 		 358 aa  236  6e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0699  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  28.91 
 
 		 524 aa  236  7e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1522  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  35.29 
 
 		 358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0964  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  35.67 
 
 		 366 aa  234  3e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.138643 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1885  NADH dehydrogenase (quinone)  34.44 
 
 		 360 aa  233  5e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07260  ech hydrogenase subunit E  34.62 
 
 		 362 aa  233  1e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0794783  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0867  hydrogenase, group 4, EchE subunit, putative  36.59 
 
 		 359 aa  228  2e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.195553  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6069  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  31.83 
 
 		 524 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289137 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1102  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  36.06 
 
 		 358 aa  228  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4501  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  34.07 
 
 		 361 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0565202 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1574  NADH dehydrogenase (quinone)  35.99 
 
 		 362 aa  226  1e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.443946 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_770  hydrogenase, EchE subunit  36.59 
 
 		 359 aa  226  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0785  ech hydrogenase subunit E  36.31 
 
 		 359 aa  224  3e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0069  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  33.15 
 
 		 359 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0325  putative formate hydrogenlyase subunit  30.94 
 
 		 515 aa  221  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3188  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  31.89 
 
 		 503 aa  218  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.377236  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1138  hydrogenase subunit  31.89 
 
 		 527 aa  217  4e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0311036  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1073  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  31.69 
 
 		 503 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.1537600000000002e-34 
 
 
-
 
NC_002936  DET1571  hydrogenase, group 4, HycE subunit, putative  31.13 
 
 		 526 aa  213  5.999999999999999e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0265592  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1303  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  30.21 
 
 		 478 aa  213  7e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13380  ech hydrogenase subunit E  35.71 
 
 		 362 aa  210  5e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0206  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  30.12 
 
 		 794 aa  209  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000609108  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1317  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  30.49 
 
 		 526 aa  209  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1942  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  29.21 
 
 		 787 aa  208  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  30.5 
 
 		 791 aa  207  5e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0175  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit  31.49 
 
 		 522 aa  206  9e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1197  NADH dehydrogenase (quinone)  32.07 
 
 		 362 aa  206  1e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.450071  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1294  F420H2 dehydrogenase subunit D  31.47 
 
 		 374 aa  206  1e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.196635  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0170  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  32.18 
 
 		 501 aa  204  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.679833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3823  bifunctional NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit C/D  27.46 
 
 		 580 aa  204  4e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.203539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1449  hydrogenase, HycE subunit  31.13 
 
 		 526 aa  202  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0376579  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  28.98 
 
 		 793 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  30.08 
 
 		 792 aa  200  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3409  F420H2 dehydrogenase subunit D  31.51 
 
 		 374 aa  200  7e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.170957  normal  0.90197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>