More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1197 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1197  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
362 aa  753    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.450071  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0964  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  53.24 
 
 
366 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.138643 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3189  NADH dehydrogenase (quinone)  51.83 
 
 
377 aa  395  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.482242 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1885  NADH dehydrogenase (quinone)  51.27 
 
 
360 aa  397  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1425  ech hydrogenase subunit E  50.56 
 
 
361 aa  381  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4501  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  48.6 
 
 
361 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0565202 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0069  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  47.04 
 
 
359 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3524  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  38.4 
 
 
409 aa  280  3e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0595  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  37.57 
 
 
409 aa  271  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1086  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  40 
 
 
359 aa  267  2e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00746179  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1734  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  38.87 
 
 
359 aa  265  1e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00563551  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3367  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  37.57 
 
 
359 aa  263  4.999999999999999e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2227  NADH dehydrogenase (quinone)  36.84 
 
 
419 aa  261  1e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1102  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  38.31 
 
 
358 aa  258  1e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2728  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  38.31 
 
 
359 aa  258  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.316127  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1522  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  38.59 
 
 
358 aa  258  1e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3020  ech hydrogenase subunit E  37.46 
 
 
359 aa  254  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1669  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  38.31 
 
 
360 aa  253  3e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4118  NADH dehydrogenase (quinone)  37.02 
 
 
358 aa  251  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433928  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0803  NADH dehydrogenase (quinone)  37.18 
 
 
359 aa  250  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0867  hydrogenase, group 4, EchE subunit, putative  37.19 
 
 
359 aa  248  9e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.195553  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0148  ech hydrogenase subunit E  37.18 
 
 
358 aa  248  9e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2505  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  36.34 
 
 
358 aa  247  2e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1745  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  36.62 
 
 
359 aa  247  3e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.364735  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0785  ech hydrogenase subunit E  37.19 
 
 
359 aa  246  4e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1130  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  39.23 
 
 
402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_770  hydrogenase, EchE subunit  36.91 
 
 
359 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2590  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  34.96 
 
 
409 aa  243  5e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0553  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  38.12 
 
 
358 aa  238  9e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1071  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  35.01 
 
 
537 aa  238  1e-61  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0316  NADH-ubiquinone oxidoreductase  38.27 
 
 
561 aa  237  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.371145  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0028  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  34.93 
 
 
359 aa  235  7e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0371  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  37.82 
 
 
378 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07260  ech hydrogenase subunit E  36.13 
 
 
362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0794783  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0360  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  35.21 
 
 
359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1574  NADH dehydrogenase (quinone)  36.69 
 
 
362 aa  229  4e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.443946 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0959  membrane bound hydrogenase subunit mbhL  33.42 
 
 
406 aa  224  1e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.105572  normal  0.5876 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0183  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  34.83 
 
 
567 aa  223  3e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2186  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  34.17 
 
 
574 aa  222  9e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1184  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  36.91 
 
 
362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0675  NADH dehydrogenase (quinone)  36.56 
 
 
414 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2786  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  34.26 
 
 
557 aa  220  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2794  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  34.26 
 
 
557 aa  220  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  37.35 
 
 
367 aa  219  6e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13380  ech hydrogenase subunit E  35.67 
 
 
362 aa  217  2.9999999999999998e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0773  NADH dehydrogenase (quinone)  34.73 
 
 
378 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.597938  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0707  NADH dehydrogenase (quinone)  35.01 
 
 
375 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0116  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  35.01 
 
 
376 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1294  F420H2 dehydrogenase subunit D  35.47 
 
 
374 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.196635  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1211  NADH dehydrogenase (quinone)  34.73 
 
 
375 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  36.47 
 
 
367 aa  213  5.999999999999999e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.88 
 
 
367 aa  211  1e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1866  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  33.05 
 
 
579 aa  210  3e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2634  hydrogenase-4, G subunit  32.23 
 
 
571 aa  209  6e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3709  hydrogenase-4, G subunit  32.3 
 
 
571 aa  208  9e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3409  F420H2 dehydrogenase subunit D  36.67 
 
 
374 aa  207  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.170957  normal  0.90197 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2769  hydrogenase-4, G subunit  32.3 
 
 
571 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00990  Ni,Fe-hydrogenase III large subunit  33.98 
 
 
576 aa  207  3e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1052  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  35.65 
 
 
390 aa  206  5e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.718525  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1280  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  32.07 
 
 
575 aa  206  7e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.637418  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2105  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  33.43 
 
 
361 aa  205  8e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2713  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  31.79 
 
 
575 aa  205  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1897  NADH dehydrogenase subunit D  33.07 
 
 
405 aa  205  1e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.412503  normal  0.283556 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4570  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  32.02 
 
 
571 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2859  hydrogenase-4, G subunit  31.68 
 
 
571 aa  202  9e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1628  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.86 
 
 
369 aa  201  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.963572  normal  0.66391 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.87 
 
 
404 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0127  hydrogenase-4 component G  32.21 
 
 
582 aa  202  9.999999999999999e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.548953  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0572  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.16 
 
 
361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.591606  decreased coverage  0.000177209 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4983  NADH dehydrogenase (quinone)  37.04 
 
 
370 aa  199  5e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173613  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1300  NADH dehydrogenase (quinone)  35.31 
 
 
410 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.823444  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2430  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  30.34 
 
 
567 aa  198  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85735  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3001  formate hydrogenlyase subunit E  30.34 
 
 
569 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.33609  normal  0.016492 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3036  formate hydrogenlyase subunit E  30.34 
 
 
569 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2970  formate hydrogenlyase, subunit E  30.34 
 
 
569 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3159  formate hydrogenlyase, subunit E  30.34 
 
 
569 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.146854 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3052  formate hydrogenlyase subunit E  30.34 
 
 
569 aa  196  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.309808 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2992  NADH dehydrogenase (quinone)  35.63 
 
 
374 aa  195  9e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2846  formate hydrogenlyase, subunit E  29.78 
 
 
576 aa  194  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.15789 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3972  formate hydrogenlyase, subunit E  29.78 
 
 
576 aa  194  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02571  hydrogenase 3, large subunit  29.78 
 
 
569 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.671666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0968  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  29.78 
 
 
569 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0991  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  29.78 
 
 
569 aa  194  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0591467 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3155  formate hydrogenlyase, subunit E  29.78 
 
 
569 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2857  formate hydrogenlyase, subunit E  29.78 
 
 
569 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3009  formate hydrogenlyase, subunit E  29.78 
 
 
569 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02536  hypothetical protein  29.78 
 
 
569 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.576982  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3194  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  29.78 
 
 
569 aa  192  6e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2091  NADH dehydrogenase (quinone)  34.55 
 
 
374 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  33.93 
 
 
366 aa  192  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0711  DNA-3-methyladenine glycosylase I  31.37 
 
 
578 aa  192  1e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0105954  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1631  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  33.73 
 
 
358 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3748  NADH dehydrogenase (quinone)  33.63 
 
 
370 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000362019  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1635  phage integrase family site specific recombinase  30.81 
 
 
578 aa  190  4e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0144556  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02379  hydrogenase 4, subunit  30.85 
 
 
555 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1182  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  30.85 
 
 
555 aa  188  1e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1189  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  30.85 
 
 
555 aa  188  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.454918 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02341  hypothetical protein  30.85 
 
 
555 aa  188  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0795  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  30.9 
 
 
525 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2621  hydrogenase-4, G subunit  30.58 
 
 
555 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>