More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0183 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0183  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  100 
 
 
567 aa  1158    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2186  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  54.61 
 
 
574 aa  622  1e-177  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2859  hydrogenase-4, G subunit  49.46 
 
 
571 aa  585  1e-166  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3709  hydrogenase-4, G subunit  49.1 
 
 
571 aa  587  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2634  hydrogenase-4, G subunit  49.46 
 
 
571 aa  585  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4570  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  53.46 
 
 
571 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2769  hydrogenase-4, G subunit  49.28 
 
 
571 aa  584  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1280  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  49.91 
 
 
575 aa  580  1e-164  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.637418  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2430  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  50.18 
 
 
567 aa  576  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85735  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2713  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  49.26 
 
 
575 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02571  hydrogenase 3, large subunit  49.64 
 
 
569 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.671666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0968  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  49.64 
 
 
569 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2970  formate hydrogenlyase, subunit E  49.45 
 
 
569 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3155  formate hydrogenlyase, subunit E  49.82 
 
 
569 aa  575  1.0000000000000001e-162  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3159  formate hydrogenlyase, subunit E  49.45 
 
 
569 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.146854 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3036  formate hydrogenlyase subunit E  49.45 
 
 
569 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143989 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02536  hypothetical protein  49.64 
 
 
569 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.576982  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2846  formate hydrogenlyase, subunit E  49.64 
 
 
576 aa  574  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.15789 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3972  formate hydrogenlyase, subunit E  49.82 
 
 
576 aa  574  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3052  formate hydrogenlyase subunit E  49.45 
 
 
569 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.309808 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3001  formate hydrogenlyase subunit E  49.45 
 
 
569 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.33609  normal  0.016492 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0991  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  49.64 
 
 
569 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0591467 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3009  formate hydrogenlyase, subunit E  49.82 
 
 
569 aa  574  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2857  formate hydrogenlyase, subunit E  49.64 
 
 
569 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3194  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  49.72 
 
 
569 aa  563  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02379  hydrogenase 4, subunit  47.83 
 
 
555 aa  558  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1182  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  47.83 
 
 
555 aa  558  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1189  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  47.83 
 
 
555 aa  558  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.454918 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02341  hypothetical protein  47.83 
 
 
555 aa  558  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2621  hydrogenase-4, G subunit  47.65 
 
 
555 aa  556  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00990  Ni,Fe-hydrogenase III large subunit  48.82 
 
 
576 aa  546  1e-154  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1866  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  48.86 
 
 
579 aa  541  9.999999999999999e-153  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0711  DNA-3-methyladenine glycosylase I  47.85 
 
 
578 aa  541  9.999999999999999e-153  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0105954  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1635  phage integrase family site specific recombinase  47.49 
 
 
578 aa  537  1e-151  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0144556  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0127  hydrogenase-4 component G  47.54 
 
 
582 aa  526  1e-148  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.548953  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0316  NADH-ubiquinone oxidoreductase  44.44 
 
 
561 aa  479  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.371145  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2786  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  42.93 
 
 
557 aa  472  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2794  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  42.93 
 
 
557 aa  472  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0795  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  41.98 
 
 
525 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1687  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  36.29 
 
 
530 aa  356  5.999999999999999e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2464  NADH dehydrogenase (quinone)  37.88 
 
 
531 aa  354  2e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.511351  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0699  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  33.9 
 
 
524 aa  316  8e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.758996  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1071  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  36.62 
 
 
537 aa  313  6.999999999999999e-84  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0595  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  44.2 
 
 
409 aa  310  4e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4284  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  34.72 
 
 
551 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1130  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  45.03 
 
 
402 aa  295  1e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1086  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  43.82 
 
 
359 aa  293  5e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00746179  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0675  NADH dehydrogenase (quinone)  42.28 
 
 
414 aa  290  4e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3524  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  41.94 
 
 
409 aa  289  9e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2227  NADH dehydrogenase (quinone)  38.83 
 
 
419 aa  282  1e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2590  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  39.34 
 
 
409 aa  279  8e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1734  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  41.29 
 
 
359 aa  276  1.0000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00563551  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2728  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  42.13 
 
 
359 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.316127  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3020  ech hydrogenase subunit E  40.17 
 
 
359 aa  272  1e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0028  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  41.9 
 
 
359 aa  271  2e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0959  membrane bound hydrogenase subunit mbhL  38.68 
 
 
406 aa  271  2e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.105572  normal  0.5876 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1123  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  36.76 
 
 
526 aa  271  2.9999999999999997e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.165135  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1102  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  41.9 
 
 
358 aa  267  4e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1885  NADH dehydrogenase (quinone)  38.76 
 
 
360 aa  264  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1522  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  39.89 
 
 
358 aa  263  6e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1745  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  42.9 
 
 
359 aa  263  6.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.364735  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2505  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  39.04 
 
 
358 aa  262  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0360  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  40.73 
 
 
359 aa  261  3e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0964  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  39.33 
 
 
366 aa  261  3e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.138643 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0803  NADH dehydrogenase (quinone)  40.73 
 
 
359 aa  258  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1425  ech hydrogenase subunit E  38.1 
 
 
361 aa  258  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3367  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  37.08 
 
 
359 aa  258  3e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0553  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  40.56 
 
 
358 aa  257  3e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0867  hydrogenase, group 4, EchE subunit, putative  40.62 
 
 
359 aa  253  7e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.195553  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4118  NADH dehydrogenase (quinone)  38.48 
 
 
358 aa  252  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433928  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3189  NADH dehydrogenase (quinone)  38.48 
 
 
377 aa  251  3e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.482242 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1669  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  38.48 
 
 
360 aa  249  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1303  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  34.73 
 
 
478 aa  248  2e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0148  ech hydrogenase subunit E  37.36 
 
 
358 aa  248  2e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_770  hydrogenase, EchE subunit  40.34 
 
 
359 aa  247  3e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4501  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  36.57 
 
 
361 aa  247  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0565202 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6069  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  33.81 
 
 
524 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00289137 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0785  ech hydrogenase subunit E  39.78 
 
 
359 aa  245  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1138  hydrogenase subunit  35.33 
 
 
527 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0311036  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0325  putative formate hydrogenlyase subunit  34.09 
 
 
515 aa  243  7e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1571  hydrogenase, group 4, HycE subunit, putative  34.38 
 
 
526 aa  243  1e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0265592  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1317  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  31.55 
 
 
526 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1574  NADH dehydrogenase (quinone)  37.33 
 
 
362 aa  240  5e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.443946 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13380  ech hydrogenase subunit E  37.71 
 
 
362 aa  239  1e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4707  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  34.74 
 
 
486 aa  237  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07260  ech hydrogenase subunit E  36.03 
 
 
362 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0794783  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1449  hydrogenase, HycE subunit  34.38 
 
 
526 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0376579  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1818  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  33.4 
 
 
519 aa  232  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.207478  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0069  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  35.83 
 
 
359 aa  229  7e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  33.19 
 
 
791 aa  230  7e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  34.11 
 
 
793 aa  228  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0175  putative NADH-ubiquinone oxidoreductase subunit  32.86 
 
 
522 aa  228  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0933  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  35.44 
 
 
502 aa  226  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1294  F420H2 dehydrogenase subunit D  36.24 
 
 
374 aa  225  2e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.196635  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1197  NADH dehydrogenase (quinone)  34.83 
 
 
362 aa  223  6e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.450071  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  34.05 
 
 
792 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0306  NADH dehydrogenase (quinone)  34.22 
 
 
374 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1052  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  37.05 
 
 
390 aa  220  5e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.718525  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3409  F420H2 dehydrogenase subunit D  35.25 
 
 
374 aa  219  1e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.170957  normal  0.90197 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0473  NADH dehydrogenase (quinone)  35.68 
 
 
375 aa  219  1e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.330146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>