More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1086 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1086  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  100 
 
 
359 aa  737    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00746179  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3367  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  71.07 
 
 
359 aa  549  1e-155  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1522  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  65.55 
 
 
358 aa  511  1e-144  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3020  ech hydrogenase subunit E  65.18 
 
 
359 aa  500  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2505  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  64.99 
 
 
358 aa  495  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1734  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  62.95 
 
 
359 aa  490  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00563551  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1102  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  61.8 
 
 
358 aa  473  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4118  NADH dehydrogenase (quinone)  62.36 
 
 
358 aa  473  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433928  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0803  NADH dehydrogenase (quinone)  59.61 
 
 
359 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0360  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  61.84 
 
 
359 aa  466  9.999999999999999e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0867  hydrogenase, group 4, EchE subunit, putative  62.18 
 
 
359 aa  464  1e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.195553  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1669  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  58.94 
 
 
360 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0785  ech hydrogenase subunit E  61 
 
 
359 aa  458  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_770  hydrogenase, EchE subunit  61.9 
 
 
359 aa  459  9.999999999999999e-129  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2728  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  58.5 
 
 
359 aa  451  1e-125  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.316127  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1745  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  56.82 
 
 
359 aa  441  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.364735  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0148  ech hydrogenase subunit E  58.15 
 
 
358 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0028  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  57.1 
 
 
359 aa  441  9.999999999999999e-123  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07260  ech hydrogenase subunit E  57.73 
 
 
362 aa  431  1e-120  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0794783  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0553  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  57.02 
 
 
358 aa  430  1e-119  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1574  NADH dehydrogenase (quinone)  56.35 
 
 
362 aa  426  1e-118  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.443946 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13380  ech hydrogenase subunit E  56.91 
 
 
362 aa  423  1e-117  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0595  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  43.49 
 
 
409 aa  327  3e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3524  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  44.79 
 
 
409 aa  323  3e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2227  NADH dehydrogenase (quinone)  42.7 
 
 
419 aa  315  5e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1130  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  46.24 
 
 
402 aa  309  4e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1071  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  42.9 
 
 
537 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3189  NADH dehydrogenase (quinone)  41.81 
 
 
377 aa  298  1e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.482242 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0964  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  41.81 
 
 
366 aa  295  1e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.138643 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1425  ech hydrogenase subunit E  42.98 
 
 
361 aa  293  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0183  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  43.82 
 
 
567 aa  293  3e-78  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0316  NADH-ubiquinone oxidoreductase  42.27 
 
 
561 aa  289  4e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.371145  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4501  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  41.57 
 
 
361 aa  288  7e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0565202 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2590  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  41.19 
 
 
409 aa  288  8e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1885  NADH dehydrogenase (quinone)  39.17 
 
 
360 aa  285  7e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0675  NADH dehydrogenase (quinone)  38.65 
 
 
414 aa  268  1e-70  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1197  NADH dehydrogenase (quinone)  40 
 
 
362 aa  267  2e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.450071  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0959  membrane bound hydrogenase subunit mbhL  37.2 
 
 
406 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.105572  normal  0.5876 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2186  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  39.94 
 
 
574 aa  260  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2430  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  39.5 
 
 
567 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85735  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2713  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  37.67 
 
 
575 aa  255  7e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1280  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  37.95 
 
 
575 aa  255  7e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.637418  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3972  formate hydrogenlyase, subunit E  37.85 
 
 
576 aa  250  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3709  hydrogenase-4, G subunit  38.16 
 
 
571 aa  250  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2846  formate hydrogenlyase, subunit E  37.85 
 
 
576 aa  250  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.15789 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02571  hydrogenase 3, large subunit  37.85 
 
 
569 aa  250  3e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.671666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0968  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  37.85 
 
 
569 aa  250  3e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02536  hypothetical protein  37.85 
 
 
569 aa  250  3e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.576982  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2634  hydrogenase-4, G subunit  38.16 
 
 
571 aa  250  3e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0991  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  37.85 
 
 
569 aa  250  3e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0591467 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2857  formate hydrogenlyase, subunit E  37.85 
 
 
569 aa  250  3e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3009  formate hydrogenlyase, subunit E  37.85 
 
 
569 aa  250  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2769  hydrogenase-4, G subunit  38.16 
 
 
571 aa  249  4e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3155  formate hydrogenlyase, subunit E  37.57 
 
 
569 aa  249  4e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0069  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  36.97 
 
 
359 aa  249  7e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4570  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  38.23 
 
 
571 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3001  formate hydrogenlyase subunit E  37.57 
 
 
569 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.33609  normal  0.016492 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3159  formate hydrogenlyase, subunit E  37.57 
 
 
569 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.146854 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3194  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  37.85 
 
 
569 aa  248  2e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3052  formate hydrogenlyase subunit E  37.57 
 
 
569 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.309808 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2970  formate hydrogenlyase, subunit E  37.57 
 
 
569 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3036  formate hydrogenlyase subunit E  37.57 
 
 
569 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143989 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1294  F420H2 dehydrogenase subunit D  36.54 
 
 
374 aa  246  4e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.196635  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0371  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  40.62 
 
 
378 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2859  hydrogenase-4, G subunit  37.67 
 
 
571 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2786  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  39.17 
 
 
557 aa  243  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2794  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  39.17 
 
 
557 aa  243  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3409  F420H2 dehydrogenase subunit D  37.36 
 
 
374 aa  243  5e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.170957  normal  0.90197 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0127  hydrogenase-4 component G  37.29 
 
 
582 aa  241  2e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.548953  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3859  NADH dehydrogenase (quinone)  36.51 
 
 
420 aa  236  6e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1866  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  36.97 
 
 
579 aa  233  3e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02379  hydrogenase 4, subunit  36.31 
 
 
555 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1182  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  36.31 
 
 
555 aa  229  4e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02341  hypothetical protein  36.31 
 
 
555 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1189  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  36.31 
 
 
555 aa  229  4e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.454918 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0773  NADH dehydrogenase (quinone)  37.15 
 
 
378 aa  228  1e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.597938  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0711  DNA-3-methyladenine glycosylase I  36.69 
 
 
578 aa  226  5.0000000000000005e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0105954  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2621  hydrogenase-4, G subunit  36.03 
 
 
555 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0306  NADH dehydrogenase (quinone)  35.54 
 
 
374 aa  223  4e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2045  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  37.27 
 
 
406 aa  223  4e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0264179 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1635  phage integrase family site specific recombinase  35.85 
 
 
578 aa  223  4.9999999999999996e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0144556  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1211  NADH dehydrogenase (quinone)  37.05 
 
 
375 aa  223  6e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.19 
 
 
401 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0707  NADH dehydrogenase (quinone)  36.26 
 
 
375 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00990  Ni,Fe-hydrogenase III large subunit  35.28 
 
 
576 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2105  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  35.36 
 
 
361 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0116  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  36.26 
 
 
376 aa  220  3e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1052  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  37.19 
 
 
390 aa  220  3e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.718525  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0401  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  35 
 
 
375 aa  220  3e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.92 
 
 
381 aa  218  8.999999999999998e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0434  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  35.08 
 
 
375 aa  217  2e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.706219  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0473  NADH dehydrogenase (quinone)  34.81 
 
 
375 aa  218  2e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.330146  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1518  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  34.72 
 
 
375 aa  217  2e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.100115  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.03 
 
 
400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1184  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  36.89 
 
 
362 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.51 
 
 
390 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  31.96 
 
 
417 aa  211  1e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.03 
 
 
390 aa  211  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.16 
 
 
389 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0331  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  33.42 
 
 
407 aa  210  3e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.925888  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>