More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1745 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1745  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  100 
 
 		 359 aa  734    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.364735  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2728  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  66.57 
 
 		 359 aa  518  1e-146  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.316127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0028  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  64.07 
 
 		 359 aa  498  1e-140  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0360  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  64.07 
 
 		 359 aa  485  1e-136  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3020  ech hydrogenase subunit E  61 
 
 		 359 aa  486  1e-136  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1734  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  60.72 
 
 		 359 aa  473  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00563551  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4118  NADH dehydrogenase (quinone)  60.39 
 
 		 358 aa  460  9.999999999999999e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0803  NADH dehydrogenase (quinone)  56.55 
 
 		 359 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1086  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  56.82 
 
 		 359 aa  441  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00746179  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1102  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  56.18 
 
 		 358 aa  436  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0553  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  57.58 
 
 		 358 aa  433  1e-120  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1522  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  55.99 
 
 		 358 aa  431  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3367  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  52.11 
 
 		 359 aa  422  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1669  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  54.75 
 
 		 360 aa  419  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2505  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  55.71 
 
 		 358 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1574  NADH dehydrogenase (quinone)  53.04 
 
 		 362 aa  408  1e-113  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.443946 
 
 
-
 
NC_002936  DET0867  hydrogenase, group 4, EchE subunit, putative  52.79 
 
 		 359 aa  392  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.195553  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0785  ech hydrogenase subunit E  53.35 
 
 		 359 aa  393  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_770  hydrogenase, EchE subunit  52.79 
 
 		 359 aa  390  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0148  ech hydrogenase subunit E  50.42 
 
 		 358 aa  386  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13380  ech hydrogenase subunit E  52.21 
 
 		 362 aa  388  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07260  ech hydrogenase subunit E  50 
 
 		 362 aa  384  1e-105  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0794783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1071  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  41.55 
 
 		 537 aa  297  2e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3524  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  39.94 
 
 		 409 aa  281  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1130  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  43.73 
 
 		 402 aa  278  8e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0595  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  38.72 
 
 		 409 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0316  NADH-ubiquinone oxidoreductase  39.89 
 
 		 561 aa  269  5e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.371145  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2186  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  41.01 
 
 		 574 aa  268  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2227  NADH dehydrogenase (quinone)  37.95 
 
 		 419 aa  264  2e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1885  NADH dehydrogenase (quinone)  37.78 
 
 		 360 aa  263  4e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0183  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  42.9 
 
 		 567 aa  263  4e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0964  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  38.98 
 
 		 366 aa  257  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.138643 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0959  membrane bound hydrogenase subunit mbhL  36.04 
 
 		 406 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.105572  normal  0.5876 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2590  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  37.94 
 
 		 409 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2713  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  38.27 
 
 		 575 aa  251  1e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1425  ech hydrogenase subunit E  38.12 
 
 		 361 aa  251  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1280  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  37.99 
 
 		 575 aa  250  3e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.637418  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3189  NADH dehydrogenase (quinone)  37.57 
 
 		 377 aa  250  3e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.482242 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3709  hydrogenase-4, G subunit  37.82 
 
 		 571 aa  247  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1197  NADH dehydrogenase (quinone)  36.62 
 
 		 362 aa  247  3e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.450071  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2634  hydrogenase-4, G subunit  37.82 
 
 		 571 aa  247  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2769  hydrogenase-4, G subunit  37.82 
 
 		 571 aa  246  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0675  NADH dehydrogenase (quinone)  36.76 
 
 		 414 aa  243  3e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2859  hydrogenase-4, G subunit  37.25 
 
 		 571 aa  241  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3159  formate hydrogenlyase, subunit E  37.16 
 
 		 569 aa  239  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.146854 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3001  formate hydrogenlyase subunit E  37.16 
 
 		 569 aa  239  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.33609  normal  0.016492 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3052  formate hydrogenlyase subunit E  37.16 
 
 		 569 aa  239  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.309808 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2970  formate hydrogenlyase, subunit E  37.16 
 
 		 569 aa  239  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3194  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  36.96 
 
 		 569 aa  239  6.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3036  formate hydrogenlyase subunit E  37.16 
 
 		 569 aa  239  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143989 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0371  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  38.48 
 
 		 378 aa  238  1e-61  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2430  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  36.36 
 
 		 567 aa  238  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3972  formate hydrogenlyase, subunit E  36.61 
 
 		 576 aa  237  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2846  formate hydrogenlyase, subunit E  36.61 
 
 		 576 aa  237  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.15789 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02571  hydrogenase 3, large subunit  36.61 
 
 		 569 aa  236  4e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.671666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0968  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  36.61 
 
 		 569 aa  236  4e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2857  formate hydrogenlyase, subunit E  36.61 
 
 		 569 aa  236  4e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3155  formate hydrogenlyase, subunit E  36.61 
 
 		 569 aa  236  4e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3009  formate hydrogenlyase, subunit E  36.61 
 
 		 569 aa  236  4e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0991  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  36.61 
 
 		 569 aa  236  4e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0591467 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02536  hypothetical protein  36.61 
 
 		 569 aa  236  4e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.576982  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4501  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  34.72 
 
 		 361 aa  235  8e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0565202 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4570  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  35.83 
 
 		 571 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2786  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  36.69 
 
 		 557 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2794  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  36.69 
 
 		 557 aa  231  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0127  hydrogenase-4 component G  37.25 
 
 		 582 aa  230  3e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.548953  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1294  F420H2 dehydrogenase subunit D  33.51 
 
 		 374 aa  229  8e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.196635  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0773  NADH dehydrogenase (quinone)  36.49 
 
 		 378 aa  228  9e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.597938  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0069  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  35.67 
 
 		 359 aa  227  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3409  F420H2 dehydrogenase subunit D  32.7 
 
 		 374 aa  224  1e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.170957  normal  0.90197 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0707  NADH dehydrogenase (quinone)  35.47 
 
 		 375 aa  225  1e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0116  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  35.47 
 
 		 376 aa  223  3e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1211  NADH dehydrogenase (quinone)  35.2 
 
 		 375 aa  222  8e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1866  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  36.19 
 
 		 579 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02379  hydrogenase 4, subunit  35.11 
 
 		 555 aa  220  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1182  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  35.11 
 
 		 555 aa  220  3e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02341  hypothetical protein  35.11 
 
 		 555 aa  220  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1189  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  35.11 
 
 		 555 aa  220  3e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.454918 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0847  NADH dehydrogenase (quinone)  35.58 
 
 		 395 aa  218  1e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1052  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  36.19 
 
 		 390 aa  218  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.718525  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0964  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  35.58 
 
 		 400 aa  218  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0318919  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  35.85 
 
 		 400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2621  hydrogenase-4, G subunit  34.83 
 
 		 555 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00990  Ni,Fe-hydrogenase III large subunit  34.69 
 
 		 576 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1604  NADH dehydrogenase (quinone)  35.58 
 
 		 400 aa  216  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1184  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  32.5 
 
 		 362 aa  216  7e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0746  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  35.85 
 
 		 395 aa  215  8e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.946717 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2105  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  32.49 
 
 		 361 aa  215  8e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0637  NADH dehydrogenase I, 49 kDa subunit  35.85 
 
 		 400 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.447467  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3859  NADH dehydrogenase (quinone)  32.64 
 
 		 420 aa  213  3.9999999999999995e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0202  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  33.51 
 
 		 373 aa  211  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0711  DNA-3-methyladenine glycosylase I  34.73 
 
 		 578 aa  211  2e-53  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0105954  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  33.52 
 
 		 366 aa  209  5e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1635  phage integrase family site specific recombinase  34.17 
 
 		 578 aa  209  7e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0144556  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0572  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.05 
 
 		 361 aa  208  1e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.591606  decreased coverage  0.000177209 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  34.77 
 
 		 400 aa  207  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.491402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  31.61 
 
 		 401 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4983  NADH dehydrogenase (quinone)  33.78 
 
 		 370 aa  207  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173613  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.74 
 
 		 389 aa  205  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4286  NADH dehydrogenase (quinone)  34.52 
 
 		 388 aa  205  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.145773  normal  0.872647 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>