More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0553 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0553  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  100 
 
 
358 aa  738    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1102  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  70.67 
 
 
358 aa  534  1e-151  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0867  hydrogenase, group 4, EchE subunit, putative  62.95 
 
 
359 aa  473  1e-132  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.195553  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_770  hydrogenase, EchE subunit  61.84 
 
 
359 aa  466  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0785  ech hydrogenase subunit E  61.84 
 
 
359 aa  464  1e-129  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1745  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  57.58 
 
 
359 aa  433  1e-120  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.364735  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1086  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  57.02 
 
 
359 aa  430  1e-119  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00746179  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3020  ech hydrogenase subunit E  54.49 
 
 
359 aa  419  1e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0360  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  56.74 
 
 
359 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1522  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  55.03 
 
 
358 aa  413  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1734  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  53.93 
 
 
359 aa  412  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00563551  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2728  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  54.78 
 
 
359 aa  413  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.316127  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4118  NADH dehydrogenase (quinone)  55.59 
 
 
358 aa  410  1e-113  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433928  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1669  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  56.82 
 
 
360 aa  410  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3367  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  52.65 
 
 
359 aa  402  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0028  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  53.37 
 
 
359 aa  403  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2505  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  53.07 
 
 
358 aa  391  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0148  ech hydrogenase subunit E  51.41 
 
 
358 aa  378  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1574  NADH dehydrogenase (quinone)  50 
 
 
362 aa  366  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.443946 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0803  NADH dehydrogenase (quinone)  48.88 
 
 
359 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07260  ech hydrogenase subunit E  50.56 
 
 
362 aa  355  5e-97  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0794783  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13380  ech hydrogenase subunit E  48.62 
 
 
362 aa  348  1e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3524  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  43.06 
 
 
409 aa  316  5e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0595  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  40.56 
 
 
409 aa  300  3e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1130  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  44.04 
 
 
402 aa  294  2e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1071  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  41.39 
 
 
537 aa  277  2e-73  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0964  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  40.11 
 
 
366 aa  273  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.138643 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2227  NADH dehydrogenase (quinone)  37.4 
 
 
419 aa  271  1e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1885  NADH dehydrogenase (quinone)  39.72 
 
 
360 aa  270  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3189  NADH dehydrogenase (quinone)  39.11 
 
 
377 aa  268  1e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.482242 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0959  membrane bound hydrogenase subunit mbhL  39.13 
 
 
406 aa  264  1e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.105572  normal  0.5876 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0183  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  40.56 
 
 
567 aa  257  2e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1425  ech hydrogenase subunit E  39.06 
 
 
361 aa  251  1e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4501  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  38.5 
 
 
361 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0565202 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0675  NADH dehydrogenase (quinone)  37.53 
 
 
414 aa  246  4e-64  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0316  NADH-ubiquinone oxidoreductase  39.15 
 
 
561 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.371145  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2590  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  36.76 
 
 
409 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2186  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  37.15 
 
 
574 aa  244  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2846  formate hydrogenlyase, subunit E  37.18 
 
 
576 aa  239  5e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.15789 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3972  formate hydrogenlyase, subunit E  37.18 
 
 
576 aa  239  5e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02571  hydrogenase 3, large subunit  37.18 
 
 
569 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.671666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0968  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  37.18 
 
 
569 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3155  formate hydrogenlyase, subunit E  37.18 
 
 
569 aa  239  5.999999999999999e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3009  formate hydrogenlyase, subunit E  37.18 
 
 
569 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02536  hypothetical protein  37.18 
 
 
569 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.576982  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0991  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  37.18 
 
 
569 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0591467 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2857  formate hydrogenlyase, subunit E  37.18 
 
 
569 aa  239  5.999999999999999e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1197  NADH dehydrogenase (quinone)  38.12 
 
 
362 aa  238  8e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.450071  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1280  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  36.52 
 
 
575 aa  238  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.637418  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3159  formate hydrogenlyase, subunit E  36.9 
 
 
569 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.146854 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2970  formate hydrogenlyase, subunit E  36.9 
 
 
569 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3052  formate hydrogenlyase subunit E  36.9 
 
 
569 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.309808 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3001  formate hydrogenlyase subunit E  36.9 
 
 
569 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.33609  normal  0.016492 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3036  formate hydrogenlyase subunit E  36.9 
 
 
569 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143989 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2430  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  37.18 
 
 
567 aa  234  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85735  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2713  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  36.24 
 
 
575 aa  234  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3194  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  36.62 
 
 
569 aa  232  6e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3409  F420H2 dehydrogenase subunit D  35.91 
 
 
374 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.170957  normal  0.90197 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0127  hydrogenase-4 component G  37.15 
 
 
582 aa  231  2e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.548953  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3709  hydrogenase-4, G subunit  36.11 
 
 
571 aa  229  8e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2769  hydrogenase-4, G subunit  37.36 
 
 
571 aa  228  8e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2634  hydrogenase-4, G subunit  36.11 
 
 
571 aa  229  8e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0371  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  38.31 
 
 
378 aa  227  2e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1294  F420H2 dehydrogenase subunit D  34.35 
 
 
374 aa  227  3e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.196635  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4570  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  35.49 
 
 
571 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2859  hydrogenase-4, G subunit  35.44 
 
 
571 aa  224  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3859  NADH dehydrogenase (quinone)  33.42 
 
 
420 aa  222  8e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2105  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  36.13 
 
 
361 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0711  DNA-3-methyladenine glycosylase I  34.35 
 
 
578 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0105954  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0069  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  35.69 
 
 
359 aa  220  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1635  phage integrase family site specific recombinase  33.24 
 
 
578 aa  219  5e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0144556  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1866  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  34.82 
 
 
579 aa  219  6e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2786  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  34.55 
 
 
557 aa  216  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2794  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  34.55 
 
 
557 aa  216  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1628  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.75 
 
 
369 aa  215  7e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.963572  normal  0.66391 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0773  NADH dehydrogenase (quinone)  35.88 
 
 
378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.597938  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1184  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  35.83 
 
 
362 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0707  NADH dehydrogenase (quinone)  36.8 
 
 
375 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1211  NADH dehydrogenase (quinone)  36.8 
 
 
375 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4983  NADH dehydrogenase (quinone)  34.26 
 
 
370 aa  213  5.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173613  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0116  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  36.8 
 
 
376 aa  212  7e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2091  NADH dehydrogenase (quinone)  34.62 
 
 
374 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.77 
 
 
404 aa  209  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1052  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  36.13 
 
 
390 aa  209  5e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.718525  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2992  NADH dehydrogenase (quinone)  34.34 
 
 
374 aa  208  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0202  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  34.26 
 
 
373 aa  208  1e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.03 
 
 
390 aa  208  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00990  Ni,Fe-hydrogenase III large subunit  34.44 
 
 
576 aa  207  2e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0572  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.01 
 
 
361 aa  205  9e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.591606  decreased coverage  0.000177209 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1604  NADH dehydrogenase (quinone)  35.16 
 
 
400 aa  203  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.17 
 
 
401 aa  203  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  30.47 
 
 
390 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02379  hydrogenase 4, subunit  33.43 
 
 
555 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1182  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  33.43 
 
 
555 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1189  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  33.43 
 
 
555 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.454918 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02341  hypothetical protein  33.43 
 
 
555 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  29.69 
 
 
390 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  30.73 
 
 
389 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  30.47 
 
 
389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2621  hydrogenase-4, G subunit  33.15 
 
 
555 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>