More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4118 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4118  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
358 aa  722    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433928  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1734  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  64.04 
 
 
359 aa  501  1e-141  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00563551  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3020  ech hydrogenase subunit E  65.17 
 
 
359 aa  501  1e-141  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0803  NADH dehydrogenase (quinone)  62.92 
 
 
359 aa  486  1e-136  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0360  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  63.76 
 
 
359 aa  482  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2728  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  62.36 
 
 
359 aa  475  1e-133  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.316127  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0028  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  61 
 
 
359 aa  477  1e-133  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1086  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  62.36 
 
 
359 aa  473  1e-132  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00746179  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1745  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  60.39 
 
 
359 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.364735  normal  0.190355 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1522  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  59.22 
 
 
358 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3367  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  55.43 
 
 
359 aa  442  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2505  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  58.94 
 
 
358 aa  441  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1669  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  58.03 
 
 
360 aa  434  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1102  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  56.98 
 
 
358 aa  434  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0867  hydrogenase, group 4, EchE subunit, putative  55.71 
 
 
359 aa  413  1e-114  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.195553  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0785  ech hydrogenase subunit E  55.37 
 
 
359 aa  414  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07260  ech hydrogenase subunit E  56.7 
 
 
362 aa  408  1e-113  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0794783  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_770  hydrogenase, EchE subunit  55.43 
 
 
359 aa  410  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0553  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  55.59 
 
 
358 aa  410  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1574  NADH dehydrogenase (quinone)  56.42 
 
 
362 aa  406  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.443946 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13380  ech hydrogenase subunit E  55.87 
 
 
362 aa  388  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0148  ech hydrogenase subunit E  50.28 
 
 
358 aa  385  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0595  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  42.22 
 
 
409 aa  310  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3524  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  42.78 
 
 
409 aa  310  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2227  NADH dehydrogenase (quinone)  38.84 
 
 
419 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0959  membrane bound hydrogenase subunit mbhL  39.25 
 
 
406 aa  280  3e-74  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.105572  normal  0.5876 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1130  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  40.56 
 
 
402 aa  270  2e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1071  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  38.55 
 
 
537 aa  271  2e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0316  NADH-ubiquinone oxidoreductase  40.78 
 
 
561 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.371145  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2590  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  37.94 
 
 
409 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1425  ech hydrogenase subunit E  38.23 
 
 
361 aa  260  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2186  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  39.33 
 
 
574 aa  259  6e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3189  NADH dehydrogenase (quinone)  37.29 
 
 
377 aa  257  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.482242 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0964  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  38.14 
 
 
366 aa  257  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.138643 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0183  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  38.48 
 
 
567 aa  252  7e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1197  NADH dehydrogenase (quinone)  37.02 
 
 
362 aa  251  9.000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.450071  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0675  NADH dehydrogenase (quinone)  36.76 
 
 
414 aa  251  2e-65  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0371  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  38.33 
 
 
378 aa  247  2e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1885  NADH dehydrogenase (quinone)  35.03 
 
 
360 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2713  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  35.29 
 
 
575 aa  237  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1280  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  36.03 
 
 
575 aa  236  3e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.637418  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3709  hydrogenase-4, G subunit  35.85 
 
 
571 aa  234  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2430  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  36.31 
 
 
567 aa  235  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.85735  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2634  hydrogenase-4, G subunit  35.85 
 
 
571 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2769  hydrogenase-4, G subunit  35.85 
 
 
571 aa  233  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4501  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  35.39 
 
 
361 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0565202 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0773  NADH dehydrogenase (quinone)  35.38 
 
 
378 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.597938  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1866  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  35.57 
 
 
579 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3409  F420H2 dehydrogenase subunit D  34.34 
 
 
374 aa  231  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.170957  normal  0.90197 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2859  hydrogenase-4, G subunit  35.29 
 
 
571 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1211  NADH dehydrogenase (quinone)  34.26 
 
 
375 aa  227  2e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0069  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  36.13 
 
 
359 aa  228  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3009  formate hydrogenlyase, subunit E  34.54 
 
 
569 aa  227  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02571  hydrogenase 3, large subunit  34.54 
 
 
569 aa  227  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.671666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0968  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  34.54 
 
 
569 aa  227  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2857  formate hydrogenlyase, subunit E  34.54 
 
 
569 aa  227  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3972  formate hydrogenlyase, subunit E  34.54 
 
 
576 aa  227  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2846  formate hydrogenlyase, subunit E  34.54 
 
 
576 aa  227  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.15789 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02536  hypothetical protein  34.54 
 
 
569 aa  227  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.576982  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3155  formate hydrogenlyase, subunit E  34.54 
 
 
569 aa  227  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0991  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  34.54 
 
 
569 aa  227  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0591467 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3052  formate hydrogenlyase subunit E  34.54 
 
 
569 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.309808 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2970  formate hydrogenlyase, subunit E  34.54 
 
 
569 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3036  formate hydrogenlyase subunit E  34.54 
 
 
569 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143989 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3159  formate hydrogenlyase, subunit E  34.54 
 
 
569 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.146854 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3001  formate hydrogenlyase subunit E  34.54 
 
 
569 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.33609  normal  0.016492 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3194  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  34.82 
 
 
569 aa  226  5.0000000000000005e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2786  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  36.67 
 
 
557 aa  226  6e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2794  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  36.67 
 
 
557 aa  226  6e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0707  NADH dehydrogenase (quinone)  33.98 
 
 
375 aa  225  9e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4570  NADH dehydrogenase (ubiquinone), 30 kDa subunit  35.47 
 
 
571 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1294  F420H2 dehydrogenase subunit D  33.69 
 
 
374 aa  224  1e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.196635  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0116  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  33.98 
 
 
376 aa  224  2e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1635  phage integrase family site specific recombinase  33.33 
 
 
578 aa  223  3e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0144556  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0127  hydrogenase-4 component G  33.7 
 
 
582 aa  223  3e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.548953  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1184  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  36.36 
 
 
362 aa  223  3e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0711  DNA-3-methyladenine glycosylase I  33.33 
 
 
578 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0105954  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2105  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  34.99 
 
 
361 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1052  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  34.33 
 
 
390 aa  219  6e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.718525  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0572  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.15 
 
 
361 aa  218  1e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.591606  decreased coverage  0.000177209 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00990  Ni,Fe-hydrogenase III large subunit  34.44 
 
 
576 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.823272  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3859  NADH dehydrogenase (quinone)  32.89 
 
 
420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02379  hydrogenase 4, subunit  33.61 
 
 
555 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1182  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  33.61 
 
 
555 aa  212  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02341  hypothetical protein  33.61 
 
 
555 aa  212  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1189  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  33.61 
 
 
555 aa  212  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.454918 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.8 
 
 
381 aa  211  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0795  NADH dehydrogenase (ubiquinone) 30 kDa subunit  34.37 
 
 
525 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0401  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  35.08 
 
 
375 aa  209  8e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.030434  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2621  hydrogenase-4, G subunit  33.33 
 
 
555 aa  209  8e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0473  NADH dehydrogenase (quinone)  34.81 
 
 
375 aa  209  9e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.330146  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1518  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  34.81 
 
 
375 aa  206  4e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.100115  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0434  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  34.81 
 
 
375 aa  203  3e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.706219  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  32.03 
 
 
367 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0306  NADH dehydrogenase (quinone)  33.98 
 
 
374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  31.48 
 
 
367 aa  199  6e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  31.77 
 
 
367 aa  196  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1631  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  31.52 
 
 
358 aa  195  8.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0202  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  32.68 
 
 
373 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  30.83 
 
 
422 aa  193  3e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>