More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0320 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0320  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
358 aa  702    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00131388  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0095  NADH dehydrogenase (quinone)  55.82 
 
 
378 aa  402  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4497  NADH dehydrogenase (quinone)  53.97 
 
 
385 aa  392  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9168  NADH dehydrogenase (quinone)  53.35 
 
 
398 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3440  NADH dehydrogenase  53.52 
 
 
392 aa  385  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.592652  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4721  NADH dehydrogenase (quinone)  55.03 
 
 
385 aa  382  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000278675 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4286  NADH dehydrogenase (quinone)  54.76 
 
 
388 aa  382  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.145773  normal  0.872647 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8417  NADH dehydrogenase (quinone)  50.4 
 
 
390 aa  363  3e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4997  NADH dehydrogenase subunit D  36.01 
 
 
366 aa  251  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3410  NADH dehydrogenase subunit D  37.4 
 
 
367 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5422  NADH dehydrogenase subunit D  36.01 
 
 
366 aa  250  3e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5473  NADH dehydrogenase subunit D  36.01 
 
 
366 aa  250  3e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5147  NADH dehydrogenase subunit D  35.73 
 
 
366 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4979  NADH dehydrogenase subunit D  35.73 
 
 
366 aa  248  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5388  NADH dehydrogenase subunit D  35.73 
 
 
366 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9747399999999995e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5539  NADH dehydrogenase subunit D  35.73 
 
 
366 aa  248  1e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5418  NADH dehydrogenase subunit D  35.73 
 
 
366 aa  247  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5532  NADH dehydrogenase subunit D  35.73 
 
 
366 aa  247  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00277354 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3298  NADH dehydrogenase subunit D  36.29 
 
 
366 aa  247  3e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3816  NADH dehydrogenase subunit D  34.9 
 
 
366 aa  242  6e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5095  NADH dehydrogenase subunit D  35.73 
 
 
366 aa  242  9e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.32 
 
 
404 aa  233  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.27 
 
 
390 aa  231  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0926  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, D subunit  35.36 
 
 
367 aa  229  5e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0810  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.08 
 
 
367 aa  229  6e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  36.21 
 
 
381 aa  228  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_797  NADH:quinone oxidoreductase 49 kD subunit 7  35.36 
 
 
367 aa  226  6e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.07 
 
 
401 aa  224  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.25 
 
 
390 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  33.15 
 
 
367 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.77 
 
 
390 aa  220  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.23 
 
 
389 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.16 
 
 
389 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  35.42 
 
 
390 aa  219  6e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0483  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.23 
 
 
426 aa  219  6e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0912  NADH dehydrogenase I, D subunit  37.34 
 
 
403 aa  219  7.999999999999999e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0980  NADH dehydrogenase subunit D  33.06 
 
 
371 aa  218  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3394  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  34.97 
 
 
394 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.397939  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1631  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  34.26 
 
 
358 aa  216  4e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  32.4 
 
 
366 aa  216  5e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3223  NADH dehydrogenase I, D subunit  34.03 
 
 
392 aa  215  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0966966  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01901  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  34.03 
 
 
395 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.468613  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02011  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  34.29 
 
 
395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0852756  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0184  NADH dehydrogenase subunit D  31.03 
 
 
408 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01921  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  34.03 
 
 
395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.132694  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0174  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  34.03 
 
 
395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0924  NADH dehydrogenase subunit D  34.11 
 
 
406 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0566  NADH dehydrogenase subunit D  33.16 
 
 
388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1614  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.93 
 
 
414 aa  214  1.9999999999999998e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3859  NADH dehydrogenase (quinone)  31.36 
 
 
420 aa  213  5.999999999999999e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.29 
 
 
417 aa  212  1e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0964  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  36.14 
 
 
400 aa  212  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0318919  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2155  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.82 
 
 
441 aa  210  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3198  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  32.29 
 
 
394 aa  209  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642861 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27241  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  33.59 
 
 
394 aa  209  5e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  33.07 
 
 
793 aa  209  5e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2992  NADH dehydrogenase (quinone)  33.79 
 
 
374 aa  209  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01901  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  34.11 
 
 
394 aa  209  7e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3020  ech hydrogenase subunit E  32.67 
 
 
359 aa  209  8e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1526  NADH dehydrogenase subunit D  31.61 
 
 
409 aa  209  8e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.013165  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2091  NADH dehydrogenase (quinone)  32.7 
 
 
374 aa  208  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1743  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  33.33 
 
 
394 aa  208  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.134879  normal  0.321495 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2036  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  32.81 
 
 
394 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4815  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  32.81 
 
 
394 aa  208  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2062  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  32.81 
 
 
394 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1052  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  34.07 
 
 
390 aa  208  1e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.718525  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.42 
 
 
400 aa  207  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02471  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  33.59 
 
 
394 aa  207  3e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1540  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  33.59 
 
 
394 aa  207  3e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2432  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  33.59 
 
 
394 aa  206  3e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0877111  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0352  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  32.73 
 
 
394 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1628  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.6 
 
 
369 aa  207  3e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.963572  normal  0.66391 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2112  NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit H  33.85 
 
 
394 aa  206  4e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.11577  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1025  NADH dehydrogenase subunit D  34.11 
 
 
396 aa  206  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0560  NADH dehydrogenase subunit D  33.07 
 
 
390 aa  206  5e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0847  NADH dehydrogenase (quinone)  34.86 
 
 
395 aa  206  6e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0637  NADH dehydrogenase I, 49 kDa subunit  35.05 
 
 
400 aa  205  1e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.447467  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3748  NADH dehydrogenase (quinone)  33.43 
 
 
370 aa  205  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000362019  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  32.38 
 
 
397 aa  204  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0542  NADH dehydrogenase subunit D  34.62 
 
 
446 aa  204  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.502265  normal  0.442373 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0746  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  35.31 
 
 
395 aa  204  2e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.946717 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0616  NADH dehydrogenase subunit D  31.51 
 
 
393 aa  204  2e-51  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0389154  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02414  hypothetical protein similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  31.58 
 
 
475 aa  203  3e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151267 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3889  NADH dehydrogenase  31.69 
 
 
394 aa  204  3e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0153  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  32.81 
 
 
791 aa  203  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0141  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.22 
 
 
408 aa  203  3e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0202  NADH dehydrogenase (ubiquinone)  33.61 
 
 
373 aa  203  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.656565 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0845  NADH dehydrogenase (quinone)  34.05 
 
 
400 aa  203  5e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.491402  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4630  NADH dehydrogenase I, D subunit  33.51 
 
 
402 aa  202  7e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.193494 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1826  NADH dehydrogenase subunit D  31.08 
 
 
412 aa  202  9e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.063533  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  33.07 
 
 
792 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2247  NADH dehydrogenase subunit D  32.73 
 
 
412 aa  202  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0299939  normal  0.120974 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2884  NADH dehydrogenase subunit D  31.7 
 
 
416 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736243  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3331  NADH dehydrogenase subunit D  32.11 
 
 
416 aa  202  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.150101  normal  0.101451 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1016  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.3 
 
 
396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1173  NADH dehydrogenase subunit D  34.2 
 
 
412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.313794  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1715  NADH dehydrogenase subunit D  32.22 
 
 
396 aa  200  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1870  NADH dehydrogenase (quinone)  34.78 
 
 
400 aa  200  3e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1211  NADH dehydrogenase I, D subunit  32.3 
 
 
396 aa  200  3e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1177  NADH dehydrogenase subunit D  33.07 
 
 
402 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.250747  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>