114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1317 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  100 
 
 		 179 aa  369  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1685  transposase, putative  57.58 
 
 		 184 aa  191  6e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.207714 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  56.63 
 
 		 178 aa  181  7e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  45.29 
 
 		 180 aa  174  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33360  hypothetical protein  53.66 
 
 		 176 aa  170  7.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1473  transposase, putative  48.33 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4081  hypothetical protein  51.5 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0580442  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2530  hypothetical protein  46.15 
 
 		 179 aa  163  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  50.3 
 
 		 176 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4226  hypothetical protein  47.43 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.853067  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  49.42 
 
 		 187 aa  162  3e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  48.77 
 
 		 164 aa  160  6e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2421  hypothetical protein  52.23 
 
 		 161 aa  159  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  49.7 
 
 		 163 aa  160  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1888  hypothetical protein  46.34 
 
 		 171 aa  159  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.17258  hitchhiker  0.00842787 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  45.78 
 
 		 184 aa  159  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  47.56 
 
 		 175 aa  159  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0768  hypothetical protein  47.73 
 
 		 175 aa  158  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  50.3 
 
 		 187 aa  157  8e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3405  hypothetical protein  50.3 
 
 		 179 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0242544  normal  0.205029 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  45.45 
 
 		 178 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3392  hypothetical protein  44.07 
 
 		 165 aa  153  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00223  hypothetical protein  44.07 
 
 		 165 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3379  conserved hypothetical protein  44.38 
 
 		 165 aa  153  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  42.44 
 
 		 191 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00227  hypothetical protein  44.07 
 
 		 165 aa  153  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0240  hypothetical protein  44.07 
 
 		 165 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3130  transposase and inactivated derivatives  48.82 
 
 		 178 aa  147  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0127624  normal  0.415202 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2890  hypothetical protein  43.79 
 
 		 191 aa  147  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  43.11 
 
 		 178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0731  hypothetical protein  45.51 
 
 		 176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0361  hypothetical protein  41.18 
 
 		 191 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2478  hypothetical protein  48.65 
 
 		 161 aa  138  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0796  hypothetical protein  44.52 
 
 		 159 aa  134  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  48.48 
 
 		 133 aa  134  8e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2532  hypothetical protein  37.04 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709096 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2244  transposase  38.06 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.196666  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0943  protein of unknown function DUF1568  28.26 
 
 		 163 aa  62  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.454082 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4707  hypothetical protein  29.41 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3465  hypothetical protein  30.37 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  26.35 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0885  protein of unknown function DUF1568  28.66 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3712  hypothetical protein  29.14 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013542 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1676  hypothetical protein  30.15 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4599  hypothetical protein  27.54 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2844  hypothetical protein  30.41 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3612  hypothetical protein  27.27 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0368765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3252  hypothetical protein  30.82 
 
 		 174 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0337  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  28.79 
 
 		 1345 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.038664  normal  0.920027 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0262  hypothetical protein  25.74 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5083  hypothetical protein  28.08 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.268045  normal  0.309651 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  27.21 
 
 		 150 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3976  protein of unknown function DUF1568  29.29 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.183049  normal  0.223747 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0284  hypothetical protein  26.16 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4597  hypothetical protein  31.72 
 
 		 151 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0971888 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0347  hypothetical protein  32.46 
 
 		 158 aa  52.4  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.119312  normal  0.0189577 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3321  hypothetical protein  26.82 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  hitchhiker  0.0000029094 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1574  hypothetical protein  29.58 
 
 		 150 aa  51.6  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2426  hypothetical protein  28.05 
 
 		 249 aa  51.2  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.763748  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2264  transposase and inactivated derivatives  22.07 
 
 		 323 aa  51.2  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.88974  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1024  hypothetical protein  27.21 
 
 		 163 aa  50.8  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0275616 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3919  hypothetical protein  27.81 
 
 		 151 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0968412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0613  hypothetical protein  29.33 
 
 		 151 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.018198 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2468  hypothetical protein  25.53 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.321631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0995  hypothetical protein  27.21 
 
 		 163 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  26.83 
 
 		 214 aa  50.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2265  transposase and inactivated derivatives  22.6 
 
 		 241 aa  50.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1136  hypothetical protein  22.7 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1552  hypothetical protein  26.25 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0339239 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4462  hypothetical protein  24.11 
 
 		 152 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1272  hypothetical protein  26.39 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0788  hypothetical protein  24.82 
 
 		 150 aa  49.7  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0311  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  26.52 
 
 		 1372 aa  49.3  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.220801 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3277  protein of unknown function DUF1568  27.94 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2777  hypothetical protein  30.28 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.430133  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5236  hypothetical protein  28.37 
 
 		 151 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  27.59 
 
 		 240 aa  47.8  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  24.83 
 
 		 234 aa  46.6  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1784  hypothetical protein  28.57 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2607  protein of unknown function DUF1568  26.86 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407993  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0181  hypothetical protein  23.75 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1092  hypothetical protein  26.8 
 
 		 223 aa  45.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.462205  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1975  hypothetical protein  25 
 
 		 163 aa  46.2  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121263 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1450  hypothetical protein  25.79 
 
 		 203 aa  45.8  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5176  hypothetical protein  27.21 
 
 		 184 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00299086  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1489  hypothetical protein  22.92 
 
 		 153 aa  45.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0554  hypothetical protein  26.67 
 
 		 177 aa  45.4  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2563  hypothetical protein  24.83 
 
 		 176 aa  45.1  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000213064  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5411  protein of unknown function DUF1568  24.03 
 
 		 218 aa  44.7  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000187281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5047  hypothetical protein  26.28 
 
 		 151 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0419469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1133  hypothetical protein  28.85 
 
 		 153 aa  44.3  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000547954  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  25 
 
 		 152 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1748  hypothetical protein  23.97 
 
 		 312 aa  43.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.994794  normal  0.0128416 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3926  hypothetical protein  22.82 
 
 		 322 aa  43.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0459  protein of unknown function DUF1568  26.14 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2065  hypothetical protein  26.14 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4223  hypothetical protein  27.87 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1453  hypothetical protein  25.16 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0489  hypothetical protein  22.79 
 
 		 310 aa  42.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448467 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3702  hypothetical protein  24.35 
 
 		 208 aa  42.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000809832 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>