78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2607 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2607  protein of unknown function DUF1568  100 
 
 		 186 aa  384  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.407993  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2830  hypothetical protein  59.15 
 
 		 77 aa  83.6  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.322225  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3477  hypothetical protein  30.81 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.379705  normal  0.40189 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0352  hypothetical protein  30.19 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.642542  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0885  protein of unknown function DUF1568  28.49 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2831  hypothetical protein  32.63 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.356286  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2531  transposase  28.3 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.719011  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0493  transposase  31.71 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0917  protein of unknown function DUF1568  28.12 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1512  hypothetical protein  32.06 
 
 		 222 aa  57  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.656335 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0487  transposase  31.25 
 
 		 222 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2563  hypothetical protein  26.35 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000213064  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0459  transposase  31.25 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0477  hypothetical protein  33.58 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3049  transposase and inactivated derivatives  26.06 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1802  protein of unknown function DUF1568  28.78 
 
 		 240 aa  53.9  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1701  hypothetical protein  31.5 
 
 		 174 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0397  protein of unknown function DUF1568  32.14 
 
 		 304 aa  53.5  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000164254  normal  0.853679 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1962  hypothetical protein  29.17 
 
 		 164 aa  52  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0721b  hypothetical protein  24.62 
 
 		 133 aa  51.6  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5382  hypothetical protein  29.6 
 
 		 223 aa  51.6  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal  0.588654 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2835  hypothetical protein  27.33 
 
 		 191 aa  51.2  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2474  protein of unknown function DUF1568  29.45 
 
 		 224 aa  51.2  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000403207  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1952  hypothetical protein  30.4 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0243  hypothetical protein  28.1 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.273479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1689  hypothetical protein  24.63 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.625848  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1484  hypothetical protein  25.74 
 
 		 231 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2478  hypothetical protein  24.81 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1855  hypothetical protein  29.57 
 
 		 175 aa  49.3  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2932  hypothetical protein  24.69 
 
 		 234 aa  49.7  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.56667  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0682  hypothetical protein  28.21 
 
 		 232 aa  48.9  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.349284  normal  0.584525 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1685  transposase, putative  28.8 
 
 		 184 aa  48.5  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.207714 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1036  hypothetical protein  31.82 
 
 		 222 aa  48.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1007  hypothetical protein  29.81 
 
 		 234 aa  47.8  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0450  transposase  24.65 
 
 		 141 aa  47.8  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3286  protein of unknown function DUF1568  28.95 
 
 		 214 aa  47.8  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00118326  unclonable  0.0000000135739 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1676  hypothetical protein  32.76 
 
 		 157 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3712  hypothetical protein  30.53 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013542 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1384  hypothetical protein  21.26 
 
 		 180 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.705846 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1620  hypothetical protein  28.1 
 
 		 313 aa  47.8  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4549  hypothetical protein  25.85 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.86188 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3871  protein of unknown function DUF1568  29.1 
 
 		 236 aa  47.4  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3122  transposase  28.97 
 
 		 231 aa  46.6  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.299801  normal  0.623865 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1317  protein of unknown function DUF1568  26.86 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.737296  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1364  hypothetical protein  26.28 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968684  normal  0.0104776 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4446  hypothetical protein  27.27 
 
 		 236 aa  46.2  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.885807  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1967  hypothetical protein  28.57 
 
 		 226 aa  46.2  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00827335  normal  0.496503 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3135  hypothetical protein  29.91 
 
 		 176 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.464073  normal  0.01424 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1096  transposase  32.58 
 
 		 222 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1473  transposase, putative  25.83 
 
 		 179 aa  45.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5411  protein of unknown function DUF1568  28.45 
 
 		 218 aa  45.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000187281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3353  protein of unknown function DUF1568  27.22 
 
 		 181 aa  45.1  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.231762 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4373  hypothetical protein  25.3 
 
 		 178 aa  45.1  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295832  normal  0.0449373 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2153  hypothetical protein  28.93 
 
 		 221 aa  44.7  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0207768  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0093  hypothetical protein  25.53 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150021  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2776  hypothetical protein  29.57 
 
 		 235 aa  44.3  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.721483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3037  protein of unknown function DUF1568  25 
 
 		 315 aa  44.3  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3295  hypothetical protein  26.45 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1813  protein of unknown function DUF1568  28.15 
 
 		 277 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00112655  hitchhiker  0.00000000103135 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0996  protein of unknown function DUF1568  25.81 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.976226  normal  0.164778 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1055  transposase  23.53 
 
 		 250 aa  43.5  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1151  protein of unknown function DUF1568  27.78 
 
 		 231 aa  43.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0164  transposase  24.26 
 
 		 287 aa  43.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0743928  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3368  transposase  23.4 
 
 		 171 aa  43.5  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.863098  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1554  protein of unknown function DUF1568  27.94 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.335003 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1556  protein of unknown function DUF1568  27.94 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444415 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4421  hypothetical protein  26.14 
 
 		 152 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1784  hypothetical protein  25 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1558  protein of unknown function DUF1568  29.03 
 
 		 230 aa  42.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.55731 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2396  hypothetical protein  30.25 
 
 		 220 aa  42.4  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4825  transposase and inactivated derivative  27.66 
 
 		 163 aa  42.4  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5559  hypothetical protein  29.6 
 
 		 236 aa  42  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2394  hypothetical protein  26.92 
 
 		 239 aa  42  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.419691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4223  hypothetical protein  27.4 
 
 		 212 aa  42  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.228925 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0768  hypothetical protein  29.46 
 
 		 175 aa  41.6  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0333217  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2421  hypothetical protein  23.66 
 
 		 161 aa  42  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2065  hypothetical protein  22.95 
 
 		 184 aa  41.6  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2793  transposase-like p;rotein  23.38 
 
 		 165 aa  41.2  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>